Liana-MCP

Name: Liana-MCP
Author: scmcphub

本地服务

github.com/scmcphub科研与教育170 周前更新

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关于 Liana-MCP

Liana-MCP 通过 MCP 为 Liana 提供 scRNA-seq 自然语言分析接口，面向研究人员和 Agent 开发者，涵盖数据读写、细胞间通信分析与绘图。

主要功能

01读取和写入 scRNA-seq 数据
02分析细胞间通信
03创建圆形图和点图

适用场景

01通过自然语言请求分析 scRNA-seq 数据
02在 Agent 应用中调用 Liana 分析功能

MCP 相关

它向 MCP 客户端提供基于 Liana 的 scRNA-seq 数据处理、细胞间通信分析和绘图功能，可在本地或通过 HTTP 运行。

#liana-mcp #scrna-seq #cell-communication

配置

本地服务的配置在各客户端中通用，复制后粘贴到客户端的 MCP 配置文件即可。

暂未收录安装方式

我们还没有获取到这个服务的安装包或远程地址，请按项目 README 中的说明安装。

代码仓库

工具

还没有获取到工具列表

本地服务需要在你的电脑上运行后才能读取工具，维护者暂未提供工具列表。

详细介绍

Liana-MCP

通过 MCP 使用自然语言进行 scRNA-Seq 分析的 Liana 接口。

🪩 它能做什么？

IO 模块，例如读取和写入 scRNA-Seq 数据
细胞间通信方法
绘图模块，包括圆形图和点图

❓ 适用于哪些人？

任何想用自然语言进行 scRNA-Seq 分析的人！
想在自己的应用中调用 Liana 函数的 Agent 开发者

🌐 可以在哪里使用？

你可以在大多数支持 MCP 的 AI 客户端、插件或 Agent 框架中使用 Liana-mcp：

AI 客户端，例如 Cherry Studio
插件，例如 Cline
Agent 框架，例如 Agno

🎬 演示

演示如何在 AI 客户端 Cherry Studio 中使用 Liana-mcp，通过自然语言进行 scRNA-Seq 细胞簇分析。

https://github.com/user-attachments/assets/40fb5bd8-a166-4993-9979-3258ef6646a0

📚 文档

scmcphub 的完整文档请参阅 https://docs.scmcphub.org

🏎️ 快速开始

安装

从 PyPI 安装

pip install liana-mcp

运行以下命令进行测试

liana-mcp run

在本地运行 liana-mcp

请在 MCP 客户端中参考以下配置：

检查路径

$ which liana 
/home/test/bin/liana-mcp

"mcpServers": {
  "liana-mcp": {
    "command": "/home/test/bin/liana-mcp",
    "args": [
      "run"
    ]
  }
}

远程运行 liana-server

请在 MCP 客户端中参考以下配置：

在你的服务上运行

liana-mcp run --transport shttp --port 8000

然后在本地 AI 客户端中配置 MCP 客户端，如下所示：


"mcpServers": {
  "liana-mcp": {
    "url": "http://localhost:8000/mcp"
  }
}

🤝 贡献

如有任何问题，欢迎提交 issue 或联系我（[email protected]）。也欢迎为代码做出贡献！

引用

如果你在研究中使用 liana-mcp，请考虑引用以下文献：

Dimitrov D., Schäfer P.S.L, Farr E., Rodriguez Mier P., Lobentanzer S., Badia-i-Mompel P., Dugourd A., Tanevski J., Ramirez Flores R.O. and Saez-Rodriguez J. LIANA+ provides an all-in-one framework for cell–cell communication inference. Nat Cell Biol (2024). https://doi.org/10.1038/s41556-024-01469-w

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