mcpField
G
Guidetopharmacology

Guidetopharmacology

远程服务
pipeworx.io健康医疗03 天前更新

关于 Guidetopharmacology

Guidetopharmacology 是面向药理学研究的 MCP 服务,提供 IUPHAR/BPS 专家整理的配体、靶点及相互作用数据。查询需自备 GtoPdb API 密钥,可通过 Pipeworx 网关或本地 stdio 使用。

主要功能

  1. 01按名称搜索药物配体
  2. 02按名称搜索蛋白靶点
  3. 03查询靶点的配体相互作用
  4. 04查询配体作用的蛋白及亲和力

适用场景

  1. 01查找候选药物对应的 GtoPdb 配体
  2. 02识别特定靶点的激动剂或抑制剂
  3. 03查看药物与蛋白靶点的结合亲和力

MCP 相关

向 MCP 客户端提供配体、靶点及相互作用查询工具。可连接 Pipeworx 网关,也可作为仅含本项目工具的本地 stdio MCP 服务运行。

配置

远程服务无需本地安装。选择你使用的客户端,复制配置或使用一键安装。

服务地址https://gateway.pipeworx.io/guidetopharmacology/mcp
一键复制安装命令
Claude CodeTerminal
Cursor.cursor/mcp.json
VS Code.vscode/mcp.json
Claude Desktopclaude_desktop_config.json
Windsurf~/.codeium/windsurf/mcp_config.json

命令在终端中运行;JSON 粘贴到对应客户端的 MCP 配置后重启。需要授权的服务会在首次连接时提示登录。

工具

详细介绍

mcp-guidetopharmacology

IUPHAR/BPS Guide to PHARMACOLOGY (GtoPdb) MCP — 自带密钥。由专家整理的药理学数据库,涵盖药物靶点、配体及其相互作用。

属于 Pipeworx — 一个将 AI Agent 连接到 1879+ 个实时数据源的 MCP 网关。这是独立的非官方集成,与上游提供方无关联、未获其认可,也非由其发布。

工具

工具描述
search_ligands在 Guide to PHARMACOLOGY (IUPHAR/BPS)(由专家整理的药理学数据库)中按名称搜索药物配体。返回匹配的配体及其 GtoPdb 配体 ID、类型(例如 Synthetic organic、Peptide、Antibody、Metabolite)和批准状态。使用返回的配体 ID 调用 ligand_interactions,查找其作用的蛋白质靶点。需要 GtoPdb API 密钥 — 可在 guidetopharmacology.org/login.jsp 免费注册,并通过 _apiKey 传入自己的密钥。可补充 ChEMBL/DrugBank。
search_targets在 Guide to PHARMACOLOGY (IUPHAR/BPS)(由专家整理的药理学数据库)中按名称搜索蛋白质靶点。返回匹配的靶点及其 GtoPdb 靶点 ID、缩写和类型(例如 GPCR、CatalyticReceptor、Enzyme、Transporter)。使用返回的靶点 ID 调用 target_interactions,查找与其结合的配体。需要 GtoPdb API 密钥 — 可在 guidetopharmacology.org/login.jsp 免费注册,并通过 _apiKey 传入自己的密钥。可补充 ChEMBL/DrugBank。
target_interactions列出 Guide to PHARMACOLOGY (IUPHAR/BPS) 中某个蛋白质靶点的定量配体相互作用。给定 GtoPdb 靶点 ID(来自 search_targets),返回作用于该靶点的配体及其相互作用类型(Agonist/Antagonist/Inhibitor 等)、作用方式和结合亲和力(例如 pKi/pIC50)。需要 GtoPdb API 密钥 — 可在 guidetopharmacology.org/login.jsp 免费注册,并通过 _apiKey 传入自己的密钥。
ligand_interactions查询药物作用于哪些蛋白质 — 返回 Guide to PHARMACOLOGY (IUPHAR/BPS) 中为配体整理的靶点相互作用,每项都包含靶点 PROTEIN NAME、相互作用类型(Agonist/Antagonist/Inhibitor)、作用方式和结合亲和力(pKi/pIC50)。传入药物名称(“imatinib”),系统会自动解析;也可以使用 GtoPdb 配体 ID。响应始终会标明实际查询的配体,因此如果某个 ID 对应的是另一种化合物,也会明确显示,而不会悄然忽略。需要 GtoPdb API 密钥 — 可在 guidetopharmacology.org/login.jsp 免费注册,并通过 _apiKey 传入自己的密钥。

快速开始

添加到你的 MCP 客户端(Claude Desktop、Cursor、Windsurf 等):

{
  "mcpServers": {
    "guidetopharmacology": {
      "url": "https://gateway.pipeworx.io/guidetopharmacology/mcp"
    }
  }
}
此端点实际提供的内容

https://gateway.pipeworx.io/guidetopharmacology/mcp 上的 tools/list 会返回上表中的工具,以及 Pipeworx 的共享元工具 — ask_pipeworx、 discover_tools、search_within、remember/recall 和其他网关级工具。因此,你看到的工具数量会多于此表:目前,单个工具包端点除了该工具包自身的工具外,还会列出大约 30 个共享工具。连接的 initialize 响应会说明其确切范围,是判断当日实际情况的权威依据。

这是有意为之,并非意外的多路复用。元工具让指定范围的连接能够回答此工具包未覆盖的问题 — 通过 ask_pipeworx 跨整个目录进行路由 — 无需再添加第二个 MCP 服务。目前无法挂载不包含这些元工具的工具包端点;如果额外的架构定义比路由功能更耗费上下文,不妨只连接一次完整网关,而不是连接多个工具包端点。

也可以连接完整的 Pipeworx 网关,直接列出所有工具包的工具,而不只是此工具包的工具:

{
  "mcpServers": {
    "pipeworx": {
      "url": "https://gateway.pipeworx.io/mcp"
    }
  }
}

两个 URL 都会连接到同一个网关和相同的 1879+ 个数据源。唯一的区别是直接列出哪些工具包的工具;从任一端点调用 ask_pipeworx 都可以访问所有工具。

没有 MCP 客户端?通过 HTTP 调用

此工具包需要你提供自己的 API 密钥(_apiKey)——我们不会代为提供,因此这里没有无需密钥即可运行的 curl 命令。查看任意工具:GET https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/search_ligands。查找工具包:使用 {"query":"..."} 调用 POST https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/search_packs。

独立运行(无需网关账户)

此软件包也可作为本地 stdio MCP 服务运行——无需 Pipeworx 账户,也无需经过网关:

{
  "mcpServers": {
    "guidetopharmacology": {
      "command": "npx",
      "args": ["-y", "@pipeworx/mcp-guidetopharmacology"]
    }
  }
}

或者直接运行它,确认服务能够启动:

npx -y @pipeworx/mcp-guidetopharmacology

它通过 stdin/stdout 使用 MCP,并响应 initialize/tools/list/tools/call,仅提供此工具包的工具——不包含上述网关连接所添加的任何共享元工具。相同的源代码、相同的工具,不涉及 ask_pipeworx 路由。

使用 ask_pipeworx

你可以用通俗的英语提问,而不是直接调用工具——这既适用于上面的工具包端点,也适用于完整网关:

ask_pipeworx({ question: "your question about Guidetopharmacology data" })

网关会选择合适的工具,并自动填入参数。

更多信息

许可证

MIT

评论

支持 Markdown

第一次接触 MCP?

从协议是什么,到在客户端里装上第一个服务,这几条回答覆盖了大多数入门问题。

一个开放协议,规定了 AI 应用如何以统一方式连接外部工具与数据源。客户端负责与模型对话,MCP 服务负责提供工具、资源和提示模板,两者通过标准消息通信,同一个服务可以被不同客户端复用。