research-proposal

研究計画書ジェネレーター

Nature Reviews 風の学術的な執筆規範に沿って、博士課程出願用の質の高い研究計画書を作成します。

概要

このスキルでは、5 段階の構造化されたワークフローを通じて研究計画書を作成します。

1. 要件の確認 - 研究テーマ、分野、言語の希望を確認します
2. 文献の収集 - 複数の情報源から関連文献を収集します
3. アウトラインの作成 - ユーザーの承認を得るための構成案を作成します
4. 本文の執筆 - 承認された構成案に基づいて計画書の全文を作成します
5. 出力とレビュー - 品質チェックリストとともに Markdown ファイルを提出します

目標とする出力：博士課程出願用の 2,000～4,000 語（標準は約 3,000 語）。

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フェーズ 1：要件の確認

AskUserQuestion を使って、以下の情報を収集します。

必須情報

1. 研究テーマ／方向性

   • 中心となる研究課題や分野は何ですか？
   • 対象とする具体的な問題はありますか？

2. 学術分野

   • STEM（科学、技術、工学、数学）
   • 人文科学（歴史、哲学、文学、言語）
   • 社会科学（社会学、心理学、経済学、政治学）

3. 出力言語

   • 英語
   • 中文（中国語）

4. 目標とする語数

   • 標準：3,000 語
   • 範囲：2,000～4,000 語（人文科学では 10,000 語まで延長する場合があります）

任意情報

5. 志望先の機関

   • 大学／研究グループの名称
   • 関心のある特定の教員

6. 既存の資料

   • ユーザーの過去の研究や出版物
   • Zotero に収集済みの関連文献

質問例

Questions to ask the user:

1. "What is your research topic or direction? Please describe the core question or problem you want to investigate."

2. "Which academic domain does your research belong to?"
   - STEM (Science, Technology, Engineering, Mathematics)
   - Humanities (History, Philosophy, Literature)
   - Social Sciences (Sociology, Psychology, Economics)

3. "What language should the proposal be written in?"
   - English
   - 中文 (Chinese)

4. "Do you have a target word count? (Default: ~3,000 words)"

5. "Are you applying to specific institutions or working with particular faculty?"

6. "Have you uploaded relevant literature to your Zotero library that I should reference?"

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フェーズ 2：文献の収集

文献情報源の方針

┌─────────────────────────────────────────────────────────┐
│                    Literature Sources                    │
├─────────────────────────────────────────────────────────┤
│  General Info    →  WebSearch (trends, news, reviews)   │
│  Open Access     →  arXiv, PubMed (preprints, OA papers)│
│  Closed Access   →  Zotero MCP (user's uploaded papers) │
└─────────────────────────────────────────────────────────┘

WebSearch の使用

以下を検索します。

• 最近の総説論文とメタ分析
• 研究動向と新たなトピック
• 分野におけるブレークスルーに関するニュース
• 方法論の進展

検索例：

"{topic} systematic review 2024 2025"
"{topic} research trends future directions"
"{topic} methodology recent advances"

Zotero MCP の使用

重要：開始前に、関連するクローズドアクセスの文献を Zotero にアップロードするようユーザーに伝えてください。

ユーザーのライブラリを検索

# Search by topic keywords
Use: mcp__zotero__zotero_search_items
Parameters: query = "{research topic keywords}"

# Advanced search with filters
Use: mcp__zotero__zotero_advanced_search
Parameters: conditions based on author, title, year, tags

# Semantic search for related papers
Use: mcp__zotero__zotero_semantic_search
Parameters: query = "{research question}"

論文の内容を取得

# Get full text content
Use: mcp__zotero__zotero_get_item_fulltext
Parameters: item_key = "{item key from search}"

# Get user's annotations and highlights
Use: mcp__zotero__zotero_get_annotations
Parameters: item_key = "{item key}"

# Get user's notes
Use: mcp__zotero__zotero_get_notes
Parameters: item_key = "{item key}"

文献の整理

収集した文献を以下のカテゴリに整理します。

1. 背景／文脈 - 分野の基盤を確立した基礎論文
2. 現状 - 最近の進展と最先端の研究
3. 研究ギャップ - 限界や未解決の課題を示す論文
4. 方法論 - 採用または応用できる関連手法を扱った論文
5. 関連研究 - 比較対象となる隣接分野の研究

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フェーズ 3：アウトラインの作成

分野別の研究計画書の構成

分野ごとのガイダンスについて、参考ファイルを確認します。

• references/STRUCTURE_GUIDE.md - 各セクションの詳細なガイドライン
• references/DOMAIN_TEMPLATES.md - STEM と人文科学の相違点

標準アウトラインのテンプレート

# [Research Title]

## Abstract (150-300 words, 5-10%)
- Research problem summary
- Research questions/objectives
- Methodology overview
- Expected significance

## 1. Introduction (500-800 words, 15-20%)
### 1.1 Background and Context
### 1.2 Problem Statement
### 1.3 Research Questions/Objectives
### 1.4 Scope and Delimitations

## 2. Literature Review (500-1000 words, 20-25%)
### 2.1 Theoretical Framework
### 2.2 Current State of Research
### 2.3 Research Gap Analysis
### 2.4 Positioning of This Study

## 3. Methodology (500-800 words, 20-25%)
### 3.1 Research Design
### 3.2 Data Collection Methods
### 3.3 Data Analysis Approach
### 3.4 Validity and Limitations

## 4. Timeline (200-300 words, 5-10%)
### 4.1 Research Phases
### 4.2 Key Milestones
### 4.3 Gantt Chart (optional)

## 5. Significance and Expected Contributions (200-400 words, 10-15%)
### 5.1 Theoretical Contributions
### 5.2 Practical Implications
### 5.3 Broader Impact

## References (minimum 40 references)

注：付録のセクションは含めないでください。重要な内容はすべて本文に組み込んでください。

ユーザーの確認

最重要：アウトラインをユーザーに提示し、本文の作成に進む前に承認を待ってください。

Present the generated outline and ask:

"Here is the proposed outline for your research proposal:

[Display outline with section titles and estimated word counts]

Please review and let me know:
1. Is the overall structure acceptable?
2. Would you like to add, remove, or modify any sections?
3. Should any section receive more/less emphasis?

I will proceed with content generation once you approve the outline."

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フェーズ 4：本文の執筆

執筆スタイルのガイドライン

references/WRITING_STYLE_GUIDE.md を確認し、適用してください。

主要な原則

1. アカデミックな文体

   • フォーマルなトーンで、口語表現は避ける
   • 三人称を優先し、一人称複数（「私たち」）は限定的に使用する
   • 正確な専門用語を用いる

2. 散文ベースのライティングスタイル（重要）

   箇条書きによる列挙は避けてください。 学術提案書は、箇条書きや番号付き項目ではなく、流れのあるつながった散文として読まれるべきです。つなぎ表現と首尾一貫した段落を用いてアイデアを提示してください。

   避ける	代わりに使う
   目的を列挙する箇条書き	つなぎ表現を交えて目的を説明する統合された段落
   貢献を列挙する番号付きリスト	文脈の中で貢献を説明する叙述的な散文
   方法論の手順を示す表	研究デザインを流れるように記述する説明

   リストが適切な場合（使用は控えめに）：

   • 研究課題／目的（焦点を絞った2〜4項目のセットとして）
   • タイムラインのマイルストーン（表形式が明瞭さを助ける場合）
   • 正確な列挙が必要な技術仕様

   変換例：

   ❌ 悪い例（箇条書き）：

   The contributions include:
   - Novel segmentation algorithm
   - Multi-modal fusion framework
   - Clinical validation study
   

   ✓ 良い例（散文ベース）：

   This research is expected to advance the field through several interconnected
   contributions. First, the development of a novel segmentation algorithm will
   enable automated plaque detection with accuracy surpassing current methods.
   Building on this foundation, a multi-modal fusion framework will integrate
   complementary imaging data to capture plaque characteristics inaccessible to
   any single modality. Finally, rigorous clinical validation will establish
   the prognostic value of these computational biomarkers for predicting
   cardiovascular events.
   

3. ヘッジング表現（学術的な慎重さ）

   避ける	代わりに使う
   「証明する」	「実証することを目指す」
   「間違いなく」	「おそらく」、「可能性がある」
   「明らかである」	「証拠が示唆する」
   「証明する」	「示す」、「実証する」

4. 文例テンプレート

   背景の導入：

   • 「過去10年間で、[X]は……の重要な領域として浮上してきました。」
   • 「[X]における最近の進歩は、……の新たな可能性を開きました。」

   ギャップの特定：

   • 「しかしながら、[X]は依然として十分に理解されていません。」
   • 「これらの進歩にもかかわらず、……には依然として重大な課題が残っています。」
   • 「……の理解には重大なギャップが存在します。」

   目的の表明：

   • 「本研究は、……によって[X]に取り組むことを目指します。」
   • 「本研究の主な目的は、……することです。」
   • 「本提案は、……を調査することを試みます。」

   方法論の正当化：

   • 「先行研究を踏まえ、本研究は……することを提案します。」
   • 「このアプローチが選ばれたのは、……だからです。」
   • 「[方法]は、[X]を研究するうえでいくつかの利点を提供します……」

   期待される貢献：

   • 「本研究は、……を前進させる可能性を秘めています。」
   • 「その知見は、……に貢献する可能性があります。」
   • 「本研究は、……に関する洞察を提供できる可能性があります。」

5. つなぎ表現と接続詞

   • 追加：さらに、加えて、そのうえ、併せて
   • 対比：しかしながら、それでもなお、逆に、一方で
   • 因果：したがって、その結果、結果として、ゆえに
   • 強調：重要なことに、注目すべきことに、特に重要なのは
   • 順序：まず、続いて、最後に、これに続いて

6. 段落構成

   Topic Sentence → Supporting Evidence (with citations) → Synthesis/Implications
   

   • 1段落あたり4〜8文
   • 明確な論理の展開
   • 段落間の明示的なつなぎ

引用のフォーマット

分野に応じて：

• STEM：APAスタイル（著者、年）
• 人文科学：MLAまたはChicagoスタイル
• 社会科学：APAまたはChicagoスタイル

略語の初出時：「coronary CT angiography (CCTA)」

引用は本文に統合する：「Recent studies (Smith et al., 2023; Jones, 2024) have demonstrated...」

図の提案

重要：提案書全体の適切な箇所に図の提案を含めてください。図は読みやすさを大幅に高め、複雑なアイデアを視覚的に伝える申請者の能力を示します。

図の配置ガイドライン

以下の形式で図の提案を挿入してください：

> **[Figure 1 Suggestion]** *Title: Overview of the proposed research framework*
> Content: A flowchart or schematic diagram illustrating the three-phase research
> design, showing data flow from imaging modalities through AI processing to
> clinical outcomes. Include icons for CCTA/IVUS/OCT inputs, deep learning
> modules, and output predictions.
> Recommended style: Clean vector graphics with consistent color scheme.

セクション別の推奨図表タイプ

セクション	推奨する図表タイプ
序論	研究範囲と位置づけを示す概念図
文献レビュー	主要な進展の年表、既存手法の分類体系
研究方法	研究フレームワークのフローチャート、ネットワークアーキテクチャ図、データ処理パイプライン
研究スケジュール	研究段階とマイルストーンを示すガントチャート
意義	理論的・実践的貢献を示すインパクト図

図表の提案に関する原則

1. 戦略的な配置：3,000語の研究計画書には、3～5点の図表を提案します
2. 自己説明性：各図表は、キャプションを詳しく読まなくても重要な情報が伝わるようにします
3. 一貫したスタイル：統一されたビジュアル言語（色、フォント、アイコン）を推奨します
4. 専門的な品質：ツール（例：Adobe Illustrator、draw.io、生物医学分野向けのBioRender）を提案します
5. アクセシビリティ：色覚多様性に配慮した配色と十分なコントラストを推奨します

言語別の考慮事項

英語での出力

• 標準的な学術英語の慣例に従います
• イギリス英語またはアメリカ英語のいずれかに統一します
• 全体を通してフォーマルな文体を維持します

中国語での出力（中文）

• 規範的な学術中国語を使用します
• 適切にヘッジ表現を使用します：
  • 「本研究旨在探讨...」（「本研究将证明...」ではなく）
  • 「研究结果可能表明...」（「研究结果必定显示...」ではなく）
  • 「有望推进...」（「肯定会推进...」ではなく）
• フォーマルな学術文体を維持します
• 参考文献の形式はGB/T 7714に準拠します

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フェーズ5：出力とレビュー

ファイルの生成

研究計画書をMarkdownファイルとして生成します：

proposal_{topic_slug}_{YYYY-MM-DD}.md

ユーザーの作業ディレクトリ、または指定された場所に保存します。

品質チェックリスト

references/QUALITY_CHECKLIST.mdを読み、適用します。

以下を確認します：

構成

• 必須セクションがすべて含まれている
• 語数が指定された範囲内である
• セクション間の論理的な流れがある
• セクションの見出しが明確である

内容

• 研究課題が明確に示されている
• 文献レビューで具体的なギャップが特定されている
• 研究方法が研究課題に適している
• 研究スケジュールが現実的かつ詳細である
• 研究の意義が明確に説明されている

学術的な文体

• 全体を通してフォーマルな学術的文体である
• 適切なヘッジ表現が使用されている
• セクション間のつながりが滑らかである
• 口語表現やくだけた表現がない
• 文章形式の記述（箇条書きやリストは最小限）
• リストは真に必要な場合（例：研究課題、研究スケジュール）にのみ使用されている

図表

• 適切な箇所に3～5点の図表の提案が含まれている
• 図表の提案にタイトル、内容の説明、スタイルの推奨事項が含まれている
• 図表がセクション全体に分散している（特定の箇所に集中していない）
• 各図表に明確な伝達目的がある

引用

• すべての主張に参考文献が付されている
• 引用形式が統一されている
• 博士課程の研究計画書では参考文献が最低40件ある
• 最近の文献が含まれている（約60％が過去5年間のもの）
• 適切な場合、先駆的・基礎的な研究が引用されている
• さまざまな研究グループ・機関の文献がバランスよく含まれている

技術面

• 文法上の誤りがない
• 略語は初出時に定義されている
• 用語が統一されている
• Markdownの書式が適切である

形式変換の案内

ユーザーに形式変換の手順を提示します：

# Convert to Word document
pandoc proposal.md -o proposal.docx

# Convert to PDF (requires LaTeX)
pandoc proposal.md -o proposal.pdf

# Convert to PDF with custom styling
pandoc proposal.md -o proposal.pdf --template=academic.latex

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参考ファイル

このスキルでは、以下の参考資料を使用します：

ファイル	用途
references/STRUCTURE_GUIDE.md	セクションごとの詳細な執筆ガイド
references/DOMAIN_TEMPLATES.md	STEM分野と人文学分野の構成上の違い
references/WRITING_STYLE_GUIDE.md	Nature Reviewsの学術的な執筆スタイル
references/QUALITY_CHECKLIST.md	完全な品質確認チェックリスト
references/LITERATURE_WORKFLOW.md	文献収集ワークフローの詳細
assets/proposal_scaffold_en.md	英語テンプレートの骨組み
assets/proposal_scaffold_zh.md	中国語テンプレートの骨組み

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ワークフローの概要

┌──────────────────────────────────────────────────────────────────┐
│                    Research Proposal Generation                   │
├──────────────────────────────────────────────────────────────────┤
│                                                                  │
│  Phase 1: Requirements    [Interactive]                          │
│     │     └─ Topic, Domain, Language, Word Count                 │
│     ▼                                                            │
│  Phase 2: Literature      [Automatic]                            │
│     │     └─ WebSearch + Zotero MCP                              │
│     ▼                                                            │
│  Phase 3: Outline         [Interactive - User Approval Required] │
│     │     └─ Generate outline → User confirms → Proceed          │
│     ▼                                                            │
│  Phase 4: Content         [Automatic - One-shot Generation]      │
│     │     └─ Write all sections based on approved outline        │
│     ▼                                                            │
│  Phase 5: Output          [Delivery]                             │
│           └─ Markdown file + Quality checklist + Conversion tips │
│                                                                  │
└──────────────────────────────────────────────────────────────────┘

---

エラー処理

Zoteroに関連文献が見つからない場合

ユーザーのZoteroライブラリに関連論文がない場合：

1. 制約についてユーザーに伝えます
2. オープンアクセスの情報源を探すため、WebSearchをより積極的に活用します
3. 関連論文をアップロードしてから再試行するようユーザーに提案します

情報が不十分な場合

トピックが曖昧すぎる場合：

1. 具体的な側面について確認の質問をします
2. 研究範囲を絞るよう提案します
3. 適切に定義された研究課題の例を提示します

文字数の制約

内容が目標の分量を超える場合：

1. 重要なセクション（序論、方法論）を優先します
2. 文献レビューを要点に絞って簡潔にします
3. 拡張版を別ファイルとして提供します

---

注意事項

• このスキルは博士課程への出願に特化して設計されています
• デフォルトの出力は約3,000語です
• 内容の生成前に、必ずユーザーにアウトラインを確認します
• Nature Reviewsスタイルの学術的な執筆規範に従います
• 英語と中国語の両方の出力に対応します
• 包括的な文献レビューには最低40件の参考文献が必要です
• 適切な箇所に図の提案を含めます（図は3～5点を推奨）
• 出力に付録は含めません。すべての内容を本文のセクションにまとめます
• 箇条書きや番号付きリストよりも、流れるような文章を優先します