Biorxiv

@pipeworx/biorxiv

bioRxiv / medRxiv 预印本 API MCP。无需密钥。

属于 Pipeworx — 一个将 AI Agent 连接到 1875+ 个实时数据源的 MCP 网关。这是一项独立、非官方的集成 — 与上游提供方无关联、未获其认可，也非由其发布。

工具

• details(server, doi|date_or_range, cursor?) — 按 DOI 或日期／日期范围查询预印本元数据
• published(server, date_or_range, cursor?) — 后续已在期刊发表的 bioRxiv 预印本
• publisher(server, prefix, date_or_range, cursor?) — 后续由指定 DOI 前缀对应的出版方发表的预印本
• summary(server) — 每月提交／发表数量（完整历史记录）

server：biorxiv 或 medrxiv。

数据源

https://api.biorxiv.org/

快速开始

添加到你的 MCP 客户端（Claude Desktop、Cursor、Windsurf 等）：

{
  "mcpServers": {
    "biorxiv": {
      "url": "https://gateway.pipeworx.io/biorxiv/mcp"
    }
  }
}

此端点实际提供的内容

https://gateway.pipeworx.io/biorxiv/mcp 上的 tools/list 会返回上表中的工具，以及 Pipeworx 共享元工具 — ask_pipeworx、 discover_tools、search_within、remember／recall 和网关级工具集中的其他工具。因此，你看到的工具数量会多于此表：目前，单个工具包端点会在该工具包自身的工具之外，列出约 30 个共享工具。连接的 initialize 响应会说明其确切范围，是当天情况的权威依据。

这是有意为之，并非意外的多路复用。元工具可以让范围受限的连接回答此工具包未覆盖的问题 — 通过 ask_pipeworx 跨整个目录路由 — 无需再添加第二个 MCP 服务。目前无法挂载不含这些元工具的工具包端点；如果额外的架构信息占用的上下文比路由功能带来的价值更大，请连接一次完整网关，而不是连接多个工具包端点。

也可以连接完整的 Pipeworx 网关，直接列出每个工具包的工具，而不只是此工具包的工具：

{
  "mcpServers": {
    "pipeworx": {
      "url": "https://gateway.pipeworx.io/mcp"
    }
  }
}

两个 URL 都连接到相同的网关和相同的 1875+ 个数据源。唯一的区别在于会直接列出哪个工具包的工具；从任一端点都可以通过 ask_pipeworx 访问所有工具。

没有 MCP 客户端？通过 HTTP 调用

curl -X POST https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/details \
  -H 'Content-Type: application/json' \
  -d '{"server":"biorxiv","doi":"10.1101/2024.01.15.575982"}'

首次调用无需账户。检查任意工具：GET https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/details。查找工具：使用 {"query":"..."} 调用 POST https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/search_packs。

独立运行（无需网关账户）

此软件包也可以作为本地 stdio MCP 服务运行 — 无需 Pipeworx 账户，也无需经过网关往返：

{
  "mcpServers": {
    "biorxiv": {
      "command": "npx",
      "args": ["-y", "@pipeworx/mcp-biorxiv"]
    }
  }
}

也可以直接运行，以确认服务能够启动：

npx -y @pipeworx/mcp-biorxiv

它通过 stdin/stdout 使用 MCP 协议，并针对仅此工具包中的工具响应 initialize／tools/list／tools/call — 不包含上文网关连接额外提供的任何共享元工具。数据源和工具相同，但不支持 ask_pipeworx 路由。

使用 ask_pipeworx

你可以用通俗英语提问，而不是直接调用工具 — 此功能既适用于上文的工具包端点，也适用于完整网关：

ask_pipeworx({ question: "your question about Biorxiv data" })

网关会选择合适的工具并自动填入参数。

更多信息

• 文档和指南
• pipeworx.io

许可证

MIT