Mygene Info

@pipeworx/mygene-info

MyGene.info MCP — 来自 BioThings 的基因注释服务（NCBI、Ensembl、UniProt、KEGG、OMIM 等，按基因整合）。无需密钥。

属于 Pipeworx — 一个连接 AI Agent 与 1683+ 个实时数据源的 MCP 网关。

工具

• query(query, species?, fields?, size?, sort?) — 全文基因查询
• gene(gene_id, fields?, species?) — 某个基因 ID（Entrez 或 Ensembl）的注释
• query_many(ids, scopes?, species?, fields?) — 批量查询
• metadata() — 版本 / 来源元数据
• taxonomy(species) — 物种分类信息

数据源

https://mygene.info/v3/

快速开始

添加到你的 MCP 客户端（Claude Desktop、Cursor、Windsurf 等）：

{
  "mcpServers": {
    "mygene-info": {
      "url": "https://gateway.pipeworx.io/mygene-info/mcp"
    }
  }
}

此端点实际提供的内容

https://gateway.pipeworx.io/mygene-info/mcp 上的 tools/list 会返回上表中的工具，以及 Pipeworx 的共享元工具——ask_pipeworx、 discover_tools、search_within、remember/recall 及其他全网关工具。因此，你看到的工具数量会多于此表：目前，单个工具包端点除了自身工具包的工具外，还会列出大约 30 个共享工具。连接的 initialize 响应会说明其确切范围，这是当日情况的权威说明。

这是有意为之，并非意外的多路复用。元工具让受限连接可以通过 ask_pipeworx（它会在整个目录中路由）回答此工具包无法覆盖的问题，无需再添加第二个 MCP 服务。目前无法挂载不包含这些元工具的工具包端点；如果额外的模式消耗的上下文超过了路由带来的价值，请连接一次完整网关，而不是连接多个工具包端点。

或者连接完整的 Pipeworx 网关，直接列出所有工具包的工具，而不仅是此工具包的工具：

{
  "mcpServers": {
    "pipeworx": {
      "url": "https://gateway.pipeworx.io/mcp"
    }
  }
}

这两个 URL 都连接到同一个网关和相同的 1683+ 个数据源。唯一的区别是直接列出哪个工具包的工具；从任一端点都可以通过 ask_pipeworx 访问所有工具。

没有 MCP 客户端？通过 HTTP 调用

curl -X POST https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/mygene_info_query \
  -H 'Content-Type: application/json' \
  -d '{"query":"BRCA1"}'

首次调用无需账户。查看任意工具：GET https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/mygene_info_query。查找工具：使用 {"query":"..."} 向 POST https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/search_packs 发送请求。

独立运行（无需网关账户）

此软件包也可以作为本地 stdio MCP 服务运行——无需 Pipeworx 账户，也无需经过网关往返：

{
  "mcpServers": {
    "mygene-info": {
      "command": "npx",
      "args": ["-y", "@pipeworx/mcp-mygene-info"]
    }
  }
}

或者直接运行，以确认它能正常启动：

npx -y @pipeworx/mcp-mygene-info

它通过 stdin/stdout 使用 MCP 通信，并为仅此工具包的工具响应 initialize/tools/list/tools/call——不包含上述网关连接所添加的共享元工具。数据源相同，工具相同，但没有 ask_pipeworx 路由。

使用 ask_pipeworx

你可以用通俗的英语提问，而不是直接调用工具——无论使用上面的工具包端点还是完整网关，都可以这样操作：

ask_pipeworx({ question: "your question about Mygene Info data" })

网关会选择合适的工具并自动填入参数。

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• 文档和指南
• pipeworx.io

许可证

MIT