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Guidetopharmacology

Guidetopharmacology

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Guidetopharmacology について

Guidetopharmacologyは薬理学研究向けのMCPサーバーで、IUPHAR/BPSが専門家の知見に基づいて整理したリガンド、標的、相互作用データを提供します。利用にはGtoPdb APIキーが必要で、Pipeworx経由またはローカルのstdioで動作します。

主な機能

  1. 01薬物リガンドの名前検索
  2. 02タンパク質標的の名前検索
  3. 03標的に対するリガンド相互作用の取得
  4. 04リガンドの標的と結合親和性の確認

活用シーン

  1. 01候補薬に対応するGtoPdbリガンドの特定
  2. 02標的に対するアゴニストや阻害薬の特定
  3. 03薬物と標的の結合親和性の確認

MCP 対応

MCPクライアント向けに、リガンド、標的、相互作用を検索するツールを公開します。Pipeworx経由で接続するほか、このパックのツールだけを提供するローカルstdioサーバーとしても実行できます。

設定

リモートサーバーはインストール不要です。クライアントを選んで設定をコピーするか、ワンクリックで導入できます。

エンドポイントhttps://gateway.pipeworx.io/guidetopharmacology/mcp
インストールコマンドをコピー
Claude CodeTerminal
Cursor.cursor/mcp.json
VS Code.vscode/mcp.json
Claude Desktopclaude_desktop_config.json
Windsurf~/.codeium/windsurf/mcp_config.json

コマンドはターミナルで実行し、JSON は各クライアントの MCP 設定に貼り付けて再起動します。認可が必要なサーバーは初回接続時にログインを求めます。

ツール

詳細

mcp-guidetopharmacology

IUPHAR/BPS Guide to PHARMACOLOGY(GtoPdb)MCP — API キーはご自身で用意してください。薬物ターゲット、リガンド、およびそれらの相互作用を専門家が厳選した薬理学データベースです。

Pipeworx の一部です。AI エージェントを1879以上のライブデータソースに接続するMCPゲートウェイです。これは独立した非公式の統合であり、上流プロバイダーとは提携、承認、公開のいずれもされていません。

ツール

ツール説明
search_ligandsGuide to PHARMACOLOGY(IUPHAR/BPS)――専門家が厳選した薬理学データベース――を検索し、名前から薬物リガンドを探します。一致するリガンドについて、GtoPdb リガンド ID、種類(例:合成有機化合物、ペプチド、抗体、代謝物)、承認状況を返します。返されたリガンド ID を ligand_interactions で使用すると、作用するタンパク質ターゲットを検索できます。GtoPdb API キーが必要です。guidetopharmacology.org/login.jsp で無料登録し、ご自身のキーを _apiKey で渡してください。ChEMBL/DrugBank を補完します。
search_targetsGuide to PHARMACOLOGY(IUPHAR/BPS)――専門家が厳選した薬理学データベース――を検索し、名前からタンパク質ターゲットを探します。一致するターゲットについて、GtoPdb ターゲット ID、略称、種類(例:GPCR、CatalyticReceptor、Enzyme、Transporter)を返します。返されたターゲット ID を target_interactions で使用すると、結合するリガンドを検索できます。GtoPdb API キーが必要です。guidetopharmacology.org/login.jsp で無料登録し、ご自身のキーを _apiKey で渡してください。ChEMBL/DrugBank を補完します。
target_interactionsGuide to PHARMACOLOGY(IUPHAR/BPS)で、タンパク質ターゲットに対する定量的なリガンド相互作用を一覧表示します。GtoPdb ターゲット ID(search_targets から取得)を指定すると、そのターゲットに作用するリガンドと、相互作用の種類(Agonist/Antagonist/Inhibitor など)、作用、結合親和性(例:pKi/pIC50)を返します。GtoPdb API キーが必要です。guidetopharmacology.org/login.jsp で無料登録し、ご自身のキーを _apiKey で渡してください。
ligand_interactions薬物が作用するタンパク質を返します。Guide to PHARMACOLOGY(IUPHAR/BPS)におけるリガンドの厳選されたターゲット相互作用を、それぞれターゲットのタンパク質名、相互作用の種類(Agonist/Antagonist/Inhibitor)、作用、結合親和性(pKi/pIC50)とともに返します。薬物名(「imatinib」など)を渡すと自動で特定します。GtoPdb リガンド ID も使用できます。応答には実際に参照したリガンド名が必ず含まれるため、指定した ID が別の化合物を示していた場合も、気づかないままになることはありません。GtoPdb API キーが必要です。guidetopharmacology.org/login.jsp で無料登録し、ご自身のキーを _apiKey で渡してください。

クイックスタート

MCP クライアント(Claude Desktop、Cursor、Windsurf など)に追加します。

{
  "mcpServers": {
    "guidetopharmacology": {
      "url": "https://gateway.pipeworx.io/guidetopharmacology/mcp"
    }
  }
}
このエンドポイントが実際に提供するもの

https://gateway.pipeworx.io/guidetopharmacology/mcp の tools/list は、上の表にあるツールに加えて、共有の Pipeworx メタツール(ask_pipeworx、discover_tools、search_within、remember/recall など、ゲートウェイ全体で利用できるツール群)も返します。そのため、表示されるツール数はこの表より多くなります。現在、単一パックのエンドポイントには、そのパック固有のツールとともに、共有ツールがおよそ30個表示されます。接続の initialize 応答に正確な範囲が記載されており、その日の状況を確認するための正式な情報源です。

これは意図した仕様であり、偶発的な多重化ではありません。メタツールを使うと、このパックの対象外の質問にも ask_pipeworx 経由でカタログ全体を横断して対応できます。そのため、2つ目の MCP サーバーを追加する必要はありません。現時点では、メタツールなしでパックのエンドポイントを接続する方法はありません。追加のスキーマによるコンテキスト消費がルーティングの利点を上回る場合は、複数のパックのエンドポイントではなく、フルゲートウェイに一度だけ接続してください。

また、フル Pipeworx ゲートウェイに接続すると、このパックだけでなく、すべてのパックのツールを直接一覧表示できます。

{
  "mcpServers": {
    "pipeworx": {
      "url": "https://gateway.pipeworx.io/mcp"
    }
  }
}

どちらの URL も同じゲートウェイと同じ1879以上のデータソースに接続します。違いは、どのパックのツールが直接一覧表示されるかだけです。どちらからでも ask_pipeworx を使ってすべてのツールにアクセスできます。

MCP クライアントがない場合:HTTP 経由で呼び出す

このパックでは独自の API キー(_apiKey)を使用します。こちらでは API キーを用意していないため、API キーなしで実行できる curl コマンドはありません。任意のツールを確認するには、GET https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/search_ligands を実行してください。ツールを探すには、{"query":"..."} を指定して POST https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/search_packs を実行してください。

スタンドアロン(ゲートウェイアカウント不要)

このパッケージはローカルの stdio MCP サーバーとしても実行できます。Pipeworx アカウントもゲートウェイへのラウンドトリップも不要です。

{
  "mcpServers": {
    "guidetopharmacology": {
      "command": "npx",
      "args": ["-y", "@pipeworx/mcp-guidetopharmacology"]
    }
  }
}

または、直接実行して起動を確認してください。

npx -y @pipeworx/mcp-guidetopharmacology

stdin/stdout 経由で MCP を扱い、このパックのツールのみを対象に initialize/tools/list/tools/call に応答します。上記のゲートウェイ接続で追加される共有メタツールは含まれません。同じソース、同じツールで、ask_pipeworx によるルーティングはありません。

ask_pipeworx の使用

ツールを直接呼び出す代わりに、平易な英語で質問できます。これは上記のパックエンドポイントだけでなく、ゲートウェイ全体でも利用できます。

ask_pipeworx({ question: "your question about Guidetopharmacology data" })

ゲートウェイが適切なツールを選び、引数を自動的に設定します。

詳細情報

ライセンス

MIT

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プロトコルの概要から最初のサーバーの導入まで、よくある疑問にまとめて答えます。

AI アプリケーションが外部のツールやデータソースに統一的な方法で接続するためのオープンなプロトコルです。クライアントはモデルとの対話を担い、MCP サーバーはツール・リソース・プロンプトテンプレートを提供します。標準メッセージでやり取りするため、1 つのサーバーを複数のクライアントで再利用できます。