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PubMed MCP

PubMed MCP

ローカル
github.com/grllデータ・分析12360 週間前に更新
リポジトリ

PubMed MCP について

PubMed MCPは、生物医学研究者向けのMCPサーバーです。Pythonのpubmedclientを使ってPubMed文献を検索し、記事を取得します。

主な機能

  1. 01PubMed文献の検索
  2. 02記事情報の取得

活用シーン

  1. 01生物医学文献の検索
  2. 02特定記事の情報取得

MCP 対応

MCPクライアントにPubMedの文献検索と記事取得機能を提供します。

#pubmed#mcp#biomedical#data-fetching

設定

ローカルサーバーの設定はどのクライアントでも共通です。コピーしてクライアントの MCP 設定ファイルに貼り付けてください。

mcp.json · 共通設定
{
  "mcpServers": {
    "pubmedmcp": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "pubmedmcp@latest"
      ],
      "env": {
        "UV_PRERELEASE": "<UV_PRERELEASE>",
        "UV_PYTHON": "<UV_PYTHON>"
      }
    }
  }
}
起動コマンドuvx pubmedmcp@latest
設定が必要な環境変数
UV_PRERELEASE
UV_PYTHON

ローカルサーバーにはマシン上の実行環境（Node.js 18 以上など）が必要です。設定ファイルの場所はクライアントごとに異なります。

パッケージ
pypipubmedmcp@latest

ツール

ツール一覧はまだ取得されていません

ローカルサーバーのツールはマシン上で起動して初めて取得できます。メンテナーはまだツール一覧を提供していません。

詳細

PubMed MCP

PubMed から記事を検索および取得できる MCP サーバーです。

PubMed は、MEDLINE、ライフサイエンス分野のジャーナル、オンラインブックに収録された 3,500 万件以上の生物医学文献の引用情報を収めたデータベースです。

この MCP サーバーは、検索および取得の操作を行うために pubmedclient Python パッケージを利用しています。

使用方法

claude_desktop_config.json ファイルに以下を追加してください:

{
    "mcpServers": {
        "pubmedmcp": {
            "command": "uvx",
            "args": ["pubmedmcp@latest"],
            "env": {
                "UV_PRERELEASE": "allow",
                "UV_PYTHON": "3.12"
            }
        }
    }
}

システムに uv がインストールされており、'uvx' が PATH で利用可能であることを確認してください（claude の PATH は、システムの PATH と同じでないことがあります）。 claude_desktop_config.json ファイルに PATH キーを追加することで、claude の PATH で uv が確実に利用可能になります。

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AI アプリケーションが外部のツールやデータソースに統一的な方法で接続するためのオープンなプロトコルです。クライアントはモデルとの対話を担い、MCP サーバーはツール・リソース・プロンプトテンプレートを提供します。標準メッセージでやり取りするため、1 つのサーバーを複数のクライアントで再利用できます。