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Hgnc

Hgnc

远程服务
pipeworx.io科研与教育02 天前更新

关于 Hgnc

Hgnc 是用于查询 HGNC 已批准人类基因目录的 MCP 服务,支持按符号精确查询、模糊搜索,以及通过外部数据库标识符查找完整基因记录。

主要功能

  1. 01按已批准的 HGNC 符号精确查询
  2. 02搜索符号、名称和别名
  3. 03解析外部数据库标识符
  4. 04返回含交叉引用的完整基因记录

适用场景

  1. 01根据名称片段查找基因
  2. 02获取已批准的人类基因记录
  3. 03将 Entrez 或 Ensembl ID 映射到 HGNC 基因

MCP 相关

通过 MCP 工具提供基因查询、搜索和交叉引用解析。可作为本地 stdio 服务运行,也可通过 Pipeworx 网关连接。

配置

远程服务无需本地安装。选择你使用的客户端,复制配置或使用一键安装。

服务地址https://gateway.pipeworx.io/hgnc/mcp
一键复制安装命令
Claude CodeTerminal
Cursor.cursor/mcp.json
VS Code.vscode/mcp.json
Claude Desktopclaude_desktop_config.json
Windsurf~/.codeium/windsurf/mcp_config.json

命令在终端中运行;JSON 粘贴到对应客户端的 MCP 配置后重启。需要授权的服务会在首次连接时提示登录。

工具

详细介绍

mcp-hgnc

HGNC(HUGO Gene Nomenclature Committee)MCP。

属于 Pipeworx — 一个将 AI Agent 连接到 1881+ 个实时数据源的 MCP 网关。这是一个独立的非官方集成,与上游提供方无关联、未获其认可,也非由其发布。

工具

工具描述
get_gene按官方 HGNC 符号精确查询已批准的人类基因 — 返回完整的权威记录:批准名称、基因座类型、染色体位置、别名/先前使用的符号、基因组以及交叉引用(Entrez、Ensembl、UniProt、OMIM、RefSeq、UCSC、CCDS)。如果只有名称片段或不确定确切符号,请先使用 search_genes。无需密钥。
search_genes在已批准的符号、名称和别名中进行模糊搜索 — 例如“乳腺癌”、“p53”、“肿瘤蛋白”。返回轻量级匹配项(hgnc_id、符号、相关性分数),并按分数排序;调用 get_gene 并传入返回的符号,即可获取完整记录。无需密钥。
resolve_xref反向查询:将外部数据库 ID 映射到对应的 HGNC 基因。“Entrez 672 对应哪个基因?” -> BRCA1。接受 entrez_id、ensembl_gene_id、uniprot_ids、omim_id、refseq_accession 或 ucsc_id,并返回与 get_gene 相同的完整记录。无需密钥。

快速开始

添加到你的 MCP 客户端(Claude Desktop、Cursor、Windsurf 等):

{
  "mcpServers": {
    "hgnc": {
      "url": "https://gateway.pipeworx.io/hgnc/mcp"
    }
  }
}
此端点实际提供的内容

https://gateway.pipeworx.io/hgnc/mcp 上的 tools/list 会返回上表中的工具,以及 Pipeworx 共享的元工具 — ask_pipeworx、discover_tools、search_within、remember/recall 和网关范围内的其他工具。因此,你看到的工具数量会多于此表:目前,单个工具包端点除了该工具包自身的工具外,还会列出大约 30 个共享工具。连接的 initialize 响应会说明其确切范围,是判断当前范围的权威依据。

这是有意设计的,并非意外的多路复用。元工具可以让范围受限的连接回答本工具包未涵盖的问题 — 通过 ask_pipeworx 跨整个目录进行路由 — 而无需添加第二个 MCP 服务。目前无法挂载不含这些元工具的工具包端点;如果额外的架构占用的上下文超出了路由带来的价值,请连接一次完整网关,而不是连接多个工具包端点。

或者连接完整的 Pipeworx 网关,直接获取所有工具包列出的工具,而不只是此工具包的工具:

{
  "mcpServers": {
    "pipeworx": {
      "url": "https://gateway.pipeworx.io/mcp"
    }
  }
}

两个 URL 都连接到同一个网关和相同的 1881+ 个数据源。唯一的区别是哪些工具包的工具会被直接列出;无论连接哪个端点,ask_pipeworx 都能访问所有工具。

没有 MCP 客户端?通过 HTTP 调用

curl -X POST https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/hgnc_get_gene \
  -H 'Content-Type: application/json' \
  -d '{"symbol":"BRCA1"}'

首次调用无需账户。检查任意工具:GET https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/hgnc_get_gene。查找工具:使用 {"query":"..."} 发送 POST https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/search_packs。

独立运行(无需网关账户)

此软件包也可以作为本地 stdio MCP 服务运行 — 无需 Pipeworx 账户,也无需经过网关:

{
  "mcpServers": {
    "hgnc": {
      "command": "npx",
      "args": ["-y", "@pipeworx/mcp-hgnc"]
    }
  }
}

或者直接运行以确认它能启动:

npx -y @pipeworx/mcp-hgnc

它通过 stdin/stdout 使用 MCP,并响应 initialize/tools/list/tools/call,提供仅属于此工具包的工具 — 不包含上述网关连接额外提供的任何共享元工具。数据源和工具相同,但不提供 ask_pipeworx 路由。

使用 ask_pipeworx

你也可以用普通英语提问,而不是直接调用工具 — 此方式既适用于上面的工具包端点,也适用于完整网关:

ask_pipeworx({ question: "your question about Hgnc data" })

网关会选择合适的工具并自动填充参数。

更多信息

许可证

MIT

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第一次接触 MCP?

从协议是什么,到在客户端里装上第一个服务,这几条回答覆盖了大多数入门问题。

一个开放协议,规定了 AI 应用如何以统一方式连接外部工具与数据源。客户端负责与模型对话,MCP 服务负责提供工具、资源和提示模板,两者通过标准消息通信,同一个服务可以被不同客户端复用。