Opentargets

@pipeworx/opentargets

Open Targets MCP — 疾病／靶点／药物知识图谱，整合遗传、基因组、转录组和化学证据。无需密钥的 GraphQL 公共端点。

属于 Pipeworx — 一个将 AI Agent 连接到 1683+ 个实时数据源的 MCP 网关。

工具

• target(ensembl_id) — 靶点（基因）档案
• disease(efo_id) — 疾病档案
• drug(chembl_id) — 药物档案
• search(query, entity?, size?) — 平台搜索
• target_associations(ensembl_id, size?) — 某靶点关联度最高的疾病
• disease_associations(efo_id, size?) — 某疾病关联度最高的靶点
• target_known_drugs(ensembl_id, size?) — 针对某靶点进行过临床测试的药物

数据源

https://api.platform.opentargets.org/api/v4/graphql

快速开始

添加到你的 MCP 客户端（Claude Desktop、Cursor、Windsurf 等）：

{
  "mcpServers": {
    "opentargets": {
      "url": "https://gateway.pipeworx.io/opentargets/mcp"
    }
  }
}

此端点实际提供的内容

https://gateway.pipeworx.io/opentargets/mcp 上的 tools/list 会返回上表中的工具，以及 Pipeworx 通用元工具 — ask_pipeworx、 discover_tools、search_within、remember／recall，以及网关范围内的其他工具。因此，你看到的工具数量会多于此表：目前，单个工具包端点除了工具包自身的工具外，还会列出约 30 个通用工具。连接的 initialize 响应会说明其确切范围，也是当天适用的权威信息。

这是有意为之，并非意外的多路复用。元工具让受限连接也能回答本工具包未涵盖的问题 — 通过 ask_pipeworx 跨整个目录路由 — 无需你再添加第二个 MCP 服务。目前无法挂载不含这些元工具的工具包端点；如果额外的架构信息占用的上下文超过了路由带来的价值，请直接连接一次完整网关，而不是连接多个工具包端点。

或者连接完整的 Pipeworx 网关，直接列出所有工具包的工具，而不只是当前工具包的工具：

{
  "mcpServers": {
    "pipeworx": {
      "url": "https://gateway.pipeworx.io/mcp"
    }
  }
}

两个 URL 都会连接到同一个网关和同一批 1683+ 个数据源。唯一的区别是哪个工具包的工具会被直接列出；无论连接哪个端点，ask_pipeworx 都能访问所有工具。

没有 MCP 客户端？通过 HTTP 调用

curl -X POST https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/opentargets_target \
  -H 'Content-Type: application/json' \
  -d '{"ensembl_id":"ENSG00000141510"}'

首次调用无需账户。检查任意工具：GET https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/opentargets_target。查找工具：使用 {"query":"..."} 向 POST https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/search_packs 发送请求。

独立运行（无需网关账户）

此软件包也可以作为本地 stdio MCP 服务运行 — 无需 Pipeworx 账户，也无需经过网关：

{
  "mcpServers": {
    "opentargets": {
      "command": "npx",
      "args": ["-y", "@pipeworx/mcp-opentargets"]
    }
  }
}

也可以直接运行以确认服务已启动：

npx -y @pipeworx/mcp-opentargets

它通过 stdin/stdout 使用 MCP 协议，并仅对本工具包的工具响应 initialize／tools/list／tools/call — 不包含上述网关连接额外提供的任何通用元工具。数据源相同，工具相同，但没有 ask_pipeworx 路由。

使用 ask_pipeworx

你可以用通俗的语言提问，而不是直接调用工具 — 这既适用于上面的工具包端点，也适用于完整网关：

ask_pipeworx({ question: "your question about Opentargets data" })

网关会自动选择合适的工具并填入参数。

更多信息

• 文档和指南
• pipeworx.io

许可证

MIT