关于 ROBINS-I V2 MCP
ROBINS-I V2 MCP 是面向非随机队列研究特定结果的偏倚风险评估 MCP 服务。它以可追溯证据和确定性算法计算各领域及总体判断,并支持人工复核与导出 robvis 数据。
主要功能
- 01解析论文及补充材料
- 02将引文绑定到原文位置
- 03按算法计算领域与总体判断
- 04支持人工确认及有理由的覆盖
- 05导出 robvis CSV
适用场景
- 01评估目标试验模拟研究的偏倚风险
- 02复核引用是否能在论文中定位
- 03汇总多项评估并生成 robvis 数据
MCP 相关
作为 MCP 服务,它向客户端提供文档解析、结果设定、分领域评估、答案提交、报告渲染及 robvis 导出等工具。
配置
本地服务的配置在各客户端中通用,复制后粘贴到客户端的 MCP 配置文件即可。
工具
9收录的工具列表 · 更新于 2 周前
| 参数 | 类型 | 必填 | 说明 |
|---|---|---|---|
| detail | string | 否 | |
| spec_version | string | 否 |
详细介绍
robins-i-mcp
一个实现 ROBINS-I V2(非随机干预研究偏倚风险——随访/队列变体)的 MCP 服务,作为确定性、带来源记录的评估引擎。
它是 target-mcp 的同类工具;后者评估目标试验模拟研究对 TARGET 指南要求的报告是否完整。本工具则评估某一具体结果的偏倚风险。二者可用于同一篇论文,互为补充。
此来源为草稿。 riskofbias.info 将 2025 年 11 月 20 日发布的 ROBINS-I V2 标为仍处于草稿阶段,后续可能变更。每份报告都会在来源记录行注明这一点。请参阅
NOTICE和TRANSCRIPTION-NOTES.md。随访队列研究。“随访”和“队列”指的是同一结构属性——有明确的时间零点,且对个体进行前瞻性随访,以比较不同策略。因此应关注这一属性,而非设计标签。目标试验模拟是核心使用场景,且恰好属于这一意义上的队列研究;下方两个示例都是 TTE。不具备随访结构的设计不在适用范围内。目前尚未发布其他设计的变体。请注意,工具中的“变体 A/变体 B”指由 C4 选定的 Domain 1 两种形式,而非研究设计。
与询问模型有何不同
模型仅负责根据文本回答信号问题,其作用范围受到限制。它不能计算判断,也不能捏造证据。
1 parse_document PDF + supplement → SectionMap deterministic
2 cue detection where to look, per domain deterministic
3 answer signalling questions quotes copied from the bundle MODEL
4 evidence binding quotes → offsets, or REJECT deterministic
5 algorithms answers → domain → overall deterministic
6 report + render stamped artifact deterministic
7 human ratification P1, reviewer-prior answers, overrides
提交时会执行三项规则,这正是此服务的核心:
- 引文要么匹配成功,要么拒绝。 每条引文都会通过三级匹配流程(精确 → 放宽连字符 → 去除参考文献),与已摄入资料包中的字符偏移位置进行匹配,并记录最终采用的匹配方式,绝不会默默将宽松匹配等同于精确匹配。无法解析的引文会被拒绝,并附上最接近的实际文本。
- 缺失要经过检索,不能仅凭断言。
manuscript_absent答案必须注明检索线索;服务会执行检索并附上记录,包括术语、章节和命中数。仅以文字声称已检索过会被拒绝。 - 判断由系统计算。 没有任何工具接受作为输入的领域判断。六种领域算法和总体算法均以明确的边缘图表示,并依据已发表的流程图追溯。人工可以覆盖系统判断,但必须记录理由;报告会同时显示两个值。
两道关卡
P1 会阻止评估领域 1。 问题 1.1 询问是否控制了所有重要混杂因素,而“重要”的定义依据审阅者预先指定的列表,而非论文的协变量表。若未调用 set_prespecified_confounders,服务会拒绝评估领域 1,而不会悄悄用后者替代前者。你提出的列表只是候选列表:在人工接受前,它会进入核准队列。
C4 会选择领域 1 的问题集。 分析是否考虑方案偏离,决定采用变体 A(意向性治疗,仅考虑基线混杂)或变体 B(符合方案治疗,同时考虑基线和时变混杂),因此 specify_result 要求在开始时明确选择,且不提供默认值。应根据分析实际做了什么来判断,而不是依据作者为其估计目标使用的标签——在参考论文中,方案表写的是“符合方案效应”,而分析采用的却是意向性治疗。
安装
pip install robins-i-mcp
然后在 MCP 客户端中注册:
{ "mcpServers": { "robins-i": { "command": "robins-i-mcp" } } }
也可以不安装,直接运行:
uvx robins-i-mcp
也已收录于 MCP 注册表,名称为
com.blackswancausallabs/robins-i-mcp。
开发
python3 -m venv .venv && .venv/bin/python -m pip install -e ".[dev]"
.venv/bin/python -m pytest tests/ -q # 205 passed
.venv/bin/robins-i-mcp # stdio MCP server
工具
| 分组 | 工具 | |
|---|---|---|
| 规范 | get_spec | 可选的内省;detail='compact'|'full' |
| 导入 | parse_document | PDF/docx/文本 + 补充材料 → 哈希 + 线索调查 |
parse_pmcid | 从 Europe PMC 检索 | |
| 设置 | set_prespecified_confounders | P1,限定于审查范围,会阻止 domain 1 |
specify_result | A1–A3、B1–B3、C1–C3、D1 和 C4 | |
| 评估 | assess_result | domain=0 概览,domain=1..6 框架 |
submit_answers | 按 domain 提交;domain=0 时完成并生成结果 | |
| 渲染 | render_report | 重新渲染带印记的产物 |
| 审查 | export_robvis | 多次运行的记录 → 一个 robvis CSV |
框架按 domain 划分,绝不是一份扁平量表:在任何特定路径上,大多数信号问题都不会出现;domain 1 的两组问题是否存在,则取决于 C4。
请提供补充材料。 确定 C1–C4 的目标试验规范,以及 domain 1 和 4 所依据的分析细节,通常只会出现在附录中。没有补充材料时,如果答案其实只是在无人导入的文件里,这些问题就会显示为 NI。
多项研究:记录
一项包含 N 项研究的审查就是 N 次运行。每次评估都需要一个会话,而服务不会在会话之间保留状态。因此,每次运行都会生成一份小型、可移植的记录——它就是跨越边界的交付物:
session 1..N assess one result -> save submit_answers(domain=0)['record']
later export_robvis(records=[...]) -> one figure-ready CSV
记录是约 4 KB 的扁平 JSON,不依赖此代码库,因此任何后续 Agent 都可以使用。记录自带溯源信息——文档哈希、算法指纹、规范版本、批准状态——所以最终图表中的每一行都能追溯到文档;如果一组记录混用了不同的算法转录版本,导出时也会发出警告。
export_robvis 并非简单导出列数据。robvis 的 ROBINS-I 模板是 V1:包含七个 domain,且 V1 将参与者选择排在干预分类之前,而 V2 则调换了顺序。默认布局会把每项 V2 判断放入正确的 V1 位置;按位置直接导出会导致解析和绘图结果错误。发布前请阅读返回的 losses——robvis 会将每个单元格压缩为五色调色板中的首字母,因此合格的低风险在其中会被归为 Low,无论写入的字符串是什么。
请参阅 examples/review_from_records.py。
示例详解
.venv/bin/python examples/dickerman_2022.py out.html # library level
.venv/bin/python examples/jabagi_2026_server_run.py # server level
.venv/bin/python examples/review_from_records.py # across runs
- Dickerman 等,NEJM 2022 —— 美国退伍军人中 BNT162b2 与 mRNA-1273 的比较。结果为低风险,但对未控制混杂因素存在疑虑。41 个问题中有 24 个未进入评估。
- Jabagi 等,Lancet Reg Health Eur 2026 —— 孕妇接种 RSVpreF 与婴儿 RSV 住院的比较。结果为严重风险,其判定路径值得一读:domain 1 在 1.3 而非 1.1 处判定失败,因为分娩时孕周和出生体重都是在干预后才确定的,却仍被用于匹配。
论文并未收录在此仓库中——它们是已发表的文章,我们无权重新分发。请将你自己的副本放入 papers/,或将 ROBINS_MCP_PAPERS 指向存放这些文件的目录;示例会列出所需文件,如果文件缺失,则会显示相应提示并失败。
文档
docs/STATUS.md— 当前状态和交接信息。请先阅读此文件。docs/DECISIONS.md— 说明各项设计缘由,按时间从新到旧排列。docs/SESSION-NOTES-*.md— 每次会话的记录。TRANSCRIPTION-NOTES.md— 说明如何从栅格流程图获取算法、在已发表文档中发现的勘误,以及仍需外部验证的内容。
许可证
Apache-2.0(LICENSE)。本项目实现的 ROBINS-I V2 工具采用 CC BY-NC-ND 4.0 许可,且此处未转载其中任何内容——关于这为何重要以及实际限制是什么,请参阅 NOTICE。
评论
一个开放协议,规定了 AI 应用如何以统一方式连接外部工具与数据源。客户端负责与模型对话,MCP 服务负责提供工具、资源和提示模板,两者通过标准消息通信,同一个服务可以被不同客户端复用。