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Gbif

Gbif

远程服务
pipeworx.io科研与教育02 天前更新

关于 Gbif

Gbif 是面向生物多样性研究者的 MCP 服务,封装 Global Biodiversity Information Facility API v1,可免费且无需身份验证地查询物种分类与出现记录。

主要功能

  1. 01按常见名或学名搜索物种
  2. 02获取完整分类层级
  3. 03查询带地理位置的物种记录
  4. 04按国家或坐标附近筛选记录

适用场景

  1. 01核对物种的分类信息
  2. 02查找某物种的观测记录
  3. 03调查指定地点附近的物种

MCP 相关

它向 MCP 客户端提供物种搜索、分类信息和出现记录查询工具,包括按位置附近检索。可通过 Pipeworx 网关连接,也可作为本地 stdio MCP 服务运行。

配置

远程服务无需本地安装。选择你使用的客户端,复制配置或使用一键安装。

服务地址https://gateway.pipeworx.io/gbif/mcp
一键复制安装命令
Claude CodeTerminal
Cursor.cursor/mcp.json
VS Code.vscode/mcp.json
Claude Desktopclaude_desktop_config.json
Windsurf~/.codeium/windsurf/mcp_config.json

命令在终端中运行;JSON 粘贴到对应客户端的 MCP 配置后重启。需要授权的服务会在首次连接时提示登录。

工具

详细介绍

mcp-gbif

GBIF MCP — 封装 Global Biodiversity Information Facility API v1(免费,无需身份验证)

属于 Pipeworx — 一个将 AI Agent 连接到 1879+ 个实时数据源的 MCP 网关。这是一个独立的非官方集成,与上游提供方无关联、未获其认可,也并非由其发布。

工具

工具描述
search_species按常见名称或学名搜索物种。返回匹配的分类群及其等级、分类状态和分类层级。使用分类群键调用 get_species 获取完整详情。
get_species获取物种的完整分类信息(从界到亚种)。需要提供从 search_species 获取的分类群键。返回所有分类等级和接受名称状态。
get_occurrences获取物种带坐标、日期和来源的地理定位观测记录。传入 name(如 "Danaus plexippus" 这样的学名,会自动解析)或数字形式的 GBIF 主干分类 key。按国家/地区代码(例如 'US'、'BR'、'AU')筛选,可缩小地理范围。
occurrences_near查找某个地点附近的物种出现记录(纬度/经度 + 半径)。对于“附近有哪些物种/野生动物”“这些坐标周围有哪些鸟类/植物”“ 是否在这个地点附近有记录”等问题,优先使用此工具。可选用 GBIF 分类群键(从 search_species 获取)筛选某个类群或物种,例如 212 = 鸟类、6 = 植物、359 = 哺乳动物。返回带有物种名称、日期、地点和来源的地理定位记录。

快速开始

添加到你的 MCP 客户端(Claude Desktop、Cursor、Windsurf 等):

{
  "mcpServers": {
    "gbif": {
      "url": "https://gateway.pipeworx.io/gbif/mcp"
    }
  }
}
此端点实际提供的内容

https://gateway.pipeworx.io/gbif/mcp 上的 tools/list 会返回上表中的工具,以及 Pipeworx 共享元工具 — ask_pipeworx、 discover_tools、search_within、remember/recall 和网关全局工具集中的其他工具。因此,你看到的工具数量会多于此表所列:目前,单个工具包端点除了该工具包自带的工具外,还会列出约 30 个共享工具。连接的 initialize 响应会说明其确切范围,是当天情况的权威答案。

这是有意如此,并非意外地进行多路复用。这些元工具可以让受限范围的连接通过 ask_pipeworx 跨整个目录路由,从而回答此工具包无法覆盖的问题,而不必添加第二个 MCP 服务。目前无法在不启用这些元工具的情况下挂载工具包端点;如果额外的架构描述占用的上下文超过了路由功能带来的价值,请连接一次完整网关,而不是连接多个工具包端点。

也可以连接完整的 Pipeworx 网关,直接列出每个工具包的工具,而不只是此工具包的工具:

{
  "mcpServers": {
    "pipeworx": {
      "url": "https://gateway.pipeworx.io/mcp"
    }
  }
}

两个 URL 都连接到相同的网关和相同的 1879+ 个数据源。唯一的区别是直接列出哪些工具包的工具;通过任一端点调用 ask_pipeworx 都可以访问所有工具。

没有 MCP 客户端?通过 HTTP 调用

curl -X POST https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/search_species \
  -H 'Content-Type: application/json' \
  -d '{"query":"Homo sapiens"}'

首次调用无需账户。检查任意工具:GET https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/search_species。查找工具:使用 {"query":"..."} 向 https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/search_packs 发送 POST 请求。

独立运行(无需网关账户)

此软件包也可作为本地 stdio MCP 服务运行 — 无需 Pipeworx 账户,也无需经由网关:

{
  "mcpServers": {
    "gbif": {
      "command": "npx",
      "args": ["-y", "@pipeworx/mcp-gbif"]
    }
  }
}

也可以直接运行以确认服务已启动:

npx -y @pipeworx/mcp-gbif

它通过 stdin/stdout 使用 MCP 协议,并且只针对此工具包的工具响应 initialize/tools/list/tools/call — 不包含上述网关连接所添加的任何共享元工具。相同的来源、相同的工具,没有 ask_pipeworx 路由。

与 ask_pipeworx 配合使用

你可以用简单的英语提问,而不必直接调用工具 — 这既适用于上面的工具包端点,也适用于完整网关:

ask_pipeworx({ question: "your question about Gbif data" })

网关会自动选择合适的工具并填入参数。

更多信息

许可证

MIT

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从协议是什么,到在客户端里装上第一个服务,这几条回答覆盖了大多数入门问题。

一个开放协议,规定了 AI 应用如何以统一方式连接外部工具与数据源。客户端负责与模型对话,MCP 服务负责提供工具、资源和提示模板,两者通过标准消息通信,同一个服务可以被不同客户端复用。