关于 Sgd
Sgd 是面向酿酒酵母遗传数据的 MCP 服务,可查询 SGD 中的基因、遗传位点及 GO 注释。提供网关连接和本地 stdio 运行方式。
主要功能
- 01按名称或 SGDID 查询基因
- 02搜索基因、位点及其他实体
- 03获取基因 GO 注释
- 04支持网关与本地 stdio 运行
适用场景
- 01查找酿酒酵母基因信息
- 02检索基因本体注释
- 03按自由文本搜索 SGD 实体
MCP 相关
向 MCP 客户端提供基因查询、实体搜索和 GO 注释工具;可通过 Pipeworx 网关或本地 stdio 连接。
配置
远程服务无需本地安装。选择你使用的客户端,复制配置或使用一键安装。
https://gateway.pipeworx.io/sgd/mcpclaude mcp add --transport http pipeworx-io-sgd https://gateway.pipeworx.io/sgd/mcp{"mcpServers":{"pipeworx-io-sgd":{"type":"http","url":"https://gateway.pipeworx.io/sgd/mcp"}}}在 Cursor 中打开{"servers":{"pipeworx-io-sgd":{"type":"http","url":"https://gateway.pipeworx.io/sgd/mcp"}}}在 VS Code 中打开{"mcpServers":{"pipeworx-io-sgd":{"type":"http","url":"https://gateway.pipeworx.io/sgd/mcp"}}}{"mcpServers":{"pipeworx-io-sgd":{"serverUrl":"https://gateway.pipeworx.io/sgd/mcp"}}}命令在终端中运行;JSON 粘贴到对应客户端的 MCP 配置后重启。需要授权的服务会在首次连接时提示登录。
工具
详细介绍
mcp-sgd
SGD(Saccharomyces Genome Database)MCP。
属于 Pipeworx —— 一个将 AI Agent 连接到 1683+ 个实时数据源的 MCP 网关。
工具
| 工具 | 描述 |
|---|---|
get_gene | 在 SGD(Saccharomyces Genome Database,权威的出芽酵母遗传学资源)中查找单个酵母(S. cerevisiae)基因/位点。接受系统名称(例如 YAL001C)、标准基因名称(例如 TFC3)或 SGDID(例如 S000000001)。返回标准名称、系统名称、SGDID、描述、位点类型和别名。无需密钥。 |
search_genes | 通过自由文本查询在 SGD(Saccharomyces Genome Database,权威的出芽酵母/S. cerevisiae 遗传学资源)中搜索基因、位点、等位基因和其他实体。返回匹配结果及其名称、类别和 href。无需密钥。 |
get_gene_go | 从 SGD(Saccharomyces Genome Database)获取酵母(S. cerevisiae)基因/位点的基因本体(GO)注释。接受系统名称(例如 YAL001C)、标准基因名称(例如 TFC3)或 SGDID(例如 S000000001)。返回 GO 术语及其 GO ID、类别(分子功能/生物过程/细胞组分)和支持证据。无需密钥。 |
快速开始
添加到你的 MCP 客户端(Claude Desktop、Cursor、Windsurf 等):
{
"mcpServers": {
"sgd": {
"url": "https://gateway.pipeworx.io/sgd/mcp"
}
}
}
此端点实际提供的内容
https://gateway.pipeworx.io/sgd/mcp 上的 tools/list 会返回上表中的工具,以及 Pipeworx 共享元工具——ask_pipeworx、
discover_tools、search_within、remember/recall 和网关级工具集中的其他工具。因此,你看到的工具数量会多于此表:目前,单个工具包端点除了该工具包自身的工具,还会列出大约 30 个共享工具。连接的 initialize 响应会说明其确切范围,是当天情况的权威信息。
这是有意设计的,并非意外复用。元工具让限定范围的连接也能回答此工具包未覆盖的问题——通过可跨整个目录路由的
ask_pipeworx——无需再添加第二个 MCP 服务。目前无法挂载不包含这些元工具的工具包端点;如果额外的架构占用的上下文超过了路由功能带来的价值,请连接一次完整网关,而不是连接多个工具包端点。
你也可以连接完整的 Pipeworx 网关,直接获取所有工具包列出的工具,而不只是此工具包的工具:
{
"mcpServers": {
"pipeworx": {
"url": "https://gateway.pipeworx.io/mcp"
}
}
}
两个 URL 都会连接到同一个网关和相同的 1683+ 个数据源。唯一的区别是,哪些工具包的工具会被直接列出;无论连接哪一个,ask_pipeworx 都能访问所有工具。
没有 MCP 客户端?通过 HTTP 调用
curl -X POST https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/sgd_get_gene \
-H 'Content-Type: application/json' \
-d '{"id":"YAL001C"}'
首次调用无需账户。检查任意工具:GET https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/sgd_get_gene。查找工具:使用 {"query":"..."} 调用 POST https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/search_packs。
独立运行(无需网关账户)
此软件包也可以作为本地 stdio MCP 服务运行——无需 Pipeworx 账户,也无需经过网关:
{
"mcpServers": {
"sgd": {
"command": "npx",
"args": ["-y", "@pipeworx/mcp-sgd"]
}
}
}
或者直接运行,确认它可以启动:
npx -y @pipeworx/mcp-sgd
它通过 stdin/stdout 使用 MCP 通信,并响应 initialize/tools/list/tools/call,仅提供此工具包的工具——不包含上文网关连接额外提供的任何共享元工具。数据源相同,工具相同,但不支持 ask_pipeworx 路由。
使用 ask_pipeworx
你也可以用日常语言提问,而不是直接调用工具——此方式既适用于上文的工具包端点,也适用于完整网关:
ask_pipeworx({ question: "your question about Sgd data" })
网关会选择合适的工具并自动填充参数。
更多信息
许可证
MIT
评论
一个开放协议,规定了 AI 应用如何以统一方式连接外部工具与数据源。客户端负责与模型对话,MCP 服务负责提供工具、资源和提示模板,两者通过标准消息通信,同一个服务可以被不同客户端复用。