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Intact

Intact

远程服务
pipeworx.io科研与教育02 天前更新

关于 Intact

Intact 是面向研究人员的 MCP 服务,用于查询 EBI 分子相互作用数据库。它可按基因、蛋白质名称或 UniProt ID 查找相互作用详情或计数,且无需密钥。

主要功能

  1. 01查找蛋白质及分子相互作用
  2. 02返回检测方法、物种、文献和置信度
  3. 03统计基因或蛋白质的相互作用数量
  4. 04按名称或 UniProt ID 搜索

适用场景

  1. 01检查某蛋白质的相互作用证据
  2. 02在后续分析前统计已知相互作用

MCP 相关

向 MCP 客户端提供 IntAct 相互作用搜索和计数工具。可通过 Pipeworx 远程端点或本地 stdio 服务使用。

配置

远程服务无需本地安装。选择你使用的客户端,复制配置或使用一键安装。

服务地址https://gateway.pipeworx.io/intact/mcp
一键复制安装命令
Claude CodeTerminal
Cursor.cursor/mcp.json
VS Code.vscode/mcp.json
Claude Desktopclaude_desktop_config.json
Windsurf~/.codeium/windsurf/mcp_config.json

命令在终端中运行;JSON 粘贴到对应客户端的 MCP 配置后重启。需要授权的服务会在首次连接时提示登录。

工具

详细介绍

mcp-intact

IntAct(EBI)分子相互作用数据库 MCP。无需密钥。

属于 Pipeworx — 一个将 AI Agent 连接到 1881+ 个实时数据源的 MCP 网关。这是一个独立的非官方集成,与上游提供方无关联、未获其认可,也非由其发布。

工具

工具描述
find_interactionsIntAct(EBI)分子相互作用数据库 — 根据基因/蛋白质名称或 UniProt id,查找蛋白质-蛋白质及其他分子相互作用,并返回检测方法、相互作用类型、物种、PubMed 参考文献和 MI 置信度评分。无需密钥。
interaction_countIntAct(EBI)— 快速统计某个基因/蛋白质(根据名称或 UniProt id)参与的分子相互作用数量。无需密钥。

快速开始

添加到 MCP 客户端(Claude Desktop、Cursor、Windsurf 等):

{
  "mcpServers": {
    "intact": {
      "url": "https://gateway.pipeworx.io/intact/mcp"
    }
  }
}
此端点实际提供的内容

https://gateway.pipeworx.io/intact/mcp 上的 tools/list 会返回上表中的工具,以及 Pipeworx 共享元工具 — ask_pipeworx、 discover_tools、search_within、remember/recall 和网关范围内的其他工具。因此,你看到的工具数量会多于此表所列:目前,单个工具包端点会列出约 30 个共享工具,以及该工具包自身的工具。连接的 initialize 响应会说明确切范围,是当天情况的权威信息。

这是有意为之,并非意外的多路复用。元工具可让仅限当前范围的连接通过 ask_pipeworx 跨整个目录路由,从而回答此工具包无法处理的问题,无需再添加第二个 MCP 服务。目前无法挂载不包含这些工具的工具包端点;如果额外的架构信息带来的上下文成本高于路由功能的价值,可以只连接一次完整网关,而不是连接多个工具包端点。

也可以连接完整的 Pipeworx 网关,直接列出所有工具包的工具,而不只是此工具包的工具:

{
  "mcpServers": {
    "pipeworx": {
      "url": "https://gateway.pipeworx.io/mcp"
    }
  }
}

两个 URL 都连接到同一个网关和相同的 1881+ 个数据源。唯一的区别是,直接列出哪个工具包的工具;无论连接哪一个,ask_pipeworx 都能访问所有工具。

没有 MCP 客户端?通过 HTTP 调用

curl -X POST https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/find_interactions \
  -H 'Content-Type: application/json' \
  -d '{"query":"EGFR_HUMAN"}'

首次调用无需账户。查看任意工具:GET https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/find_interactions。查找工具包:使用 {"query":"..."} 调用 POST https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/search_packs。

独立运行(无需网关账户)

此软件包也可作为本地 stdio MCP 服务运行 — 无需 Pipeworx 账户,也不必通过网关往返:

{
  "mcpServers": {
    "intact": {
      "command": "npx",
      "args": ["-y", "@pipeworx/mcp-intact"]
    }
  }
}

或者直接运行,确认服务可以启动:

npx -y @pipeworx/mcp-intact

它通过 stdin/stdout 使用 MCP 协议,并响应 initialize/tools/list/tools/call,但仅提供此工具包的工具 — 不包含上述网关连接额外提供的任何共享元工具。来源相同,工具相同,但没有 ask_pipeworx 路由。

与 ask_pipeworx 搭配使用

你也可以用通俗语言提问,而不直接调用工具 — 这既适用于上面的工具包端点,也适用于完整网关:

ask_pipeworx({ question: "your question about Intact data" })

网关会选择合适的工具并自动填写参数。

更多信息

许可证

MIT

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第一次接触 MCP?

从协议是什么,到在客户端里装上第一个服务,这几条回答覆盖了大多数入门问题。

一个开放协议,规定了 AI 应用如何以统一方式连接外部工具与数据源。客户端负责与模型对话,MCP 服务负责提供工具、资源和提示模板,两者通过标准消息通信,同一个服务可以被不同客户端复用。