MedAdapt Content Server

MedAdapt 内容服务

一款专为 Claude Desktop 打造的专业 Model Context Protocol（MCP）服务，可从 PubMed、NCBI Bookshelf 和用户提供的文档中获取并处理教育资源，从而增强 AI 辅助医学学习体验。

概述

MedAdapt 内容服务与 Claude Desktop 集成，提供用于搜索、检索和分析医学教育内容的工具。它搭建了 Claude 与医学知识来源之间的桥梁，让 AI 辅助学习体验更加丰富。

快速开始

# Clone the repository
git clone https://github.com/ryoureddy/medadapt-content-server.git
cd medadapt-content-server

# Install dependencies
pip install -r requirements.txt

# Run the server
python content_server.py

功能

• 内容搜索：搜索多个来源中的医学教育内容
• 资源检索：获取完整的文章、书籍章节和用户文档
• 主题概览：生成医学主题的综合概览
• 学习资源：根据主题和学生水平推荐合适的学习资源
• 学习计划：制定包含目标和资源的结构化学习计划
• 内容分析：提取医学资源中的要点、方法和研究发现
• 用户内容：导入并分析用户提供的文档

安装

标准安装

1. 克隆代码库：

git clone https://github.com/ryoureddy/medadapt-content-server.git
cd medadapt-content-server

2. 创建虚拟环境（可选，但推荐）：

python -m venv .venv
source .venv/bin/activate  # On Windows, use: .venv\Scripts\activate

3. 安装依赖项：

pip install -r requirements.txt

4. 配置（可选）：
   • 获取 NCBI API 密钥以提高速率限制：https://ncbiinsights.ncbi.nlm.nih.gov/2017/11/02/new-api-keys-for-the-e-utilities/
   • 根据 .env.example 创建 .env 文件

用法

运行服务

python content_server.py

与 Claude Desktop 集成

1. 打开 Claude Desktop
2. 前往“Settings → Model Context Protocol → Add Server”
3. 在 claude_desktop_config.json 文件中使用以下 JSON 进行配置，该文件位于：
   • macOS：~/Library/Application Support/Claude/claude_desktop_config.json
   • Windows：%APPDATA%\Claude\claude_desktop_config.json

{
  "mcpServers": {
    "medadapt": {
      "command": "/path/to/python",
      "args": [
        "/path/to/medadapt-content-server/content_server.py"
      ],
      "env": {
        "DB_PATH": "/path/to/medadapt-content-server/medadapt_content.db"
      }
    }
  }
}

将 /path/to/python 替换为实际的 Python 路径（例如 /opt/anaconda3/bin/python 或 C:\Python311\python.exe）。 将 /path/to/medadapt-content-server/ 替换为克隆的代码库的绝对路径。

重要：DB_PATH 环境变量可确保数据库文件使用绝对路径创建和访问，从而避免常见的文件访问错误。

填充初始主题映射

python populate_topics.py

测试

运行测试以验证一切正常：

python test_server.py

Claude 使用示例

场景 1：了解医学主题

向 Claude 提示：

I'd like to learn about the cardiac cycle. Can you provide a big picture overview and help me understand the key concepts?

场景 2：查找特定资源

向 Claude 提示：

I need to find recent research articles about COVID-19 treatment options. Can you help me find relevant resources?

场景 3：制定学习计划

向 Claude 提示：

I'm a second-year medical student studying neurology. Can you create a learning plan for understanding stroke pathophysiology?

可用工具

该服务为 Claude 提供以下工具：

• search_medical_content：使用筛选条件搜索医学内容
• get_resource_content：检索特定资源的完整内容
• get_topic_overview：生成医学主题的综合概览
• suggest_learning_resources：获取个性化资源推荐
• import_user_document：上传用户提供的学习材料
• generate_learning_plan：制定包含目标的结构化学习计划
• extract_article_key_points：提取医学文章中的关键发现

故障排除

常见问题和解决方案

1. 数据库连接错误

   • 症状：sqlite3.OperationalError: unable to open database file
   • 解决方案：确保在 Claude Desktop 配置中正确设置了 DB_PATH 环境变量，并将其指向应用具有写入权限的绝对路径。

2. 文件路径错误

   • 症状：出现 No such file or directory 错误
   • 解决方案：确保 Claude Desktop 配置中的所有路径都是绝对路径，且不含多余的引号或转义字符。

3. API 速率限制

   • 症状：PubMed 或 NCBI Bookshelf 的响应缓慢或失败
   • 解决方案：获取 NCBI API 密钥并将其添加到 .env 文件中

4. Claude Desktop 连接

   • 症状：Claude 无法连接到 MCP 服务
   • 解决方案：确认服务正在终端窗口中运行，并且已在 Claude Desktop 中正确配置

项目结构

medadapt-content-server/
│
├── content_server.py     # Main MCP server implementation
├── database.py          # SQLite database interface
├── pubmed_utils.py      # PubMed API utilities
├── bookshelf_utils.py   # NCBI Bookshelf utilities
├── populate_topics.py   # Script to populate initial topic data
├── test_server.py       # Test script
├── requirements.txt     # Python dependencies
├── .env.example         # Example environment variables
└── README.md            # Documentation

许可证

本项目采用 MIT 许可证授权，详情请参阅 LICENSE 文件。

致谢

• 感谢 NCBI 提供 PubMed 和 Bookshelf API 的访问权限
• 感谢 Anthropic 提供 Claude 和 MCP 集成功能