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Europepmc

Europepmc

远程服务
pipeworx.io搜索与检索03 天前更新

关于 Europepmc

Europepmc 是面向生物医学与生命科学文献检索的 MCP 服务,可查询文章、摘要、引文和开放获取全文。它提供独立本地运行与 Pipeworx 网关两种接入方式。

主要功能

  1. 01检索 Europe PMC 文献
  2. 02获取单篇文章记录
  3. 03提取结构化摘要
  4. 04查看参考文献与引用
  5. 05读取开放获取全文

适用场景

  1. 01查找生物医学研究文献
  2. 02浏览论文摘要和文章信息
  3. 03追踪论文的参考文献与引用

MCP 相关

向 MCP 客户端提供 Europe PMC 的文献搜索、文章信息、摘要、参考文献和引用工具;可作为本地 stdio 服务运行,也可通过 Pipeworx 网关连接。

配置

远程服务无需本地安装。选择你使用的客户端,复制配置或使用一键安装。

服务地址https://gateway.pipeworx.io/europepmc/mcp
一键复制安装命令
Claude CodeTerminal
Cursor.cursor/mcp.json
VS Code.vscode/mcp.json
Claude Desktopclaude_desktop_config.json
Windsurf~/.codeium/windsurf/mcp_config.json

命令在终端中运行;JSON 粘贴到对应客户端的 MCP 配置后重启。需要授权的服务会在首次连接时提示登录。

工具

详细介绍

@pipeworx/europepmc

Europe PubMed Central MCP——生物医学/生命科学文献搜索、摘要和全文(仅限开放获取)。无需密钥。

属于 Pipeworx——一个将 AI Agent 连接到 1879+ 个实时数据源的 MCP 网关。这是独立的非官方集成,与上游提供方无关联,未获其认可,也非由其发布。

工具

  • search(query, page?, pageSize?) — Europe PMC 搜索(lucene 风格查询)
  • get_article(source, id) — 按来源(MED、PMC、PPR 等)和 id 获取单篇文章记录
  • abstract(source, id) — 标题和结构化摘要
  • references(source, id, pageSize?) — 被引参考文献列表
  • citations(source, id, pageSize?) — 引用该文章的文献列表

数据源

https://www.ebi.ac.uk/europepmc/webservices/rest/

快速开始

添加到你的 MCP 客户端(Claude Desktop、Cursor、Windsurf 等):

{
  "mcpServers": {
    "europepmc": {
      "url": "https://gateway.pipeworx.io/europepmc/mcp"
    }
  }
}
此端点实际提供的内容

https://gateway.pipeworx.io/europepmc/mcp 上的 tools/list 会返回上表中的工具,以及 Pipeworx 共享元工具——ask_pipeworx、discover_tools、search_within、remember/recall,还有其他网关级工具。因此,你看到的工具数量会多于表中所列:目前,单个工具包端点除了该工具包自身的工具外,还会列出约 30 个共享工具。连接的 initialize 响应会说明其确切范围,是当天有效范围的权威信息。

这是有意为之,并非意外的多路复用。元工具可以让受限连接通过 ask_pipeworx 跨整个目录进行路由,从而回答本工具包未涵盖的问题,而无需添加第二个 MCP 服务。目前无法挂载不含这些元工具的工具包端点;如果额外的架构定义所占用的上下文超过了路由功能带来的价值,请连接一次完整网关,而不是连接多个工具包端点。

或者,连接完整的 Pipeworx 网关,直接列出每个工具包的工具,而不只是当前工具包的工具:

{
  "mcpServers": {
    "pipeworx": {
      "url": "https://gateway.pipeworx.io/mcp"
    }
  }
}

两个 URL 都连接到同一个网关和相同的 1879+ 个数据源。唯一的区别在于直接列出哪个工具包的工具;无论连接哪一个,ask_pipeworx 都能访问所有工具包。

没有 MCP 客户端?通过 HTTP 调用

curl -X POST https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/europepmc_search \
  -H 'Content-Type: application/json' \
  -d '{"query":"CRISPR AND gene editing"}'

首次调用无需账户。检查任意工具:GET https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/europepmc_search。查找工具:使用 {"query":"..."} 向 https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/search_packs 发送 POST 请求。

独立运行(无需网关账户)

此软件包也可以作为本地 stdio MCP 服务运行——无需 Pipeworx 账户,也无需经过网关:

{
  "mcpServers": {
    "europepmc": {
      "command": "npx",
      "args": ["-y", "@pipeworx/mcp-europepmc"]
    }
  }
}

也可以直接运行,以确认它能正常启动:

npx -y @pipeworx/mcp-europepmc

它通过 stdin/stdout 使用 MCP 协议,并响应 initialize/tools/list/tools/call,仅提供此工具包的工具——不包含上述网关连接额外提供的任何共享元工具。数据源相同,工具相同,但不提供 ask_pipeworx 路由。

使用 ask_pipeworx

你可以用通俗的语言提问,而不是直接调用工具——此功能既适用于上面的工具包端点,也适用于完整网关:

ask_pipeworx({ question: "your question about Europepmc data" })

网关会自动选择合适的工具并填入参数。

更多信息

许可证

MIT

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第一次接触 MCP?

从协议是什么,到在客户端里装上第一个服务,这几条回答覆盖了大多数入门问题。

一个开放协议,规定了 AI 应用如何以统一方式连接外部工具与数据源。客户端负责与模型对话,MCP 服务负责提供工具、资源和提示模板,两者通过标准消息通信,同一个服务可以被不同客户端复用。