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Scispot MCP 服务

将 Claude 连接到你的 Scispot 实验室工作区——通过自然语言查询 Labsheet、管理 ELN 实验、协议、文档、存储位置、清单等。

描述

Scispot MCP 服务是一个远程 Model Context Protocol（MCP）服务，可将 Scispot 的实验室运营系统与 Claude 等 AI 助手集成。它提供 27 个工具，涵盖 Labsheet 数据管理、电子实验室笔记本（ELN）操作、库存／存储查询以及 Labflow 样本跟踪。该服务以 AWS Lambda 函数的形式运行，并通过带 PKCE 的 OAuth 2.0 进行身份验证。

功能

• Labsheet 管理 — 列出、搜索和筛选 Labsheet 行；查看架构；添加和更新数据；按文件夹整理。
• ELN 实验 — 列出、读取、创建实验并向实验中写入内容；关联 Labsheet 行以实现可追溯性。
• ELN 协议 — 列出、读取、创建协议，并向协议中写入结构化内容（文本、章节、文件、图像）；关联 Labsheet 行。
• ELN 文档 — 列出、读取、创建文档条目并向其中写入内容；关联 Labsheet 行。
• 存储与库存 — 浏览存储位置（冰箱、房间、柜子），并按 ID 或条形码获取清单（板、盒、架）。
• Labflow — 列出与 Labflow 关联、供下游分析使用的样本 UUID。
• Labspace — 查找所有可用的 Labspace，作为 ELN 导航的入口。

设置

Claude 网页应用（Anthropic MCP Directory）

在浏览器中使用 Claude（claude.ai）时，请按以下步骤操作；这些步骤不适用于 Claude Code。

1. 访问 Anthropic MCP Directory
2. 找到并连接 Scispot
3. 使用你的 Scispot API 密钥完成 OAuth 身份验证
4. 开始通过 Claude 与你的工作区交互

Claude Code（终端）

在终端中使用你的 Scispot API 密钥，将远程 MCP 服务注册到 Claude Code：

claude mcp add scispot https://mcp.scispot.io/ --transport http --header "Authorization: Bearer YOUR_SCISPOT_API_KEY"

将 YOUR_SCISPOT_API_KEY 替换为你的实际 API 密钥。如果系统提示，请重启 Claude Code 或重新加载 MCP 配置，以便加载新服务。

身份验证

此服务需要使用 PKCE（S256）的 OAuth 2.0 身份验证。在连接过程中：

• 系统会提示你提供 Scispot API 密钥作为客户端密钥
• API 密钥仅用作 Scispot API 请求的 Bearer 令牌
• 服务不会将任何凭据保存到永久存储中
• 授权码会在 5 分钟内过期

你需要拥有可访问 API 的有效 Scispot 账户。如需 API 密钥，请联系 Scispot 管理员。

示例

示例 1：浏览并查询 Labsheet 数据

用户提示词：“列出我工作区中的所有 Labsheet，然后查找‘Cell Lines’Labsheet 的架构，并搜索 Status 列等于‘Active’的行。”

执行过程：

• 服务调用 list_labsheets，返回所有可用的 Labsheet
• 服务调用 get_labsheet_schema，查询“Cell Lines”的列名称和类型
• 服务调用 search_labsheet_rows，并对 Status 列应用必需的筛选条件
• 返回匹配的行及所有列数据

示例 2：创建实验并撰写协议摘要

用户提示词：“在‘Protein Lab’Labspace 中创建一个名为‘Western Blot Optimization Round 3’的新实验，然后撰写我将使用的协议步骤摘要。”

执行过程：

• 服务调用 list_labspaces，确认“Protein Lab”存在并获取其位置
• 服务调用 create_experiment_stub，使用名称和位置创建实验
• 服务调用 write_to_experiment，以 HTML 内容形式追加协议摘要
• 返回确认信息和新实验的详情

示例 3：将 Labsheet 样本关联到协议并添加结构化内容

用户提示词：“查找 ‘Reagent Inventory’ Labsheet 中 Lot Number 为 ‘LOT-2025-001’ 的所有样本，将它们关联到 ‘QC Lab’ Labspace 中的 ‘Sample Preparation v2’ 协议，并在协议中添加一个记录关联样本的结构化部分。”

执行过程：

• 服务调用 search_labsheet_rows，查找 “Reagent Inventory” 中符合条件的行
• 服务调用 link_labsheet_to_protocol，在这些行与协议之间创建可追溯链接
• 服务调用 write_to_protocol，并使用 content_type='json' 和包含章节标题与文本描述的结构化元素数组
• 返回已关联行及协议内容已更新的确认信息

示例 4：浏览存储位置并获取清单

用户提示词：“显示我工作区中的所有存储位置，然后查找条形码为 ‘PLT-00142’ 的清单。”

执行过程：

• 服务调用 list_locations，返回所有根级存储位置（冰箱、房间、柜子）
• 服务调用 get_manifest 并传入条形码，获取板或容器的详细信息，包括所有孔位或槽位
• 返回包含样本位置的完整清单布局

示例 5：浏览 ELN 结构并阅读文档

用户提示词：“列出所有 Labspace，然后显示 ‘Genomics’ Labspace 中的协议，并阅读 ‘DNA Extraction SOP’ 协议的完整内容。”

执行过程：

• 服务调用 list_labspaces，查找可用的 Labspace
• 服务调用 list_protocols 并传入位置 “Genomics”，列出所有协议
• 服务按名称调用 get_protocol，获取完整协议内容
• 返回带格式的完整协议文本

可用工具

只读工具（16 个）

工具	说明
list_labsheets	列出工作区中的所有 Labsheet
get_labsheet_schema	获取 Labsheet 的列定义
search_labsheet_rows	搜索和筛选 Labsheet 行
get_labsheet_row	按 UUID 获取单行
list_labsheet_folders	列出文件夹或文件夹中的 Labsheet
list_labspaces	列出所有 ELN Labspace
list_experiments	列出某个位置中的实验
get_experiment	获取完整的实验内容
list_protocols	列出某个位置中的协议
get_protocol	获取完整的协议内容
list_documentations	列出某个位置中的文档条目
get_documentation	获取完整的文档内容
list_locations	列出根级存储位置
get_manifest	按 hrid、uuid 或条形码获取清单
list_labflow_samples	列出 Labflow 的样本 UUID
get_image_thumbnail	下载行的图片缩略图

写入工具（11 个）

工具	是否具有破坏性	说明
add_labsheet_rows	否	向 Labsheet 添加新行
update_labsheet_rows	是	覆盖现有行的值
create_experiment_stub	否	创建空实验
write_to_experiment	是	在实验中追加或前置内容
create_protocol_stub	否	创建空协议
write_to_protocol	是	将文本、结构化 JSON 或图片写入协议
create_documentation_stub	否	创建空文档条目
write_to_documentation	是	在文档中追加或前置内容
link_labsheet_to_experiment	否	将 Labsheet 行关联到实验
link_labsheet_to_protocol	否	将 Labsheet 行关联到协议
link_labsheet_to_documentation	否	将 Labsheet 行关联到文档

隐私政策

此 MCP 服务仅处理针对你的 Scispot 工作区执行所请求操作所需的数据。不会收集或存储对话数据。

如需了解完整的隐私信息，请参阅我们的隐私政策：https://www.scispot.com/legal/privacy-policy

Support

• Email: [email protected]
• API Documentation: https://docs.scispot.com/
• Website: https://www.scispot.com