aeon について
Aeon は、scikit-learn 互換 API を備えた Python の時系列機械学習ツールキットです。研究者や開発者向けに、分類・回帰・クラスタリングなどのアルゴリズムと、変換や距離計算、ベンチマーク機能を提供します。
主な機能
- 01時系列の分類と回帰
- 02クラスタリング、予測、異常検知
- 03セグメンテーションと類似検索
- 04特徴抽出と変換
- 05時系列距離メトリクス
- 06データセット読み込みとベンチマーク
活用シーン
- 01センサーデータの時系列分類
- 02時系列の将来値予測
- 03異常や変化点の検出
- 04特徴量抽出と時系列モデルの比較
インストール
コマンドをコピーしてターミナルで実行します。
npx skills add https:/ / github.com/ hkphysics/ scientific-agent-skills --skill aeonインストール後、Claude Code で/aeonを入力して読み込まれたか確認します。
同梱ファイル
SKILL.md と一緒にインストールされる参考資料やスクリプト。
references/anomaly_detection.mdclassification.mdclustering.mddatasets_benchmarking.mddistances.mdforecasting.mdnetworks.mdregression.mdsegmentation.mdsimilarity_search.mdtransformations.md詳細
Aeon 時系列機械学習
概要
Aeon は、時系列機械学習向けの scikit-learn 互換 Python ツールキットです(aeon-toolkit.org)。分類、回帰、クラスタリング、予測、異常検知、セグメンテーション、類似性検索、距離、変換、ベンチマーク、可視化にわたるアルゴリズムを、一貫した推定器 API で提供します。
バージョンに関する注意: サンプルは aeon 1.x を対象としています(安定版ドキュメント:v1.4.0、2026年3月)。v1.0 のリリースでは予測と変換が再構成されており、インポートパスは aeon 0.x/sktime 時代のコードとは異なります。
このスキルを使う場面
以下の場合にこのスキルを使用します。
- 時系列データを分類したり、時系列データから予測したりする
- 時系列の系列内で異常や変化点を検出する
- 類似した時系列パターンをクラスタリングする
- 将来の値を予測する
- 繰り返し現れるパターン(モチーフ)や通常とは異なる部分系列(ディスコード)を見つける
- 専用の距離指標を使って時系列を比較する
- 時系列データから特徴量を抽出する
インストール
Python 3.10 以上が必要です(3.11 以上を推奨)。再現性のため、1.x リリースを固定してください。
uv pip install "aeon>=1.4,<2"
ディープラーニング予測器/分類器やその他のオプションの推定器を使用する場合:
uv pip install "aeon[all_extras]>=1.4,<2"
zsh では extras を引用符で囲んでください:uv pip install "aeon[all_extras]>=1.4,<2"。
実験的モジュール
アップストリームでは forecasting、anomaly_detection、segmentation、similarity_search、visualisation を実験的な機能として扱っており、マイナーリリース間でインターフェースが変更される可能性があります。これらのタスクが必要でない限り、本番パイプラインでは安定したモジュール(classification、regression、clustering、distances、transformations)を優先してください。
主な機能
1. 時系列分類
時系列を定義済みのクラスに分類します。アルゴリズムの一覧については references/classification.md を参照してください。
クイックスタート:
from aeon.classification.convolution_based import RocketClassifier
from aeon.datasets import load_classification
# Load data
X_train, y_train = load_classification("GunPoint", split="train")
X_test, y_test = load_classification("GunPoint", split="test")
# Train classifier
clf = RocketClassifier(n_kernels=10000)
clf.fit(X_train, y_train)
accuracy = clf.score(X_test, y_test)
アルゴリズムの選択:
- 速度+性能:
MiniRocketClassifier、Arsenal - 最高の精度:
HIVECOTEV2、InceptionTimeClassifier - 解釈可能性:
ShapeletTransformClassifier、Catch22Classifier - 小規模データセット:DTW 距離を使う
KNeighborsTimeSeriesClassifier
2. 時系列回帰
時系列から連続値を予測します。アルゴリズムについては references/regression.md を参照してください。
クイックスタート:
from aeon.regression.convolution_based import RocketRegressor
from aeon.datasets import load_regression
X_train, y_train = load_regression("Covid3Month", split="train")
X_test, y_test = load_regression("Covid3Month", split="test")
reg = RocketRegressor()
reg.fit(X_train, y_train)
predictions = reg.predict(X_test)
3. 時系列クラスタリング
ラベルを使わずに、類似した時系列をグループ化します。手法については references/clustering.md を参照してください。
クイックスタート:
from aeon.clustering import TimeSeriesKMeans
clusterer = TimeSeriesKMeans(
n_clusters=3,
distance="dtw",
averaging_method="ba"
)
labels = clusterer.fit_predict(X_train)
centers = clusterer.cluster_centers_
4. 予測
時系列の将来の値を予測します(aeon 1.x では実験的モジュールです)。予測器については references/forecasting.md を参照してください。
クイックスタート:
import numpy as np
from aeon.forecasting import NaiveForecaster
from aeon.forecasting.stats import ARIMA
y_train = np.array([1.0, 2.0, 3.0, 4.0, 5.0, 6.0, 7.0, 8.0, 9.0, 10.0])
# Set horizon in the constructor; predict passes the series to forecast from
naive = NaiveForecaster(strategy="last", horizon=5)
naive.fit(y_train)
y_pred = naive.predict(y_train)
# ARIMA uses p/d/q (not order=); multi-step via iterative_forecast
arima = ARIMA(p=1, d=1, q=1)
arima.fit(y_train)
y_pred = arima.iterative_forecast(y_train, prediction_horizon=5)
5. 異常検知
通常とは異なるパターンや外れ値を特定します。検出器については references/anomaly_detection.md を参照してください。
クイックスタート:
from aeon.anomaly_detection import STOMP
detector = STOMP(window_size=50)
anomaly_scores = detector.fit_predict(y)
# Higher scores indicate anomalies
threshold = np.percentile(anomaly_scores, 95)
anomalies = anomaly_scores > threshold
6. セグメンテーション
変化点を使って時系列を領域に分割します。references/segmentation.md を参照してください。
クイックスタート:
from aeon.segmentation import ClaSPSegmenter
segmenter = ClaSPSegmenter()
change_points = segmenter.fit_predict(y)
7. 類似性検索
時系列内または時系列間で類似したパターンを見つけます。references/similarity_search.md を参照してください。
クイックスタート:
from aeon.similarity_search import StompMotif
# Find recurring patterns
motif_finder = StompMotif(window_size=50, k=3)
motifs = motif_finder.fit_predict(y)
特徴量抽出と変換
特徴量エンジニアリングのために時系列を変換します。references/transformations.md を参照してください。
ROCKET 特徴量:
from aeon.transformations.collection.convolution_based import RocketTransformer
rocket = RocketTransformer()
X_features = rocket.fit_transform(X_train)
# Use features with any sklearn classifier
from sklearn.ensemble import RandomForestClassifier
clf = RandomForestClassifier()
clf.fit(X_features, y_train)
統計的特徴量:
from aeon.transformations.collection.feature_based import Catch22
catch22 = Catch22()
X_features = catch22.fit_transform(X_train)
前処理:
from aeon.transformations.collection import MinMaxScaler, Normalizer
scaler = Normalizer() # Z-normalization
X_normalized = scaler.fit_transform(X_train)
距離指標
時系列専用の距離尺度です。全項目については references/distances.md を参照してください。
使用方法:
from aeon.distances import dtw_distance, dtw_pairwise_distance
# Single distance
distance = dtw_distance(x, y, window=0.1)
# Pairwise distances
distance_matrix = dtw_pairwise_distance(X_train)
# Use with classifiers
from aeon.classification.distance_based import KNeighborsTimeSeriesClassifier
clf = KNeighborsTimeSeriesClassifier(
n_neighbors=5,
distance="dtw",
distance_params={"window": 0.2}
)
利用可能な距離:
- 弾性距離:DTW、DDTW、WDTW、ERP、EDR、LCSS、TWE、MSM
- ロックステップ距離:ユークリッド距離、マンハッタン距離、ミンコフスキー距離
- 形状ベース:Shape DTW、SBD
ディープラーニングネットワーク
時系列向けのニューラルアーキテクチャです。references/networks.md を参照してください。
アーキテクチャ:
- 畳み込み:
FCNClassifier、ResNetClassifier、InceptionTimeClassifier - 再帰型:
RecurrentNetwork、TCNNetwork - オートエンコーダー:
AEFCNClusterer、AEResNetClusterer
使用方法:
from aeon.classification.deep_learning import InceptionTimeClassifier
clf = InceptionTimeClassifier(n_epochs=100, batch_size=32)
clf.fit(X_train, y_train)
predictions = clf.predict(X_test)
データセットとベンチマーク
標準的なベンチマークを読み込み、パフォーマンスを評価します。references/datasets_benchmarking.md を参照してください。
データセットの読み込み:
from aeon.datasets import load_classification, load_gunpoint, load_regression
# Classification (generic loader or dataset-specific helper)
X_train, y_train = load_classification("GunPoint", split="train")
X_train, y_train = load_gunpoint(split="train") # same UCR dataset
# Regression
X_train, y_train = load_regression("Covid3Month", split="train")
ベンチマーク:
from aeon.benchmarking import get_estimator_results
# Compare with published results
published = get_estimator_results("ROCKET", "GunPoint")
一般的なワークフロー
分類パイプライン
from aeon.transformations.collection import Normalizer
from aeon.classification.convolution_based import RocketClassifier
from sklearn.pipeline import Pipeline
pipeline = Pipeline([
('normalize', Normalizer()),
('classify', RocketClassifier())
])
pipeline.fit(X_train, y_train)
accuracy = pipeline.score(X_test, y_test)
特徴量抽出 + 従来型機械学習
from aeon.transformations.collection import RocketTransformer
from sklearn.ensemble import GradientBoostingClassifier
# Extract features
rocket = RocketTransformer()
X_train_features = rocket.fit_transform(X_train)
X_test_features = rocket.transform(X_test)
# Train traditional ML
clf = GradientBoostingClassifier()
clf.fit(X_train_features, y_train)
predictions = clf.predict(X_test_features)
可視化による異常検知
from aeon.anomaly_detection import STOMP
import matplotlib.pyplot as plt
detector = STOMP(window_size=50)
scores = detector.fit_predict(y)
plt.figure(figsize=(15, 5))
plt.subplot(2, 1, 1)
plt.plot(y, label='Time Series')
plt.subplot(2, 1, 2)
plt.plot(scores, label='Anomaly Scores', color='red')
plt.axhline(np.percentile(scores, 95), color='k', linestyle='--')
plt.show()
ベストプラクティス
データの準備
-
正規化:ほとんどのアルゴリズムは z 正規化の効果が得られます
from aeon.transformations.collection import Normalizer normalizer = Normalizer() X_train = normalizer.fit_transform(X_train) X_test = normalizer.transform(X_test) -
欠損値の処理:分析の前に補完します
from aeon.transformations.collection import SimpleImputer imputer = SimpleImputer(strategy='mean') X_train = imputer.fit_transform(X_train) -
データ形式の確認:コレクションは
(n_cases, n_channels, n_timepoints)、単一の系列は(n_channels, n_timepoints)を使用します(データ形式を参照)
モデルの選択
- シンプルな方法から始める:ディープラーニングの前に、ROCKET の派生手法から始めます
- 検証を行う:ハイパーパラメーターの調整用に、訓練データを分割します
- ベースラインと比較する:シンプルな手法(ユークリッド距離による 1-NN、Naive)と比較します
- リソースを考慮する:速度を重視するなら ROCKET、GPU が利用可能ならディープラーニングを使用します
アルゴリズム選択ガイド
迅速なプロトタイピング向け:
- 分類:
MiniRocketClassifier - 回帰:
MiniRocketRegressor - クラスタリング:ユークリッド距離を使う
TimeSeriesKMeans
最高精度を求める場合:
- 分類:
HIVECOTEV2、InceptionTimeClassifier - 回帰:
InceptionTimeRegressor - 予測:
AutoARIMA、AutoETS、TCNForecaster(ディープラーニングには[all_extras]が必要です)
解釈可能性を重視する場合:
- 分類:
ShapeletTransformClassifier、Catch22Classifier - 特徴量:
Catch22、TSFresh
小規模なデータセット向け:
- 距離ベース:DTW を使う
KNeighborsTimeSeriesClassifier - 避けるもの:ディープラーニング(大量のデータが必要です)
リファレンスドキュメント
詳細情報は references/ にあります。
classification.md- すべての分類アルゴリズムregression.md- 回帰手法clustering.md- クラスタリングアルゴリズムforecasting.md- 予測手法anomaly_detection.md- 異常検知手法segmentation.md- セグメンテーションアルゴリズムsimilarity_search.md- パターンマッチングとモチーフの検出transformations.md- 特徴量抽出と前処理distances.md- 時系列の距離指標networks.md- ディープラーニングアーキテクチャdatasets_benchmarking.md- データ読み込みと評価ツール