关于 Hgnc
Hgnc 是用于查询 HGNC 已批准人类基因目录的 MCP 服务,支持按符号精确查询、模糊搜索,以及通过外部数据库标识符查找完整基因记录。
主要功能
- 01按已批准的 HGNC 符号精确查询
- 02搜索符号、名称和别名
- 03解析外部数据库标识符
- 04返回含交叉引用的完整基因记录
适用场景
- 01根据名称片段查找基因
- 02获取已批准的人类基因记录
- 03将 Entrez 或 Ensembl ID 映射到 HGNC 基因
MCP 相关
通过 MCP 工具提供基因查询、搜索和交叉引用解析。可作为本地 stdio 服务运行,也可通过 Pipeworx 网关连接。
配置
远程服务无需本地安装。选择你使用的客户端,复制配置或使用一键安装。
https://gateway.pipeworx.io/hgnc/mcpclaude mcp add --transport http pipeworx-io-hgnc https://gateway.pipeworx.io/hgnc/mcp{"mcpServers":{"pipeworx-io-hgnc":{"type":"http","url":"https://gateway.pipeworx.io/hgnc/mcp"}}}在 Cursor 中打开{"servers":{"pipeworx-io-hgnc":{"type":"http","url":"https://gateway.pipeworx.io/hgnc/mcp"}}}在 VS Code 中打开{"mcpServers":{"pipeworx-io-hgnc":{"type":"http","url":"https://gateway.pipeworx.io/hgnc/mcp"}}}{"mcpServers":{"pipeworx-io-hgnc":{"serverUrl":"https://gateway.pipeworx.io/hgnc/mcp"}}}命令在终端中运行;JSON 粘贴到对应客户端的 MCP 配置后重启。需要授权的服务会在首次连接时提示登录。
工具
详细介绍
mcp-hgnc
HGNC(HUGO Gene Nomenclature Committee)MCP。
属于 Pipeworx — 一个将 AI Agent 连接到 1881+ 个实时数据源的 MCP 网关。这是一个独立的非官方集成,与上游提供方无关联、未获其认可,也非由其发布。
工具
| 工具 | 描述 |
|---|---|
get_gene | 按官方 HGNC 符号精确查询已批准的人类基因 — 返回完整的权威记录:批准名称、基因座类型、染色体位置、别名/先前使用的符号、基因组以及交叉引用(Entrez、Ensembl、UniProt、OMIM、RefSeq、UCSC、CCDS)。如果只有名称片段或不确定确切符号,请先使用 search_genes。无需密钥。 |
search_genes | 在已批准的符号、名称和别名中进行模糊搜索 — 例如“乳腺癌”、“p53”、“肿瘤蛋白”。返回轻量级匹配项(hgnc_id、符号、相关性分数),并按分数排序;调用 get_gene 并传入返回的符号,即可获取完整记录。无需密钥。 |
resolve_xref | 反向查询:将外部数据库 ID 映射到对应的 HGNC 基因。“Entrez 672 对应哪个基因?” -> BRCA1。接受 entrez_id、ensembl_gene_id、uniprot_ids、omim_id、refseq_accession 或 ucsc_id,并返回与 get_gene 相同的完整记录。无需密钥。 |
快速开始
添加到你的 MCP 客户端(Claude Desktop、Cursor、Windsurf 等):
{
"mcpServers": {
"hgnc": {
"url": "https://gateway.pipeworx.io/hgnc/mcp"
}
}
}
此端点实际提供的内容
https://gateway.pipeworx.io/hgnc/mcp 上的 tools/list 会返回上表中的工具,以及 Pipeworx 共享的元工具 — ask_pipeworx、discover_tools、search_within、remember/recall 和网关范围内的其他工具。因此,你看到的工具数量会多于此表:目前,单个工具包端点除了该工具包自身的工具外,还会列出大约 30 个共享工具。连接的 initialize 响应会说明其确切范围,是判断当前范围的权威依据。
这是有意设计的,并非意外的多路复用。元工具可以让范围受限的连接回答本工具包未涵盖的问题 — 通过 ask_pipeworx 跨整个目录进行路由 — 而无需添加第二个 MCP 服务。目前无法挂载不含这些元工具的工具包端点;如果额外的架构占用的上下文超出了路由带来的价值,请连接一次完整网关,而不是连接多个工具包端点。
或者连接完整的 Pipeworx 网关,直接获取所有工具包列出的工具,而不只是此工具包的工具:
{
"mcpServers": {
"pipeworx": {
"url": "https://gateway.pipeworx.io/mcp"
}
}
}
两个 URL 都连接到同一个网关和相同的 1881+ 个数据源。唯一的区别是哪些工具包的工具会被直接列出;无论连接哪个端点,ask_pipeworx 都能访问所有工具。
没有 MCP 客户端?通过 HTTP 调用
curl -X POST https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/hgnc_get_gene \
-H 'Content-Type: application/json' \
-d '{"symbol":"BRCA1"}'
首次调用无需账户。检查任意工具:GET https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/hgnc_get_gene。查找工具:使用 {"query":"..."} 发送 POST https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/search_packs。
独立运行(无需网关账户)
此软件包也可以作为本地 stdio MCP 服务运行 — 无需 Pipeworx 账户,也无需经过网关:
{
"mcpServers": {
"hgnc": {
"command": "npx",
"args": ["-y", "@pipeworx/mcp-hgnc"]
}
}
}
或者直接运行以确认它能启动:
npx -y @pipeworx/mcp-hgnc
它通过 stdin/stdout 使用 MCP,并响应 initialize/tools/list/tools/call,提供仅属于此工具包的工具 — 不包含上述网关连接额外提供的任何共享元工具。数据源和工具相同,但不提供 ask_pipeworx 路由。
使用 ask_pipeworx
你也可以用普通英语提问,而不是直接调用工具 — 此方式既适用于上面的工具包端点,也适用于完整网关:
ask_pipeworx({ question: "your question about Hgnc data" })
网关会选择合适的工具并自动填充参数。
更多信息
许可证
MIT
评论
一个开放协议,规定了 AI 应用如何以统一方式连接外部工具与数据源。客户端负责与模型对话,MCP 服务负责提供工具、资源和提示模板,两者通过标准消息通信,同一个服务可以被不同客户端复用。