pubchem mcp server

Name: pubchem mcp server
Author: sssjiang

本地服务

github.com/sssjiang科研与教育1137 周前更新

代码仓库

关于 pubchem mcp server

pubchem mcp server 通过 PubChem API 获取药物的基础化学信息，适用于需要查询药物标识符和分子属性的 MCP 客户端。

主要功能

01通过 PubChem API 查询药物
02获取 CAS 编号
03获取分子式和分子量
04获取 SMILES 和同义词

适用场景

01查询指定药物的化学信息
02查找 CAS 编号和分子属性

MCP 相关

向 MCP 客户端提供从 PubChem API 获取的药物化学信息。

#pubchem #mcp #drug-information

配置

本地服务的配置在各客户端中通用，复制后粘贴到客户端的 MCP 配置文件即可。

mcp.json · 通用配置

{
  "mcpServers": {
    "pubchem_mcp_server": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "pubchem_mcp_server"
      ]
    }
  }
}

启动命令uvx pubchem_mcp_server

本地服务需要在你的电脑上安装运行环境（如 Node.js 18+）。各客户端的配置文件位置不同，请参考客户端文档。

安装包

pypipubchem_mcp_serverstdio

工具

还没有获取到工具列表

本地服务需要在你的电脑上运行后才能读取工具，维护者暂未提供工具列表。

详细介绍

pubchem MCP 服务

此 MCP 用于从 PubChem API 提取药物的基本化学信息。

要求

Python 3.10
python-dotenv
requests
mcp
uvicorn

安装

安装依赖项（本地）：

git clone [project repository URL]
cd [project directory]
pip install .

配置服务（PyPI）：

servers_config.json 的结构与 Claude Desktop 相同，可轻松集成多个服务。示例：

{
  "mcpServers": {
    "pubchem": {
      "command": "uvx",
      "args": ["pubchem_mcp_server"]
    }
  }
}

此 MCP 的结果

{
  "Drug Name": "Aspirin",
  "CAS Number": "50-78-2",
  "Molecular Weight": 180.16,
  "Molecular Formula": "C9H8O4",
  "SMILES": "CC(=O)OC1=CC=CC=C1C(=O)O",
  "Synonyms": [
    "2-(Acetyloxy)benzoic Acid",
    "Acetylsalicylic Acid",
    "Acetysal",
    "Acylpyrin",
    "Aloxiprimum",
    "Aspirin",
    "Colfarit",
    "Dispril",
    "Easprin"
  ],
  "InchI Key": "BSYNRYMUTXBXSQ-UHFFFAOYSA-N",
  "IUPAC Name": "2-acetyloxybenzoic acid",
  "ATC Code": "N02BA01",
  "Details Link": "https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/compound/2244"
}

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