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nature-data

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github.com/galaxy-dawnデータ・データベース5.9k267 回インストール1 週間前に更新
リポジトリ

nature-data について

Nature Data Availability Skillは、論文データとアクセス情報をもとに、Nature向けのデータ公開資料を整えます。声明の作成に加え、リポジトリ計画、データセット引用、FAIRチェック、不足情報の明示を行います。

主な機能

  1. 01根拠となるデータセットの棚卸し
  2. 02データアクセス経路の分類
  3. 03リポジトリと識別子の計画
  4. 04データ公開声明の作成
  5. 05引用とFAIRメタデータの確認

活用シーン

  1. 01データ公開声明の準備
  2. 02リポジトリ登録とデータセット引用の計画
  3. 03共有制限とメタデータ不足の監査

インストール

コマンドをコピーしてターミナルで実行します。

$npx skills add https://github.com/galaxy-dawn/claude-scholar --skill nature-data

インストール後、Claude Code で/nature-dataを入力して読み込まれたか確認します。

同梱ファイル

SKILL.md と一緒にインストールされる参考資料やスクリプト。

README.md
agents/
openai.yaml
references/
chinese-author-alignment.md
fair-metadata-checklist.md
policy-principles.md
repository-and-identifiers.md
source-basis.md
statement-patterns.md

詳細

Nature データ利用可能性スキル

このスキルを使うと、論文の裏付けデータを、透明性の高い Nature 投稿用データ利用可能性パッケージ(声明文、リポジトリ計画、データセットの引用、情報不足のフラグ)にまとめられます。

適用されるポリシーは、Springer Nature/Nature Portfolio のデータポリシーです。実装には、FAIR データの実践と DataCite 形式の引用メタデータを用います。

学術的な表現に限り、現在のクライアントのスキルホームにある、インストール済みの skills/ml-paper-writing/references/knowledge/paper-miner-writing-memory.md に、参考になる表現例が含まれている場合があります。 出典が明記されたデータ利用可能性に関する表現が含まれている場合に限って使用してください。ジャーナルのポリシーと著者が実際にデータを利用できる条件を優先します。メモリが存在しない、または関連性がない場合は、参照せずに続けてください。

中国語ユーザー向けの対応モード

ユーザーが中国語で記述する場合、中国語の論文メモを提供する場合、または「中文对应」、 「中英对照」、「数据可用性声明」、「数据获取声明」、「原始数据」、「数据存储库」、「受限数据」 を求める場合:

  • 中国語の入力はそのまま受け付けますが、ユーザーが中国語のみを明示的に希望しない限り、投稿にそのまま使える最終的な声明文は英語で作成してください。
  • 著者が対応しやすくなる場合は、未解決の判断事項について短い中国語の説明を添えてください。
  • 表現ではなく意図を翻訳してください。「可向通讯作者索取」のような中国語の表現は、制限と利用手続きが明記されていない限り、通常は Nature 形式の英語として曖昧です。
  • 中国語のリポジトリ/ステータスの説明は、以下の正確な出版用語に置き換えてください。 数据可用性声明 -> Data Availability;原始数据 -> raw data; 处理后数据 -> processed data;源数据 -> source data; 补充材料 -> Supplementary Information;受限数据 -> restricted data; 合理请求 -> reasonable request。理由と審査手順が示されている場合に限ります。
  • 中国語の用語、よくある中国語から英語への翻訳上の問題、二言語での聞き取り質問には、references/chinese-author-alignment.md を使用してください。

基本方針

  • データ利用可能性の声明は、論文の主張と、その検証、再現、再利用に必要な証拠を結び付けるものとして扱ってください。
  • DOI、登録番号、リポジトリ名、ライセンス、公開猶予期間、倫理審査の承認、アクセス委員会、データ利用条件を捏造しないでください。
  • 公開には、分野に特化したリポジトリを優先してください。適切なコミュニティリポジトリがない場合に限り、汎用リポジトリまたは機関リポジトリを使用してください。
  • 新たに生成したデータと、再利用した第三者のデータの両方について記述してください。
  • データを一般公開できない場合は、その理由、アクセスを管理する主体、申請の審査方法、公開可能なメタデータまたは代表的なデータを明記してください。
  • ジャーナルから利用可能性に関する項目をまとめるよう求められない限り、データ、コード、資料、プロトコルは分けてください。
  • このスキルは、データの利用可能性とメタデータに特化させてください。ユーザーから別途求められない限り、手法を書き直したり、統計を分析したり、論文の文章を推敲したりしないでください。
  • 特定の法的、倫理的、商業的、または第三者による制限がない限り、「請求に応じて提供」を不十分な表現として指摘してください。

ワークフロー

  1. 対象ジャーナルと論文の種類を特定します。ジャーナル固有の指示とこのスキルが相反する場合は、ジャーナルの指示に従います。
  2. 主な結果と補足結果を裏付けるために必要なすべてのデータセットを洗い出します。生成された生データ、処理済みデータ、図のソースデータ、二次データ、ソフトウェアの出力、モデル、表、画像、統計解析の基礎となるファイルが含まれます。
  3. 各データセットを次のアクセス方法のいずれかに分類します。 public repository、controlled access repository、within paper or supplement、 reused public source、third-party restricted、available on justified request、 またはnot applicable。
  4. 文面を作成する前に、リポジトリと識別子の方針を決めます。個人のウェブサイトや一時的なクラウドリンクより、DOI、アクセッション番号、Handle、ARK、または安定したリポジトリレコードを優先します。
  5. データセットと場所を明示的に対応づけて、データ利用可能性に関する声明を作成します。
  6. 結論を裏付ける公開データについて、正式なデータセット引用を追加します。
  7. 最終確定前に、FAIRとメタデータを監査します。
  8. そのまま貼り付けられる声明文と、著者による確認が必要な未確定項目を返します。

出力形式

ユーザーが別の形式を求めない限り、次の形式で返します。

Data Availability
[ready-to-paste statement]

Repository and citation actions
- [specific actions or "None"]

Missing information / risk flags
- [specific flags or "None"]

中文核对
- [用中文列出作者需要确认的字段或 "无"]

既存の声明を監査する場合は、まず重大な問題を示してから、改訂版を提示します。

関連ファイル

ファイル開く場合
references/policy-principles.mdNature/Springer Natureのデータ共有規則や例外的なケースの方針を確認する必要がある場合
references/chinese-author-alignment.mdユーザーが中国語で記述している場合、バイリンガルの文面が必要な場合、または中国語の利用可能性に関するメモが提供された場合
references/statement-patterns.mdすぐに調整して使えるデータ利用可能性に関する声明のパターンが必要な場合
references/repository-and-identifiers.mdリポジトリの選択、アクセッション、DOI、エンバーゴ、バージョン管理、データセット引用のガイダンスが必要な場合
references/fair-metadata-checklist.mdFAIRの確認、READMEのメタデータ、ファイル構成、ライセンス、来歴、DataCiteのフィールドが必要な場合
references/source-basis.md公式情報源に基づいて規則を説明する必要がある場合、または各規則の根拠となる情報源を確認する必要がある場合

情報源の優先順位

次の順に情報源を使用します。

  1. 対象ジャーナルの指示と投稿システムの要件。
  2. Nature Portfolio/Springer Natureのデータ、コード、資料、および報告に関する方針。
  3. リポジトリ固有の要件と分野コミュニティの基準。
  4. FAIR原則とDataCiteのメタデータ運用。

方針の詳細が変更されている可能性がある場合は、投稿に関する最終的な助言を行う前に、最新のジャーナルページを確認してください。

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