mcpField
M
Mydisease

Mydisease

远程服务
pipeworx.io健康医疗0今天更新

关于 Mydisease

Mydisease 是用于搜索 MyDisease.info 疾病并获取聚合注释的 MCP 服务,帮助用户将疾病名称对应到本体标识符,并查看相关基因、表型和化学物质关系。

主要功能

  1. 01按疾病名称或字段搜索
  2. 02按本体 ID 获取注释
  3. 03查看基因—疾病关联
  4. 04查看表型及化学物质关联
  5. 05查看索引及来源元数据

适用场景

  1. 01将疾病名称解析为本体 ID
  2. 02查阅关联基因和表型
  3. 03探索疾病与化学物质的关系

MCP 相关

向 MCP 客户端提供 `query`、`disease` 和 `metadata` 工具,可通过本地 stdio 或 Pipeworx 网关运行。

配置

远程服务无需本地安装。选择你使用的客户端,复制配置或使用一键安装。

服务地址https://gateway.pipeworx.io/mydisease/mcp
一键复制安装命令
Claude CodeTerminal
Cursor.cursor/mcp.json
VS Code.vscode/mcp.json
Claude Desktopclaude_desktop_config.json
Windsurf~/.codeium/windsurf/mcp_config.json

命令在终端中运行;JSON 粘贴到对应客户端的 MCP 配置后重启。需要授权的服务会在首次连接时提示登录。

工具

详细介绍

mcp-mydisease

MyDisease.info MCP。

属于 Pipeworx — 一个将 AI Agent 连接到 1683+ 个实时数据源的 MCP 网关。

工具

工具描述
query按自由文本名称或字段查询搜索 MyDisease.info 中的疾病。返回匹配结果,每条结果都以 MONDO 疾病 ID(例如 "MONDO:0015967")为键,并包含最匹配的本体和注释键。调用 "disease" 工具前,可用此工具将疾病名称解析为规范本体 ID。可使用 "diabetes" 或 "asthma" 等自由文本,也可使用 "mondo.label:asthma" 或 "disgenet.xrefs.disease_name:..." 等字段查询来缩小搜索范围。
disease获取单个疾病 ID 的完整聚合注释对象。支持 MONDO("MONDO:0015967")、DOID("DOID:9351")、OMIM("OMIM:125853")及其他受支持的本体 ID。返回交叉引用数据,包括 MONDO 本体(标签、同义词、交叉引用、父级/子级)、DisGeNET 的基因-疾病关联、HPO 的表型以及 CTD 的化学物质-疾病关系。请先通过 "query" 工具将名称解析为 ID。
metadata返回 MyDisease.info 构建元数据:疾病文档总数、可用注释来源(MONDO、DOID、OMIM、DisGeNET、HPO、CTD)及其当前发布版本。

快速开始

添加到 MCP 客户端(Claude Desktop、Cursor、Windsurf 等):

{
  "mcpServers": {
    "mydisease": {
      "url": "https://gateway.pipeworx.io/mydisease/mcp"
    }
  }
}
此端点实际提供的内容

https://gateway.pipeworx.io/mydisease/mcp 上的 tools/list 会返回上表中的工具,以及 Pipeworx 的共享元工具 — ask_pipeworx、 discover_tools、search_within、remember/recall 和网关范围内的其他工具。因此,你看到的工具数量会多于此表所列:单个数据包端点目前会在该数据包自身的工具之外,列出大约 30 个共享工具。连接的 initialize 响应会说明其确切范围,并且是了解当日情况的权威依据。

这是有意为之,并非意外复用。元工具让限定范围的连接也能回答此数据包未涵盖的问题 — 通过可路由至整个目录的 ask_pipeworx — 而无需添加第二个 MCP 服务。目前无法挂载不含这些工具的数据包端点;如果额外的架构定义占用的上下文超过了路由带来的价值,请连接一次完整网关,而不是连接多个数据包端点。

或者,连接完整的 Pipeworx 网关,直接列出所有数据包的工具,而不只是此数据包的工具:

{
  "mcpServers": {
    "pipeworx": {
      "url": "https://gateway.pipeworx.io/mcp"
    }
  }
}

两个 URL 都连接到同一个网关和相同的 1683+ 个数据源。唯一的区别是哪些数据包的工具会被直接列出;通过任一端点,ask_pipeworx 都可以访问所有工具。

没有 MCP 客户端?通过 HTTP 调用

curl -X POST https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/mydisease_query \
  -H 'Content-Type: application/json' \
  -d '{"query":"diabetes"}'

首次调用无需账户。检查任意工具:GET https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/mydisease_query。查找工具:使用 {"query":"..."} 调用 POST https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/search_packs。

独立运行(无需网关账户)

此软件包也可作为本地 stdio MCP 服务运行 — 无需 Pipeworx 账户,也无需经由网关往返:

{
  "mcpServers": {
    "mydisease": {
      "command": "npx",
      "args": ["-y", "@pipeworx/mcp-mydisease"]
    }
  }
}

也可以直接运行,以确认它能够启动:

npx -y @pipeworx/mcp-mydisease

它通过 stdin/stdout 使用 MCP 通信,并响应 initialize/tools/list/tools/call,仅提供此数据包的工具 — 不包含上述网关连接额外提供的任何共享元工具。数据源相同,工具相同,但没有 ask_pipeworx 路由。

使用 ask_pipeworx

你可以用通俗易懂的语言提问,而不是直接调用工具 — 此功能既适用于上述数据包端点,也适用于完整网关:

ask_pipeworx({ question: "your question about Mydisease data" })

网关会自动选择合适的工具并填入参数。

更多信息

许可证

MIT

评论

支持 Markdown

第一次接触 MCP?

从协议是什么,到在客户端里装上第一个服务,这几条回答覆盖了大多数入门问题。

一个开放协议,规定了 AI 应用如何以统一方式连接外部工具与数据源。客户端负责与模型对话,MCP 服务负责提供工具、资源和提示模板,两者通过标准消息通信,同一个服务可以被不同客户端复用。