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Mesh について

Meshは、NLMのMedical Subject Headings(MeSH)を検索・解決するMCPサーバーです。疾患、薬剤、概念の語を標準見出しに対応付け、PubMedの索引用に記述子の詳細を取得できます。

主な機能

  1. 01語句によるMeSH記述子検索
  2. 02IDによる記述子詳細の取得
  3. 03自由語を標準見出しに解決
  4. 04同義語、限定語、関連見出しの提示

活用シーン

  1. 01疾患や薬剤のMeSH見出しを探す
  2. 02PubMed検索用の標準語を選ぶ

MCP 対応

MCPクライアントにMeSH検索、記述子検索、用語解決のツールを公開します。stdioでローカル実行でき、共有メタツールを含むPipeworxゲートウェイ経由でも接続できます。

設定

リモートサーバーはインストール不要です。クライアントを選んで設定をコピーするか、ワンクリックで導入できます。

エンドポイントhttps://gateway.pipeworx.io/mesh/mcp
インストールコマンドをコピー
Claude CodeTerminal
Cursor.cursor/mcp.json
VS Code.vscode/mcp.json
Claude Desktopclaude_desktop_config.json
Windsurf~/.codeium/windsurf/mcp_config.json

コマンドはターミナルで実行し、JSON は各クライアントの MCP 設定に貼り付けて再起動します。認可が必要なサーバーは初回接続時にログインを求めます。

ツール

詳細

mcp-mesh

NLM MeSH(Medical Subject Headings)MCP。

Pipeworx の一部です。AI エージェントを1882以上のライブデータソースに接続する MCP ゲートウェイです。これは独立した非公式の連携であり、上流のプロバイダーとは提携、承認、公開のいずれもされていません。

ツール

ツール説明
search_descriptors疾患、薬剤、概念の用語(例:「diabetes」「aspirin」「myocardial infarction」)でNLM MeSH記述子を検索します。一致するMeSH記述子ID(Dxxxxxxx)を返します。これはPubMedのインデックス作成に使用される統制語彙の見出しです。自由テキストからMeSHを検索する主要な機能です。キーは不要です。
get_descriptorID(例:「D003920」=糖尿病)でMeSH記述子の詳細を取得します。優先ラベル、エントリーターム(MeSHがその記述子の下にインデックスする同義語)、使用可能な修飾語(「薬物療法」「疫学」などのサブヘディング)、関連する参照見出しが含まれます。キーは不要です。
resolve_term自由テキストの用語や日常的な同義語を、正規のMeSH記述子(複数の場合あり)に対応付けます。PubMedを検索する際に使用する優先見出しです。まず記述子との完全一致を試し、一致しない場合は部分一致に切り替えます(あいまい一致として表示)。キーは不要です。

クイックスタート

MCP クライアント(Claude Desktop、Cursor、Windsurf など)に追加します。

{
  "mcpServers": {
    "mesh": {
      "url": "https://gateway.pipeworx.io/mesh/mcp"
    }
  }
}
このエンドポイントが実際に提供するもの

https://gateway.pipeworx.io/mesh/mcp の tools/list は、上の表にあるツールに加えて、共有 Pipeworx メタツール(ask_pipeworx、discover_tools、search_within、remember/recall など、ゲートウェイ全体で利用できるツール一式)も返します。そのため、表示されるツール数はこの表より多くなります。現在、単一パックのエンドポイントには、パック固有のツールと並んで、およそ30個の共有ツールが一覧表示されます。接続時の initialize 応答に正確な対象範囲が記載されており、その日の状況を確認する際の正式な情報源となります。

これは意図的な仕様であり、誤って多重化されているわけではありません。メタツールを使うと、このパックでは対応していない質問にも、カタログ全体を対象にルーティングする ask_pipeworx を通じて回答できるため、MCP サーバーを追加する必要がありません。現時点では、メタツールなしでパックのエンドポイントを接続する方法はありません。追加のスキーマがもたらすコンテキストコストに対してルーティングの利点が見合わない場合は、複数のパックエンドポイントではなく、フルゲートウェイに一度だけ接続してください。

また、フル Pipeworx ゲートウェイに接続すると、このパックのツールだけでなく、すべてのパックのツールが直接一覧表示されます。

{
  "mcpServers": {
    "pipeworx": {
      "url": "https://gateway.pipeworx.io/mcp"
    }
  }
}

どちらのURLも同じゲートウェイと同じ1882以上のデータソースに接続します。違いは、どのパックのツールが直接一覧表示されるかだけです。どちらからでも ask_pipeworx を使ってすべてのツールにアクセスできます。

MCP クライアントがない場合は、HTTPで呼び出す

curl -X POST https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/search_descriptors \
  -H 'Content-Type: application/json' \
  -d '{"text":"diabetes"}'

最初の呼び出しにはアカウントは不要です。ツールを確認するには、GET https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/search_descriptors を実行します。ツールを探すには、{"query":"..."} を指定して POST https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/search_packs を実行します。

スタンドアロン(ゲートウェイアカウント不要)

このパッケージはローカルのstdio MCPサーバーとしても動作します。Pipeworxアカウントも、ゲートウェイへの往復通信も不要です。

{
  "mcpServers": {
    "mesh": {
      "command": "npx",
      "args": ["-y", "@pipeworx/mcp-mesh"]
    }
  }
}

または、起動することを確認するために直接実行します。

npx -y @pipeworx/mcp-mesh

stdin/stdoutを介してMCPで通信し、このパックのツールのみを対象に initialize/tools/list/tools/call に応答します。上記のゲートウェイ接続で追加される共有メタツールは含まれません。同じソース、同じツールで、ask_pipeworxによるルーティングはありません。

ask_pipeworx の使用

ツールを直接呼び出す代わりに、自然な英語で質問できます。この方法は、上記のパックエンドポイントでもフルゲートウェイでも利用できます。

ask_pipeworx({ question: "your question about Mesh data" })

ゲートウェイが適切なツールを選択し、引数を自動的に設定します。

詳細

ライセンス

MIT

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プロトコルの概要から最初のサーバーの導入まで、よくある疑問にまとめて答えます。

AI アプリケーションが外部のツールやデータソースに統一的な方法で接続するためのオープンなプロトコルです。クライアントはモデルとの対話を担い、MCP サーバーはツール・リソース・プロンプトテンプレートを提供します。標準メッセージでやり取りするため、1 つのサーバーを複数のクライアントで再利用できます。