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Idigbio

Idigbio

远程服务
pipeworx.io科研与教育02 天前更新

关于 Idigbio

Idigbio 是面向生物多样性研究者的 MCP 服务,可查询 iDigBio 的美国自然历史博物馆标本记录。它支持按分类和地点筛选、获取单条记录及按字段汇总计数。

主要功能

  1. 01搜索博物馆标本记录
  2. 02按分类和地点筛选
  3. 03获取单条标本完整记录
  4. 04按字段汇总记录数量

适用场景

  1. 01查找特定分类或地点的标本
  2. 02查看单个标本的规范化记录
  3. 03汇总标本的分类或地理分布

MCP 相关

向 MCP 客户端提供标本搜索、单条记录查询和分组计数工具。可通过 Pipeworx 网关连接,也可作为本地标准输入输出 MCP 服务运行。

配置

远程服务无需本地安装。选择你使用的客户端,复制配置或使用一键安装。

服务地址https://gateway.pipeworx.io/idigbio/mcp
一键复制安装命令
Claude CodeTerminal
Cursor.cursor/mcp.json
VS Code.vscode/mcp.json
Claude Desktopclaude_desktop_config.json
Windsurf~/.codeium/windsurf/mcp_config.json

命令在终端中运行;JSON 粘贴到对应客户端的 MCP 配置后重启。需要授权的服务会在首次连接时提示登录。

工具

详细介绍

mcp-idigbio

iDigBio 生物多样性标本 MCP。

属于 Pipeworx — 一个将 AI Agent 连接到 1881+ 个实时数据源的 MCP 网关。这是一个独立的非官方集成,与上游提供方无关,未获其认可,也未由其发布。

工具

工具描述
search_specimens通过 iDigBio 搜索美国馆藏中约 1.5 亿条数字化自然历史博物馆标本记录(植物、动物、化石)。可组合使用任意分类和地点筛选条件。至少需要一个筛选条件。无需密钥。
get_specimen根据 uuid 获取单条 iDigBio 标本的完整标准化记录。例如,uuid "0746b188-c390-4ab1-bd20-5489a9c6c33c"(美洲狮记录)。无需密钥。
count_by_field获取按字段分组的分类学/地理标本数量(前列值及数量),范围涵盖整个 iDigBio。可选用分类和地点筛选条件限定统计范围。无需密钥。

快速开始

添加到你的 MCP 客户端(Claude Desktop、Cursor、Windsurf 等):

{
  "mcpServers": {
    "idigbio": {
      "url": "https://gateway.pipeworx.io/idigbio/mcp"
    }
  }
}
此端点实际提供的内容

https://gateway.pipeworx.io/idigbio/mcp 上的 tools/list 会返回上表中的工具,以及 Pipeworx 的共享元工具 — ask_pipeworx、discover_tools、search_within、remember/recall 和网关全局工具集中的其余工具。因此,你看到的工具数量会多于本表:目前,单个工具包端点会列出约 30 个共享工具,以及该工具包自身的工具。连接的 initialize 响应会说明其确切范围,也是判断当天情况的权威依据。

这是有意为之,并非意外复用。当此工具包无法回答某个问题时,元工具可以通过 ask_pipeworx 跨整个目录进行路由,让这个有范围限制的连接也能回答问题,而无需你再添加第二个 MCP 服务。目前无法挂载不含这些元工具的工具包端点;如果额外的架构定义所需的上下文超过了路由带来的价值,请连接一次完整网关,而不是连接多个工具包端点。

或者连接完整的 Pipeworx 网关,直接获取每个工具包列出的所有工具,而不只是当前工具包的工具:

{
  "mcpServers": {
    "pipeworx": {
      "url": "https://gateway.pipeworx.io/mcp"
    }
  }
}

两个 URL 都连接到同一个网关和相同的 1881+ 个数据源。唯一的区别在于哪些工具会被直接列出;无论连接哪一个,ask_pipeworx 都能访问所有工具。

没有 MCP 客户端?通过 HTTP 调用

curl -X POST https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/search_specimens \
  -H 'Content-Type: application/json' \
  -d '{"scientific_name":"puma concolor","limit":10}'

首次调用无需账号。检查任意工具:GET https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/search_specimens。查找工具:POST https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/search_packs,并传入 {"query":"..."}。

独立运行(无需网关账号)

此软件包也可以作为本地 stdio MCP 服务运行 — 无需 Pipeworx 账号,也无需往返网关:

{
  "mcpServers": {
    "idigbio": {
      "command": "npx",
      "args": ["-y", "@pipeworx/mcp-idigbio"]
    }
  }
}

或者直接运行以确认服务能够启动:

npx -y @pipeworx/mcp-idigbio

它通过 stdin/stdout 使用 MCP,并响应 initialize/tools/list/tools/call,仅提供此工具包的工具 — 不包含上述网关连接所添加的共享元工具。数据源相同、工具相同,但没有 ask_pipeworx 路由。

使用 ask_pipeworx

你也可以用通俗英语提问,而不是直接调用工具 — 这不仅适用于上面的工具包端点,也适用于完整网关:

ask_pipeworx({ question: "your question about Idigbio data" })

网关会自动选择合适的工具并填入参数。

更多信息

许可证

MIT

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第一次接触 MCP?

从协议是什么,到在客户端里装上第一个服务,这几条回答覆盖了大多数入门问题。

一个开放协议,规定了 AI 应用如何以统一方式连接外部工具与数据源。客户端负责与模型对话,MCP 服务负责提供工具、资源和提示模板,两者通过标准消息通信,同一个服务可以被不同客户端复用。