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Obis

Obis

远程服务
pipeworx.io科研与教育05 周前更新

关于 Obis

Obis 是面向海洋生物多样性数据的 MCP 服务,可供研究人员和数据分析者查询 OBIS。它提供物种分类解析、地理出现记录检索及分类群统计,并可独立通过 stdio 运行。

主要功能

  1. 01解析海洋分类群名称及分类信息
  2. 02按名称检索地理出现记录
  3. 03按日期范围筛选记录
  4. 04获取分类群汇总统计

适用场景

  1. 01确认海洋物种的分类记录
  2. 02查看物种出现位置与日期
  3. 03汇总分类群的记录和数据集

MCP 相关

向 MCP 客户端提供 OBIS 分类信息、出现记录和统计工具;可连接 Pipeworx 网关,也可作为本地 stdio MCP 服务运行。

配置

远程服务无需本地安装。选择你使用的客户端,复制配置或使用一键安装。

服务地址https://gateway.pipeworx.io/obis/mcp
一键复制安装命令
Claude CodeTerminal
Cursor.cursor/mcp.json
VS Code.vscode/mcp.json
Claude Desktopclaude_desktop_config.json
Windsurf~/.codeium/windsurf/mcp_config.json

命令在终端中运行;JSON 粘贴到对应客户端的 MCP 配置后重启。需要授权的服务会在首次连接时提示登录。

工具

详细介绍

mcp-obis

OBIS(海洋生物多样性信息系统)MCP。

属于 Pipeworx — 一个将 AI Agent 连接到 1683+ 个实时数据源的 MCP 网关。

工具

工具描述
get_taxon在 OBIS 中查询海洋物种/属/科名称,获取其分类单元记录(分类单元 ID、等级、接受名、界/门/科/属,以及出现记录总数)。OBIS 是全球海洋生物多样性出现记录数据库;与侧重海洋的 GBIF 形成互补。无需密钥。
find_occurrences在 OBIS 中查找某个学名对应的海洋地理参考出现记录(纬度、经度、日期、深度、国家/地区、地点、记录依据)。可按日期范围筛选。返回匹配总数和一组记录样本。
get_statistics获取某个海洋分类单元的 OBIS 汇总统计数据:出现记录总数、不同物种/分类单元数量、贡献数据集,以及观测年份范围。

快速开始

添加到你的 MCP 客户端(Claude Desktop、Cursor、Windsurf 等):

{
  "mcpServers": {
    "obis": {
      "url": "https://gateway.pipeworx.io/obis/mcp"
    }
  }
}
此端点实际提供的内容

https://gateway.pipeworx.io/obis/mcp 上的 tools/list 会返回上表中的工具,以及 Pipeworx 共享元工具——ask_pipeworx、 discover_tools、search_within、remember/recall,以及网关范围内的其他工具。因此,你看到的工具数量会多于此表中的数量:目前,单个工具包端点除了该工具包自身的工具外,还会列出大约 30 个共享工具。连接的 initialize 响应会说明其确切范围,是当天准确情况的权威依据。

这是有意为之,并非意外进行了多路复用。元工具可以让限定范围的连接通过 ask_pipeworx 跨整个目录进行路由,从而回答此工具包无法涵盖的问题,无需再添加第二个 MCP 服务。目前无法挂载不包含这些元工具的工具包端点;如果额外的架构定义占用的上下文超过路由带来的价值,请连接一次完整网关,而不要连接多个工具包端点。

你也可以连接完整的 Pipeworx 网关,直接列出每个工具包的工具,而不只是当前工具包的工具:

{
  "mcpServers": {
    "pipeworx": {
      "url": "https://gateway.pipeworx.io/mcp"
    }
  }
}

两个 URL 都连接到同一个网关和相同的 1683+ 个数据源。直接列出的工具包不同而已;无论连接哪一个,ask_pipeworx 都能访问所有工具。

没有 MCP 客户端?通过 HTTP 调用

curl -X POST https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/obis_get_taxon \
  -H 'Content-Type: application/json' \
  -d '{"name":"Orcinus orca"}'

首次调用无需账户。查看任意工具:GET https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/obis_get_taxon。查找工具:使用 {"query":"..."} 调用 POST https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/search_packs。

独立运行(无需网关账户)

此软件包也可作为本地 stdio MCP 服务运行——无需 Pipeworx 账户,也无需经过网关:

{
  "mcpServers": {
    "obis": {
      "command": "npx",
      "args": ["-y", "@pipeworx/mcp-obis"]
    }
  }
}

或者直接运行,确认它可以启动:

npx -y @pipeworx/mcp-obis

它通过 stdin/stdout 使用 MCP,并针对仅此工具包的工具响应 initialize/tools/list/tools/call——不包含上述网关连接会添加的任何共享元工具。数据源相同,工具相同,但不提供 ask_pipeworx 路由。

使用 ask_pipeworx

你也可以用通俗英语提问,而不是直接调用工具——此功能既适用于上面的工具包端点,也适用于完整网关:

ask_pipeworx({ question: "your question about Obis data" })

网关会选择合适的工具,并自动填写参数。

更多内容

许可证

MIT

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第一次接触 MCP?

从协议是什么,到在客户端里装上第一个服务,这几条回答覆盖了大多数入门问题。

一个开放协议,规定了 AI 应用如何以统一方式连接外部工具与数据源。客户端负责与模型对话,MCP 服务负责提供工具、资源和提示模板,两者通过标准消息通信,同一个服务可以被不同客户端复用。