Europepmc

@pipeworx/europepmc

Europe PubMed Central MCP — 生物医学／ライフサイエンス文献の検索＋抄録＋全文（オープンアクセスのみ）。キー不要です。

Pipeworx の一部です。AI エージェントを 1879 以上の稼働中データソースに接続する MCP ゲートウェイです。これは独立した非公式の統合であり、上流プロバイダーとは提携関係になく、承認や公開も受けていません。

ツール

• search(query, page?, pageSize?) — Europe PMC の検索（Lucene 形式のクエリ）
• get_article(source, id) — ソース（MED、PMC、PPR、…）と id による単一論文のレコード
• abstract(source, id) — タイトル＋構造化抄録
• references(source, id, pageSize?) — 引用文献の一覧
• citations(source, id, pageSize?) — 引用している論文の一覧

データソース

https://www.ebi.ac.uk/europepmc/webservices/rest/

クイックスタート

MCP クライアント（Claude Desktop、Cursor、Windsurf など）に追加します。

{
  "mcpServers": {
    "europepmc": {
      "url": "https://gateway.pipeworx.io/europepmc/mcp"
    }
  }
}

このエンドポイントが実際に提供するもの

https://gateway.pipeworx.io/europepmc/mcp の tools/list は、上の表に記載されたツールに加えて、共通の Pipeworx メタツールである ask_pipeworx、discover_tools、search_within、remember／recall など、ゲートウェイ全体で使える一連のツールを返します。そのため、表示されるツール数はこの表より多くなります。現在、単一パックのエンドポイントには、そのパック独自のツールに加えて、共通ツールがおよそ 30 個表示されます。接続時の initialize レスポンスには正確な対象範囲が記載されており、その日の時点での確定情報となります。

これは意図的な仕様であり、偶然の多重化ではありません。メタツールを使うと、このパックの対象外の質問にも、カタログ全体から適切な情報を取得する ask_pipeworx を通じて回答できるため、MCP サーバーをもう 1 つ追加する必要がありません。現時点では、これらのメタツールなしでパックのエンドポイントをマウントする方法はありません。追加のスキーマによるコンテキスト消費がルーティングの利点を上回る場合は、複数のパックエンドポイントではなく、フルゲートウェイに一度だけ接続してください。

このパックのツールだけでなく、すべてのパックのツールを直接一覧表示するには、フル Pipeworx ゲートウェイに接続してください。

{
  "mcpServers": {
    "pipeworx": {
      "url": "https://gateway.pipeworx.io/mcp"
    }
  }
}

どちらの URL も同じゲートウェイと、同じ 1879 以上のデータソースに接続します。違いは、どのパックのツールが直接一覧表示されるかだけです。どちらからでも ask_pipeworx を使ってすべてのツールを利用できます。

MCP クライアントがない場合：HTTP 経由で呼び出す

curl -X POST https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/europepmc_search \
  -H 'Content-Type: application/json' \
  -d '{"query":"CRISPR AND gene editing"}'

最初の呼び出しにアカウントは必要ありません。任意のツールを確認するには、GET https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/europepmc_search を実行します。ツールを探すには、{"query":"..."} を指定して POST https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/search_packs を実行します。

スタンドアロン（ゲートウェイアカウント不要）

このパッケージは、ローカルの stdio MCP サーバーとしても実行できます。Pipeworx アカウントは不要で、ゲートウェイへの往復もありません。

{
  "mcpServers": {
    "europepmc": {
      "command": "npx",
      "args": ["-y", "@pipeworx/mcp-europepmc"]
    }
  }
}

または、起動を確認するために直接実行します。

npx -y @pipeworx/mcp-europepmc

stdin/stdout 経由で MCP を使用し、initialize／tools/list／tools/call に応答します。対象となるのはこのパックのツールのみで、上記のゲートウェイ接続で追加される共通メタツールは含まれません。データソースとツールは同じですが、ask_pipeworx によるルーティングはありません。

ask_pipeworx を使う

ツールを直接呼び出す代わりに、自然な英語で質問できます。これは上記のパックエンドポイントとフルゲートウェイの両方で利用できます。

ask_pipeworx({ question: "your question about Europepmc data" })

ゲートウェイが適切なツールを選び、引数を自動的に設定します。

詳細

• ドキュメントとガイド
• pipeworx.io

ライセンス

MIT