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Ginkgo Cloud Lab

概要

Ginkgo Cloud Lab（https://cloud.ginkgo.bio）では、Ginkgo Bioworks の自律型ラボインフラストラクチャにリモートアクセスできます。プロトコルは、ロボットアーム、磁気浮上式サンプル搬送、70 台以上の機器に対応する産業グレードのソフトウェアを備えたモジュール式ユニット、Reconfigurable Automation Carts（RAC）で実行されます。

このプラットフォームには EstiMate も含まれています。これは、人間の言葉で記述したプロトコルを受け付け、掲載されているプロトコル以外のカスタムワークフローについて、実現可能性の評価と価格を提示する AI エージェントです。

利用可能なプロトコル

1. 無細胞タンパク質発現の検証

再構成した E. coli CFPS を使用した、迅速な発現可否スクリーニングです。FASTA 配列（最大 1800 bp）を送信すると、発現確認、ベースラインの力価（mg/L）、初期純度、仮想ゲル画像を受け取れます。

• 価格： $39/サンプル | 所要日数： 5-10 日 | ステータス： 認定済み
• 詳細： references/cell-free-protein-expression-validation.md をご覧ください

2. 無細胞タンパク質発現の最適化

タンパク質ごとに最大 24 条件（ライセート、温度、シャペロン、ジスルフィド結合促進剤、補因子）を用いて、実験計画法（DoE）に基づく最適化を行います。発現が難しいタンパク質や膜タンパク質向けに設計されています。

• 価格： $199/サンプル | 所要日数： 6-11 日 | ステータス： 認定済み
• 詳細： references/cell-free-protein-expression-optimization.md をご覧ください

3. 蛍光ピクセルアートの生成

ピクセルアート画像（48x48～96x96 px、PNG/SVG）を、音響分注を使って最大 11 種類の E. coli 株による蛍光バクテリアアートに変換します。高解像度の UV 写真として納品されます。

• 価格： $25/プレート | 所要日数： 5-7 日 | ステータス： ベータ
• 詳細： references/fluorescent-pixel-art-generation.md をご覧ください

一般的な注文ワークフロー

1. https://cloud.ginkgo.bio/protocols でプロトコルを選択します
2. パラメーター（サンプル数／タンパク質数、反復数、プレート数）を設定します
3. 入力ファイル（タンパク質プロトコルの場合は FASTA、ピクセルアートの場合は PNG/SVG）をアップロードします
4. 追加要件があれば、Additional Details フィールドに入力します
5. 送信すると、実現可能性レポートと見積もり価格が届きます

上記にないプロトコルについては、EstiMate チャットでカスタムプロトコルを平易な言葉で説明すると、互換性の評価と価格を受け取れます。

認証

https://cloud.ginkgo.bio から Ginkgo Cloud Lab にアクセスしてください。アカウントの作成または所属機関を通じたアクセスが必要な場合があります。アクセスに関するお問い合わせは、[email protected] までご連絡ください。

主なインフラストラクチャ

• RAC（Reconfigurable Automation Carts）： 高精度アームと磁気浮上式搬送を備えたモジュール式ロボットユニット
• Catalyst Software： プロトコルのオーケストレーション、スケジューリング、パラメーター設定、リアルタイム監視
• 統合機器 70 台以上： サンプル調製、液体操作、分析測定、保管、インキュベーション
• Nebula： マサチューセッツ州ボストンにある、Ginkgo の自律型ラボ施設