关于 Intact
Intact 是面向研究人员的 MCP 服务,用于查询 EBI 分子相互作用数据库。它可按基因、蛋白质名称或 UniProt ID 查找相互作用详情或计数,且无需密钥。
主要功能
- 01查找蛋白质及分子相互作用
- 02返回检测方法、物种、文献和置信度
- 03统计基因或蛋白质的相互作用数量
- 04按名称或 UniProt ID 搜索
适用场景
- 01检查某蛋白质的相互作用证据
- 02在后续分析前统计已知相互作用
MCP 相关
向 MCP 客户端提供 IntAct 相互作用搜索和计数工具。可通过 Pipeworx 远程端点或本地 stdio 服务使用。
配置
远程服务无需本地安装。选择你使用的客户端,复制配置或使用一键安装。
https://gateway.pipeworx.io/intact/mcpclaude mcp add --transport http pipeworx-io-intact https://gateway.pipeworx.io/intact/mcp{"mcpServers":{"pipeworx-io-intact":{"type":"http","url":"https://gateway.pipeworx.io/intact/mcp"}}}在 Cursor 中打开{"servers":{"pipeworx-io-intact":{"type":"http","url":"https://gateway.pipeworx.io/intact/mcp"}}}在 VS Code 中打开{"mcpServers":{"pipeworx-io-intact":{"type":"http","url":"https://gateway.pipeworx.io/intact/mcp"}}}{"mcpServers":{"pipeworx-io-intact":{"serverUrl":"https://gateway.pipeworx.io/intact/mcp"}}}命令在终端中运行;JSON 粘贴到对应客户端的 MCP 配置后重启。需要授权的服务会在首次连接时提示登录。
工具
详细介绍
mcp-intact
IntAct(EBI)分子相互作用数据库 MCP。无需密钥。
属于 Pipeworx — 一个将 AI Agent 连接到 1881+ 个实时数据源的 MCP 网关。这是一个独立的非官方集成,与上游提供方无关联、未获其认可,也非由其发布。
工具
| 工具 | 描述 |
|---|---|
find_interactions | IntAct(EBI)分子相互作用数据库 — 根据基因/蛋白质名称或 UniProt id,查找蛋白质-蛋白质及其他分子相互作用,并返回检测方法、相互作用类型、物种、PubMed 参考文献和 MI 置信度评分。无需密钥。 |
interaction_count | IntAct(EBI)— 快速统计某个基因/蛋白质(根据名称或 UniProt id)参与的分子相互作用数量。无需密钥。 |
快速开始
添加到 MCP 客户端(Claude Desktop、Cursor、Windsurf 等):
{
"mcpServers": {
"intact": {
"url": "https://gateway.pipeworx.io/intact/mcp"
}
}
}
此端点实际提供的内容
https://gateway.pipeworx.io/intact/mcp 上的 tools/list 会返回上表中的工具,以及 Pipeworx 共享元工具 — ask_pipeworx、
discover_tools、search_within、remember/recall 和网关范围内的其他工具。因此,你看到的工具数量会多于此表所列:目前,单个工具包端点会列出约 30 个共享工具,以及该工具包自身的工具。连接的 initialize 响应会说明确切范围,是当天情况的权威信息。
这是有意为之,并非意外的多路复用。元工具可让仅限当前范围的连接通过 ask_pipeworx 跨整个目录路由,从而回答此工具包无法处理的问题,无需再添加第二个 MCP 服务。目前无法挂载不包含这些工具的工具包端点;如果额外的架构信息带来的上下文成本高于路由功能的价值,可以只连接一次完整网关,而不是连接多个工具包端点。
也可以连接完整的 Pipeworx 网关,直接列出所有工具包的工具,而不只是此工具包的工具:
{
"mcpServers": {
"pipeworx": {
"url": "https://gateway.pipeworx.io/mcp"
}
}
}
两个 URL 都连接到同一个网关和相同的 1881+ 个数据源。唯一的区别是,直接列出哪个工具包的工具;无论连接哪一个,ask_pipeworx 都能访问所有工具。
没有 MCP 客户端?通过 HTTP 调用
curl -X POST https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/find_interactions \
-H 'Content-Type: application/json' \
-d '{"query":"EGFR_HUMAN"}'
首次调用无需账户。查看任意工具:GET https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/find_interactions。查找工具包:使用 {"query":"..."} 调用 POST https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/search_packs。
独立运行(无需网关账户)
此软件包也可作为本地 stdio MCP 服务运行 — 无需 Pipeworx 账户,也不必通过网关往返:
{
"mcpServers": {
"intact": {
"command": "npx",
"args": ["-y", "@pipeworx/mcp-intact"]
}
}
}
或者直接运行,确认服务可以启动:
npx -y @pipeworx/mcp-intact
它通过 stdin/stdout 使用 MCP 协议,并响应 initialize/tools/list/tools/call,但仅提供此工具包的工具 — 不包含上述网关连接额外提供的任何共享元工具。来源相同,工具相同,但没有 ask_pipeworx 路由。
与 ask_pipeworx 搭配使用
你也可以用通俗语言提问,而不直接调用工具 — 这既适用于上面的工具包端点,也适用于完整网关:
ask_pipeworx({ question: "your question about Intact data" })
网关会选择合适的工具并自动填写参数。
更多信息
许可证
MIT
评论
一个开放协议,规定了 AI 应用如何以统一方式连接外部工具与数据源。客户端负责与模型对话,MCP 服务负责提供工具、资源和提示模板,两者通过标准消息通信,同一个服务可以被不同客户端复用。