Guidetopharmacology について
Guidetopharmacologyは薬理学研究向けのMCPサーバーで、IUPHAR/BPSが専門家の知見に基づいて整理したリガンド、標的、相互作用データを提供します。利用にはGtoPdb APIキーが必要で、Pipeworx経由またはローカルのstdioで動作します。
主な機能
- 01薬物リガンドの名前検索
- 02タンパク質標的の名前検索
- 03標的に対するリガンド相互作用の取得
- 04リガンドの標的と結合親和性の確認
活用シーン
- 01候補薬に対応するGtoPdbリガンドの特定
- 02標的に対するアゴニストや阻害薬の特定
- 03薬物と標的の結合親和性の確認
MCP 対応
MCPクライアント向けに、リガンド、標的、相互作用を検索するツールを公開します。Pipeworx経由で接続するほか、このパックのツールだけを提供するローカルstdioサーバーとしても実行できます。
設定
リモートサーバーはインストール不要です。クライアントを選んで設定をコピーするか、ワンクリックで導入できます。
https://gateway.pipeworx.io/guidetopharmacology/mcpclaude mcp add --transport http pipeworx-io-guidetopharmacology https://gateway.pipeworx.io/guidetopharmacology/mcp{"mcpServers":{"pipeworx-io-guidetopharmacology":{"type":"http","url":"https://gateway.pipeworx.io/guidetopharmacology/mcp"}}}Cursor で開く{"servers":{"pipeworx-io-guidetopharmacology":{"type":"http","url":"https://gateway.pipeworx.io/guidetopharmacology/mcp"}}}VS Code で開く{"mcpServers":{"pipeworx-io-guidetopharmacology":{"type":"http","url":"https://gateway.pipeworx.io/guidetopharmacology/mcp"}}}{"mcpServers":{"pipeworx-io-guidetopharmacology":{"serverUrl":"https://gateway.pipeworx.io/guidetopharmacology/mcp"}}}コマンドはターミナルで実行し、JSON は各クライアントの MCP 設定に貼り付けて再起動します。認可が必要なサーバーは初回接続時にログインを求めます。
ツール
詳細
mcp-guidetopharmacology
IUPHAR/BPS Guide to PHARMACOLOGY(GtoPdb)MCP — API キーはご自身で用意してください。薬物ターゲット、リガンド、およびそれらの相互作用を専門家が厳選した薬理学データベースです。
Pipeworx の一部です。AI エージェントを1879以上のライブデータソースに接続するMCPゲートウェイです。これは独立した非公式の統合であり、上流プロバイダーとは提携、承認、公開のいずれもされていません。
ツール
| ツール | 説明 |
|---|---|
search_ligands | Guide to PHARMACOLOGY(IUPHAR/BPS)――専門家が厳選した薬理学データベース――を検索し、名前から薬物リガンドを探します。一致するリガンドについて、GtoPdb リガンド ID、種類(例:合成有機化合物、ペプチド、抗体、代謝物)、承認状況を返します。返されたリガンド ID を ligand_interactions で使用すると、作用するタンパク質ターゲットを検索できます。GtoPdb API キーが必要です。guidetopharmacology.org/login.jsp で無料登録し、ご自身のキーを _apiKey で渡してください。ChEMBL/DrugBank を補完します。 |
search_targets | Guide to PHARMACOLOGY(IUPHAR/BPS)――専門家が厳選した薬理学データベース――を検索し、名前からタンパク質ターゲットを探します。一致するターゲットについて、GtoPdb ターゲット ID、略称、種類(例:GPCR、CatalyticReceptor、Enzyme、Transporter)を返します。返されたターゲット ID を target_interactions で使用すると、結合するリガンドを検索できます。GtoPdb API キーが必要です。guidetopharmacology.org/login.jsp で無料登録し、ご自身のキーを _apiKey で渡してください。ChEMBL/DrugBank を補完します。 |
target_interactions | Guide to PHARMACOLOGY(IUPHAR/BPS)で、タンパク質ターゲットに対する定量的なリガンド相互作用を一覧表示します。GtoPdb ターゲット ID(search_targets から取得)を指定すると、そのターゲットに作用するリガンドと、相互作用の種類(Agonist/Antagonist/Inhibitor など)、作用、結合親和性(例:pKi/pIC50)を返します。GtoPdb API キーが必要です。guidetopharmacology.org/login.jsp で無料登録し、ご自身のキーを _apiKey で渡してください。 |
ligand_interactions | 薬物が作用するタンパク質を返します。Guide to PHARMACOLOGY(IUPHAR/BPS)におけるリガンドの厳選されたターゲット相互作用を、それぞれターゲットのタンパク質名、相互作用の種類(Agonist/Antagonist/Inhibitor)、作用、結合親和性(pKi/pIC50)とともに返します。薬物名(「imatinib」など)を渡すと自動で特定します。GtoPdb リガンド ID も使用できます。応答には実際に参照したリガンド名が必ず含まれるため、指定した ID が別の化合物を示していた場合も、気づかないままになることはありません。GtoPdb API キーが必要です。guidetopharmacology.org/login.jsp で無料登録し、ご自身のキーを _apiKey で渡してください。 |
クイックスタート
MCP クライアント(Claude Desktop、Cursor、Windsurf など)に追加します。
{
"mcpServers": {
"guidetopharmacology": {
"url": "https://gateway.pipeworx.io/guidetopharmacology/mcp"
}
}
}
このエンドポイントが実際に提供するもの
https://gateway.pipeworx.io/guidetopharmacology/mcp の tools/list は、上の表にあるツールに加えて、共有の Pipeworx メタツール(ask_pipeworx、discover_tools、search_within、remember/recall など、ゲートウェイ全体で利用できるツール群)も返します。そのため、表示されるツール数はこの表より多くなります。現在、単一パックのエンドポイントには、そのパック固有のツールとともに、共有ツールがおよそ30個表示されます。接続の initialize 応答に正確な範囲が記載されており、その日の状況を確認するための正式な情報源です。
これは意図した仕様であり、偶発的な多重化ではありません。メタツールを使うと、このパックの対象外の質問にも ask_pipeworx 経由でカタログ全体を横断して対応できます。そのため、2つ目の MCP サーバーを追加する必要はありません。現時点では、メタツールなしでパックのエンドポイントを接続する方法はありません。追加のスキーマによるコンテキスト消費がルーティングの利点を上回る場合は、複数のパックのエンドポイントではなく、フルゲートウェイに一度だけ接続してください。
また、フル Pipeworx ゲートウェイに接続すると、このパックだけでなく、すべてのパックのツールを直接一覧表示できます。
{
"mcpServers": {
"pipeworx": {
"url": "https://gateway.pipeworx.io/mcp"
}
}
}
どちらの URL も同じゲートウェイと同じ1879以上のデータソースに接続します。違いは、どのパックのツールが直接一覧表示されるかだけです。どちらからでも ask_pipeworx を使ってすべてのツールにアクセスできます。
MCP クライアントがない場合:HTTP 経由で呼び出す
このパックでは独自の API キー(_apiKey)を使用します。こちらでは API キーを用意していないため、API キーなしで実行できる curl コマンドはありません。任意のツールを確認するには、GET https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/search_ligands を実行してください。ツールを探すには、{"query":"..."} を指定して POST https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/search_packs を実行してください。
スタンドアロン(ゲートウェイアカウント不要)
このパッケージはローカルの stdio MCP サーバーとしても実行できます。Pipeworx アカウントもゲートウェイへのラウンドトリップも不要です。
{
"mcpServers": {
"guidetopharmacology": {
"command": "npx",
"args": ["-y", "@pipeworx/mcp-guidetopharmacology"]
}
}
}
または、直接実行して起動を確認してください。
npx -y @pipeworx/mcp-guidetopharmacology
stdin/stdout 経由で MCP を扱い、このパックのツールのみを対象に initialize/tools/list/tools/call に応答します。上記のゲートウェイ接続で追加される共有メタツールは含まれません。同じソース、同じツールで、ask_pipeworx によるルーティングはありません。
ask_pipeworx の使用
ツールを直接呼び出す代わりに、平易な英語で質問できます。これは上記のパックエンドポイントだけでなく、ゲートウェイ全体でも利用できます。
ask_pipeworx({ question: "your question about Guidetopharmacology data" })
ゲートウェイが適切なツールを選び、引数を自動的に設定します。
詳細情報
ライセンス
MIT
コメント
AI アプリケーションが外部のツールやデータソースに統一的な方法で接続するためのオープンなプロトコルです。クライアントはモデルとの対話を担い、MCP サーバーはツール・リソース・プロンプトテンプレートを提供します。標準メッセージでやり取りするため、1 つのサーバーを複数のクライアントで再利用できます。