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Umls について

Umlsは、NLM UMLS Terminology Services APIをラップするMCPサーバーです。臨床用語の検索、概念情報、語彙コードの取得や相互マッピングに対応します。

主な機能

  1. 01用語やコードからUMLS概念を検索
  2. 02CUIによる概念詳細の取得
  3. 03出典語彙のコード一覧
  4. 04語彙間のコードマッピング

活用シーン

  1. 01臨床テキストをUMLS概念に対応付け
  2. 02概念の意味型を確認
  3. 03概念に対応する語彙コードの特定
  4. 04用語体系間でコードを変換

MCP 対応

UMLSの検索、概念、アトム、マッピング用ツールをMCPクライアントに提供します。利用にはユーザー自身のUMLS APIキーが必要で、Pipeworx経由または単独のstdioサーバーとして実行できます。

設定

リモートサーバーはインストール不要です。クライアントを選んで設定をコピーするか、ワンクリックで導入できます。

エンドポイントhttps://gateway.pipeworx.io/umls/mcp
インストールコマンドをコピー
Claude CodeTerminal
Cursor.cursor/mcp.json
VS Code.vscode/mcp.json
Claude Desktopclaude_desktop_config.json
Windsurf~/.codeium/windsurf/mcp_config.json

コマンドはターミナルで実行し、JSON は各クライアントの MCP 設定に貼り付けて再起動します。認可が必要なサーバーは初回接続時にログインを求めます。

ツール

詳細

mcp-umls

UMLS MCP — NLM UMLS Terminology Services REST API(uts-ws.nlm.nih.gov/rest)をラップします

Pipeworx の一部です — AI エージェントを1684以上のライブデータソースに接続するMCPゲートウェイです。

ツール

ツール説明
umls_search臨床用語/コードを検索し、UMLS概念(CUI)を取得します。フリーテキストまたはソースコードを、SNOMED CT、ICD-10、RxNorm、LOINC、MeSHなどにまたがるUMLS概念一意識別子にマッピングします。例:umls_search({ query: "myocardial infarction", _apiKey: "your-key" })
umls_conceptCUIの概念詳細を取得します。UMLS概念一意識別子の優先名称、意味タイプ、アトム数、関係数を返します。例:umls_concept({ cui: "C0027051", _apiKey: "your-key" })
umls_atoms概念のソースコード(ICD/SNOMED/RxNorm/LOINC)を取得します。CUIのソースが定義するアトム、つまり各語彙がその概念に使用する実際のコードと名称(クロスウォーク表)を一覧表示します。例:umls_atoms({ cui: "C0027051", _apiKey: "your-key" })
umls_crosswalkある語彙のコードをほかの語彙にクロスウォークします。ソース語彙のコード(例:ICD-10-CMコード)を指定すると、ほかの語彙(SNOMED CT、RxNorm、LOINCなど)で同じUMLS CUIを共有する概念を返します。例:umls_crosswalk({ source: "ICD10CM", code: "I21.9", _apiKey: "your-key" })

クイックスタート

MCP クライアント(Claude Desktop、Cursor、Windsurfなど)に追加します:

{
  "mcpServers": {
    "umls": {
      "url": "https://gateway.pipeworx.io/umls/mcp"
    }
  }
}
このエンドポイントが実際に提供するもの

https://gateway.pipeworx.io/umls/mcp の tools/list は、上の表にあるツールに加えて、共有Pipeworxメタツール(ask_pipeworx、discover_tools、search_within、remember/recallなど、ゲートウェイ全体で使えるツール群)も返します。そのため、表示されるツール数はこの表より多くなります。単一パックのエンドポイントには現在、パック固有のツールに加えて、共有ツールが約30個表示されます。接続の initialize 応答には正確な範囲が記載されており、その時点での公式な回答となります。

これは意図的な仕様であり、誤って多重化しているわけではありません。メタツールを使うと、このパックの対象外の質問にも、全カタログを横断してルーティングする ask_pipeworx を通じて回答できます。MCP サーバーをもう1つ追加する必要はありません。現時点では、これらを含めずにパックのエンドポイントをマウントする方法はありません。追加スキーマのコンテキストコストがルーティングの利点を上回る場合は、複数のパックエンドポイントに接続するのではなく、フルゲートウェイに一度だけ接続してください。

また、Pipeworxのフルゲートウェイに接続すると、このパックだけではなく、すべてのパックのツールが直接一覧表示されます:

{
  "mcpServers": {
    "pipeworx": {
      "url": "https://gateway.pipeworx.io/mcp"
    }
  }
}

どちらのURLも同じゲートウェイと同じ1684以上のデータソースに接続します。違いは、どのパックのツールが直接一覧表示されるかだけです。どちらからも、ask_pipeworx ですべてのツールにアクセスできます。

MCP クライアントがない場合:HTTP経由で呼び出す

このパックでは独自のAPIキー(_apiKey)が必要です。こちらでキーを用意していないため、キーなしで実行できるcurlコマンドはありません。ツールを確認するには、GET https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/umls_search を使います。ツールを見つけるには、POST https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/search_packs に {"query":"..."} を指定します。

スタンドアロン(ゲートウェイアカウント不要)

このパッケージはローカルのstdio MCP サーバーとしても実行できます。Pipeworxアカウントもゲートウェイへのラウンドトリップも不要です:

{
  "mcpServers": {
    "umls": {
      "command": "npx",
      "args": ["-y", "@pipeworx/mcp-umls"]
    }
  }
}

または、直接実行して起動を確認します:

npx -y @pipeworx/mcp-umls

stdin/stdout経由でMCPを使用し、このパックのツールのみを対象に initialize/tools/list/tools/call に応答します。上記のゲートウェイ接続で追加される共有メタツールは含まれません。同じソース、同じツールで、ask_pipeworxによるルーティングはありません。

ask_pipeworx の使用

ツールを直接呼び出す代わりに、自然な英語で質問できます。これは上記のパックエンドポイントとフルゲートウェイの両方で利用できます:

ask_pipeworx({ question: "your question about Umls data" })

ゲートウェイが適切なツールを選択し、引数を自動的に設定します。

詳細

ライセンス

MIT

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プロトコルの概要から最初のサーバーの導入まで、よくある疑問にまとめて答えます。

AI アプリケーションが外部のツールやデータソースに統一的な方法で接続するためのオープンなプロトコルです。クライアントはモデルとの対話を担い、MCP サーバーはツール・リソース・プロンプトテンプレートを提供します。標準メッセージでやり取りするため、1 つのサーバーを複数のクライアントで再利用できます。