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PrimeKG to Neo4j

PrimeKG to Neo4j

ローカル
github.com/dmigoヘルスケア581 週間前に更新

PrimeKG to Neo4j について

PrimeKG to Neo4j は、Precision Medicine Knowledge Graph を Neo4j に取り込み、生物医学データの探索と分析に使うプロジェクトです。生物医学グラフデータを扱うユーザー向けに、データ処理、データベースへの取り込み、クエリツールを備えます。

主な機能

  1. 01PrimeKG データの取得と処理
  2. 02データの Neo4j への取り込み
  3. 03クエリと分析ツールの提供

活用シーン

  1. 01Neo4j で生物医学的な関係を探索
  2. 02取り込んだ PrimeKG データを分析

MCP 対応

MCP サーバーとして記載されていますが、MCP クライアントに公開する機能は README に記載されていません。

設定

ローカルサーバーの設定はどのクライアントでも共通です。コピーしてクライアントの MCP 設定ファイルに貼り付けてください。

インストール方法は未掲載です

このサーバーのパッケージやリモートエンドポイントはまだ取得できていません。プロジェクトの README の手順に従ってください。

リポジトリ

ツール

ツール一覧はまだ取得されていません

ローカルサーバーのツールはマシン上で起動して初めて取得できます。メンテナーはまだツール一覧を提供していません。

詳細

PrimeKG から Neo4j へ

このプロジェクトは、データ分析と探索のために、Precision Medicine Knowledge Graph(PrimeKG)を Neo4j データベースにインポートします。

概要

PrimeKG は、20 の高品質な生物医学リソースを統合し、10 の主要な生物学的スケールにわたる 4 百万以上の関係性を通じて 17,080 の疾患を記述する、包括的な生物医学ナレッジグラフです。

このプロジェクトでは、以下を行います。

  1. PrimeKG データをダウンロードして処理します
  2. データを Neo4j グラフデータベースにインポートします
  3. データのクエリと分析に使用するツールを提供します

プロジェクト構成

primekg-mcp/
├── config/           # Configuration files
├── data/             # Data files (PrimeKG data will be stored here)
├── docs/             # Documentation
├── scripts/          # Utility scripts for data processing
├── src/              # Source code
│   ├── db/           # Database connection and queries
│   ├── etl/          # Data extraction, transformation, loading
│   └── utils/        # Utility functions
└── tests/            # Test files

セットアップ手順

(プロジェクトの進行に合わせてセットアップ手順を追加します)

使用方法

(プロジェクトの進行に合わせて使用方法を追加します)

ライセンス

(ライセンス情報を追加します)

コメント

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プロトコルの概要から最初のサーバーの導入まで、よくある疑問にまとめて答えます。

AI アプリケーションが外部のツールやデータソースに統一的な方法で接続するためのオープンなプロトコルです。クライアントはモデルとの対話を担い、MCP サーバーはツール・リソース・プロンプトテンプレートを提供します。標準メッセージでやり取りするため、1 つのサーバーを複数のクライアントで再利用できます。