Mydisease

mcp-mydisease

MyDisease.info MCP。

Pipeworx の一部です。AI エージェントを1683以上の稼働中のデータソースに接続するMCPゲートウェイです。

ツール

ツール	説明
query	MyDisease.info を検索し、自由テキストの病名またはフィールド指定クエリで疾患を探します。一致した結果を返します。各結果にはMONDO疾患ID（例：「MONDO:0015967」）が付与され、最も一致するオントロジーキーとアノテーションキーが含まれます。「disease」ツールを呼び出す前に、このツールで病名を正式なオントロジーIDに解決してください。「diabetes」や「asthma」のような自由テキストも、「mondo.label:asthma」や「disgenet.xrefs.disease_name:...」のようなフィールド指定クエリも使用できます。
disease	単一の疾患IDについて、集約されたアノテーションオブジェクト全体を取得します。MONDO（「MONDO:0015967」）、DOID（「DOID:9351」）、OMIM（「OMIM:125853」）およびその他の対応するオントロジーIDを受け付けます。MONDOオントロジー（ラベル、同義語、外部参照、親／子）、DisGeNETの遺伝子と疾患の関連、HPOの表現型、CTDの化学物質と疾患の関係など、相互参照されたデータを返します。まず「query」ツールで名前をIDに解決してください。
metadata	MyDisease.infoのビルドメタデータを返します。疾患ドキュメントの総数、利用可能なアノテーションソース（MONDO、DOID、OMIM、DisGeNET、HPO、CTD）、および各ソースの現在のリリースバージョンが含まれます。

クイックスタート

MCP クライアント（Claude Desktop、Cursor、Windsurf など）に追加します。

{
  "mcpServers": {
    "mydisease": {
      "url": "https://gateway.pipeworx.io/mydisease/mcp"
    }
  }
}

このエンドポイントが実際に提供するもの

https://gateway.pipeworx.io/mydisease/mcp の tools/list は、上の表に記載されたツールに加えて、Pipeworx共通のメタツール（ask_pipeworx、discover_tools、search_within、remember／recall など、ゲートウェイ全体で使えるツール群）も返します。そのため、表示されるツール数はこの表より多くなります。現在、単一パックのエンドポイントには、そのパック独自のツールとともに、共通ツールが約30個表示されます。接続の initialize 応答に正確な範囲が記載されており、その日の時点での正式な情報となります。

これは意図的な仕様であり、偶然の多重化ではありません。メタツールを使えば、スコープを限定した接続でも、このパックの対象外の質問に答えられます。ask_pipeworx を通じてカタログ全体を横断して処理するため、MCP サーバーを追加する必要はありません。現時点では、メタツールなしでパックのエンドポイントをマウントする方法はありません。追加のスキーマによるコンテキスト消費がルーティングの利点を上回る場合は、複数のパックエンドポイントに接続するのではなく、フルゲートウェイに一度接続してください。

また、フルPipeworxゲートウェイに接続すると、このパックのツールだけでなく、すべてのパックのツールが直接一覧表示されます。

{
  "mcpServers": {
    "pipeworx": {
      "url": "https://gateway.pipeworx.io/mcp"
    }
  }
}

どちらのURLも同じゲートウェイと同じ1683以上のデータソースに接続します。異なるのは、どのパックのツールが直接一覧表示されるかだけです。ask_pipeworx を使えば、どちらからでもすべてのツールにアクセスできます。

MCP クライアントがない場合：HTTP経由で呼び出す

curl -X POST https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/mydisease_query \
  -H 'Content-Type: application/json' \
  -d '{"query":"diabetes"}'

最初の呼び出しにアカウントは必要ありません。ツールの詳細を確認するには、GET https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/mydisease_query を実行します。ツールを探すには、{"query":"..."} を指定して POST https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/search_packs を実行します。

スタンドアロン（ゲートウェイアカウント不要）

このパッケージは、ローカルのstdio MCP サーバーとしても実行できます。Pipeworxアカウントも、ゲートウェイを経由する通信も不要です。

{
  "mcpServers": {
    "mydisease": {
      "command": "npx",
      "args": ["-y", "@pipeworx/mcp-mydisease"]
    }
  }
}

または、直接実行して起動を確認します。

npx -y @pipeworx/mcp-mydisease

stdin/stdout経由でMCPを使用し、このパックのツールのみを対象に initialize／tools/list／tools/call に応答します。上記のゲートウェイ接続で追加される共通メタツールは含まれません。同じソース、同じツールで、ask_pipeworxによるルーティングはありません。

ask_pipeworx の使用

ツールを直接呼び出す代わりに、自然な英語で質問できます。この方法は、上記のパックエンドポイントとフルゲートウェイのどちらでも使えます。

ask_pipeworx({ question: "your question about Mydisease data" })

ゲートウェイが適切なツールを選び、引数を自動的に設定します。

詳細

• ドキュメントとガイド
• pipeworx.io

ライセンス

MIT