Nullary - Negative Results Intelligence For Drug Discovery

Nullary MCP 服务

药物发现中的阴性结果情报——通过 Model Context Protocol 提供。

Nullary 是托管式 MCP 服务，可让 AI Agent 查询药物发现中的实测阴性结果：无活性的化合物、失败的选择性面板、终止的临床试验、失败的 CRISPR 筛选、抗体可开发性失败等；每条结果都附有完整出处（来源数据库、DOI/PMID、许可证）。

本仓库介绍公开的 MCP 接口。该服务由托管方提供；数据管道和应用代码由独立团队维护。

连接

Nullary 是远程 MCP 服务（streamable-HTTP）——无需安装，也无需 API 密钥：

https://mcp.nullary.ai/mcp

Claude Code / 通用 MCP 客户端

{
  "mcpServers": {
    "nullary": {
      "url": "https://mcp.nullary.ai/mcp"
    }
  }
}

Cursor

Settings → MCP → Add new MCP server → 粘贴上方 URL（传输方式：streamable-HTTP）。

Claude Desktop

Settings → Connectors → Add custom connector → URL https://mcp.nullary.ai/mcp。

可以询问什么

• “EGFR 有哪些失败案例？” —— 跨不同作用方式查询针对某个靶点的失败化合物、试验和筛选
• “哪些激酶抑制剂在 ChEMBL 中无活性？”
• “列出已终止的肿瘤学 II 期临床试验及其终止原因”
• “TP53 的 CRISPR 敲除失败案例”

工具按作用方式分类（小分子、CRISPR、抗体、肽、PROTAC、临床试验等）；每条回复都会注明来源。

工具

该服务通过 MCP tools/list 方法实时提供 35 个工具。完整的 JSON 架构（每个工具的输入）见 tools.json。这些工具涵盖七种模态，以及跨模态历史记录、化合物与来源的复合查询，还有第 1 层模型注册表。

工具	描述
search_inactive_compounds	无活性的小分子化合物-靶点配对。
search_failed_selectivity	选择性不佳的小分子。
search_admet_failures	小分子 ADMET 失败案例。
search_failed_guides	失败/无效的 CRISPR 引导序列。
search_failed_essentiality_screens	非依赖性/失败的必需性筛选。
search_ancestry_specific_failures	特定祖源人群中的 CRISPR 失败案例。
search_developability_failures	抗体成药性失败案例。
search_failed_clinical_antibodies	已停用/终止的临床抗体。
search_failed_peptide_therapeutics	失败的肽类疗法。
search_peptide_stability_issues	肽稳定性/半衰期失败案例。
search_failed_protacs	降解/三元复合物形成/渗透性方面失败的 PROTAC。
search_protac_e3_issues	PROTAC E3 连接酶募集/三元复合物形成失败案例。
search_failed_oligonucleotides	靶标结合/成药性方面失败的 ASO/siRNA。
search_oligo_delivery_failures	寡核苷酸递送失败案例。
search_failed_vaccines	失败/终止的疫苗（按病原体/适应症筛选）。
search_vaccine_immunogenicity_failures	失败的疫苗免疫原设计。
search_failed_adcs	任一阶段失败的 ADC。
search_adc_linker_failures	归因于连接子化学的 ADC 失败案例。
search_failed_bispecifics	任一阶段失败的双特异性抗体。
search_bispecific_format_failures	双特异性抗体格式/工程设计失败案例。
search_admet_failures_all_modalities	所有模态中的 ADMET 失败案例。
search_drug_drug_interaction_failures	药物相互作用失败案例。
search_mechanism_failures	针对某种机制失败的方法（按靶点筛选）。
search_failed_replications	未能复现的研究发现。
search_safety_failures	各模态中的临床/临床前安全性失败案例。
search_target_history	针对某一靶点、涵盖所有模态的全部失败方法。
search_indication_history	针对某一适应症、涵盖所有模态的全部失败方法。
search_pathogen_history	针对某一病原体的疫苗 + 抗微生物药物 + 抗体失败案例。
get_compound	化合物及其跨模态/来源的完整负面概况。
get_finding_provenance	按 ID 查询单条发现的完整溯源信息和详情。
get_target_landscape	靶点“墓地”/耗竭指数——按模态和结果衡量靶点已被探索的程度。
list_top_targets	按记录的负面发现数量排序、被研究最多的靶点。
list_models	第 1 层活性评分模型注册表摘要。
get_model_card	各靶点的第 1 层模型卡：训练样本数量 + 留出脚手架拆分指标。
get_coverage	各模态和来源的覆盖统计数据。

链接

• 网站： https://nullary.ai
• 文档： https://nullary.ai/docs
• 覆盖范围： https://nullary.ai/coverage
• 研究： https://nullary.ai/research
• MCP 注册表： 列为 ai.nullary/nullary
• Smithery： https://smithery.ai/badge/nullary/drug-discovery

许可证

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