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Mychem について

Mychemは、MyChem.infoで医薬品や化合物を検索し、集約アノテーションを取得するMCPサーバーです。ChEMBL、DrugBank、PubChemなどの構造化IDや相互参照を必要とするユーザー向けです。

主な機能

  1. 01名称またはIDによる検索
  2. 02集約された化合物アノテーションの取得
  3. 03データソース間の相互参照
  4. 04インデックスとソースのメタデータ表示

活用シーン

  1. 01医薬品名から識別子を特定
  2. 02化合物の薬理学的な参照情報を取得
  3. 03利用可能な注釈ソースとバージョンを確認

MCP 対応

MCPクライアントに `query`、`chem`、`metadata` ツールを公開します。ローカルのstdioまたはPipeworxゲートウェイ経由で動作します。

設定

リモートサーバーはインストール不要です。クライアントを選んで設定をコピーするか、ワンクリックで導入できます。

エンドポイントhttps://gateway.pipeworx.io/mychem/mcp
インストールコマンドをコピー
Claude CodeTerminal
Cursor.cursor/mcp.json
VS Code.vscode/mcp.json
Claude Desktopclaude_desktop_config.json
Windsurf~/.codeium/windsurf/mcp_config.json

コマンドはターミナルで実行し、JSON は各クライアントの MCP 設定に貼り付けて再起動します。認可が必要なサーバーは初回接続時にログインを求めます。

ツール

詳細

mcp-mychem

MyChem.info MCP。

Pipeworx の一部です。AI エージェントを 1683 以上のライブデータソースに接続する MCP ゲートウェイです。

ツール

ツール説明
queryMyChem.info で医薬品/化学物質を検索します。一般的な医薬品名(「aspirin」)、InChIKey、またはフィールド指定のクエリ(例:「chembl.pref_name:aspirin」、「drugbank.name:Acetylsalicylic acid」)を指定できます。ChEMBL、DrugBank、PubChem、ChEBI、DrugCentral などへの相互参照を含む、集約された検索結果を返します。医薬品名を構造化識別子に解決する際に使用します。
chemID を指定して、単一の化学物質/医薬品の集約済みアノテーション全体を取得します。通常、ID には InChIKey(例:「BSYNRYMUTXBXSQ-UHFFFAOYSA-N」)を指定しますが、DrugBank ID、ChEMBL ID、その他のソース ID も使用できます。作用機序、適応症、薬理学的な相互参照を含む、ChEMBL、DrugBank、PubChem、ChEBI、DrugCentral などの統合アノテーションを返します。
metadataMyChem.info のビルドメタデータを返します。インデックス済み化合物の総数、利用可能なアノテーションソース(ChEMBL、DrugBank、PubChem、ChEBI、DrugCentral、FDA NDC)、および各ソースの現在のリリースバージョンが含まれます。

クイックスタート

MCP クライアント(Claude Desktop、Cursor、Windsurf など)に追加します。

{
  "mcpServers": {
    "mychem": {
      "url": "https://gateway.pipeworx.io/mychem/mcp"
    }
  }
}
このエンドポイントが実際に提供するもの

https://gateway.pipeworx.io/mychem/mcp の tools/list は、上の表にあるツールに加えて、Pipeworx の共通メタツールである ask_pipeworx、discover_tools、search_within、remember/recall など、ゲートウェイ全体で利用できるツール一式も返します。そのため、表示されるツール数はこの表より多くなります。現在、単一パックのエンドポイントには、そのパック独自のツールに加えて、共通ツールがおよそ 30 個表示されます。接続時の initialize レスポンスに正確な範囲が記載されており、その日の状況を確認するうえで最も信頼できる情報です。

これは意図的な設計であり、誤って多重化されたものではありません。メタツールを使うと、このパックが対応していない質問にも ask_pipeworx でカタログ全体を検索して回答できるため、MCP サーバーをもう 1 つ追加する必要がありません。現時点では、メタツールなしでパックのエンドポイントをマウントする方法はありません。追加のスキーマによるコンテキスト消費がルーティングの利点を上回る場合は、複数のパックエンドポイントに接続するのではなく、フルゲートウェイに一度だけ接続してください。

このパックのツールだけでなく、すべてのパックのツールを直接一覧表示するには、Pipeworx のフルゲートウェイに接続してください。

{
  "mcpServers": {
    "pipeworx": {
      "url": "https://gateway.pipeworx.io/mcp"
    }
  }
}

どちらの URL も同じゲートウェイと同じ 1683 以上のデータソースに接続します。違いは、どのパックのツールが直接一覧表示されるかだけです。どちらからでも、ask_pipeworx を使ってすべてのツールにアクセスできます。

MCP クライアントがない場合:HTTP で呼び出す

curl -X POST https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/mychem_query \
  -H 'Content-Type: application/json' \
  -d '{"query":"aspirin"}'

最初の呼び出しではアカウントは不要です。ツールの詳細を確認するには GET https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/mychem_query を、ツールを探すには {"query":"..."} を指定して POST https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/search_packs を呼び出してください。

スタンドアロン(ゲートウェイアカウント不要)

このパッケージは、ローカルの stdio MCP サーバーとしても実行できます。Pipeworx アカウントもゲートウェイ経由の通信も不要です。

{
  "mcpServers": {
    "mychem": {
      "command": "npx",
      "args": ["-y", "@pipeworx/mcp-mychem"]
    }
  }
}

または、直接実行して起動することを確認できます。

npx -y @pipeworx/mcp-mychem

stdin/stdout 経由で MCP を使用し、initialize/tools/list/tools/call に応答します。対象はこのパックのツールのみで、上記のゲートウェイ接続で追加される共通メタツールはありません。ソースとツールは同じですが、ask_pipeworx によるルーティングはありません。

ask_pipeworx の使用

ツールを直接呼び出す代わりに、平易な英語で質問できます。この機能は、上記のパックエンドポイントでもフルゲートウェイでも使用できます。

ask_pipeworx({ question: "your question about Mychem data" })

ゲートウェイが適切なツールを選択し、引数を自動的に設定します。

詳細

ライセンス

MIT

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MCP は初めてですか?

プロトコルの概要から最初のサーバーの導入まで、よくある疑問にまとめて答えます。

AI アプリケーションが外部のツールやデータソースに統一的な方法で接続するためのオープンなプロトコルです。クライアントはモデルとの対話を担い、MCP サーバーはツール・リソース・プロンプトテンプレートを提供します。標準メッセージでやり取りするため、1 つのサーバーを複数のクライアントで再利用できます。