Phở Research Tools

Phở Research Tools

一款开源 MCP 服务，让任何 AI 助手都能核查自己的参考文献。 它使用 Crossref、PubMed、OpenAlex、Europe PMC、DataCite、bio.tools 等开放数据库，验证引文、标记撤稿、查找支持某项主张的最强证据、整理参考文献格式、执行 PRISMA 2020 筛选，并查找开放数据集和研究软件。

AI 模型会编造参考文献。此服务让 Claude、ChatGPT、Cursor 或任何 MCP 客户端都能在你信任某条参考文献之前，先在公共数据库中查证。

工具	功能
verify_references	检查每条参考文献：已验证、真实但细节有误（并提供更正后的记录）、疑似编造、未找到、已撤稿或存在歧义。
check_retractions	检查 DOI 列表中的撤稿、关注声明和更正通知。
search_papers	搜索 OpenAlex 和 PubMed。每条结果都有 DOI 或 PMID；排除已撤稿的论文，并标注预印本。
format_citations	根据真实记录整理为 APA 7、MLA 9、Chicago、Harvard、Vancouver、IEEE 或 AMA 格式，也支持 BibTeX、RIS 和 CSL-JSON。
prisma_flow_diagram	生成 PRISMA 2020 流程图（PNG + SVG），并检查计数是否一致。
find_evidence	查找支持某项主张的最强证据，按证据等级排序（指南、荟萃分析、RCT 等），并逐字引用每项证据的结论。
screening_log	将筛选决定转换为 PRISMA 计数、流程图和 CSV 日志，并列出审稿人会发现的问题。
find_datasets	根据研究问题查找开放数据集，提供许可证判定、已验证的来源论文和可分享的摘要。
find_tools	从 bio.tools 注册表中查找适用于某项任务的研究软件，提供许可证判定、已验证的论文、维护状态标签和安装命令。

这九种工具均为只读。结果来自数据库查询，而非模型观点： likely_fabricated 表示该 DOI 未注册或没有匹配记录；find_evidence 不会判断某篇论文是否支持某项主张，而是提供论文中引用的结论。

使用托管服务（无需安装）

将此 URL 添加为客户端中的自定义连接器 / MCP 服务：

https://mcp.pho.chat/mcp

• Claude Code： claude mcp add --transport http pho-research https://mcp.pho.chat/mcp
• Claude（网页端、桌面端）： Settings → Connectors → Add custom connector。
• ChatGPT： Settings → Apps & Connectors → Developer mode → Create。
• Cursor、VS Code 等： 请参阅 apps/mcp/README.md。

无需账号。匿名使用有每日额度；在 pho.chat 注册免费账号即可提高额度。更喜欢网页？同样的工具也可在 pho.chat/tools 使用。

Verified Citations 技能

此仓库还提供 Verified Citations，这是一项 Agent Skill，可让助手对其撰写的每条参考文献都使用上述工具：使用 search_papers 查找来源，而不是凭记忆引用；展示内容前运行 verify_references；使用 format_citations 整理格式；并说明哪些参考文献已更正、撤稿或移除。

Claude Code（插件：一步安装技能和 MCP 服务）

claude plugin marketplace add thaohienhomes/pho-research-tools
claude plugin install verified-citations@pho-research-tools

该插件会添加此技能并连接 pho-research MCP 服务。运行 /mcp，检查服务是否显示为已连接。从本地检出目录安装时，请将文件夹路径传递给 marketplace add。

Cursor（Agent 插件：一步安装 skill + MCP 服务）

仓库根目录是一个 Agent 插件：plugin.json 为插件命名，skills/ 存放 skill，mcp.json 连接 https://mcp.pho.chat/mcp 上的 pho-research 服务。Cursor 会直接加载：

• **Teams 和 Enterprise：**Dashboard → Plugins & MCPs → Add Marketplace → Import from Repo，然后粘贴 https://github.com/thaohienhomes/pho-research-tools。
• **本地：**将此仓库克隆或复制到 ~/.cursor/plugins/local/verified-citations，运行 Developer: Reload Window，并在 Customize 下检查是否列出了该插件和 pho-research MCP 服务。

插件徽标位于 assets/logo.svg。支持邮箱：[email protected]。

skills.sh（Claude Code、Cursor、Codex、Gemini CLI 和其他 Agent）

npx skills add thaohienhomes/pho-research-tools --skill verified-citations

此操作只会安装 skill。还需在 Agent 中连接 MCP 服务，例如在 Claude Code 中：

claude mcp add --transport http pho-research https://mcp.pho.chat/mcp

ClawHub（OpenClaw）

clawhub install verified-citations

然后在 OpenClaw 中将 https://mcp.pho.chat/mcp 添加为远程 MCP 服务。

Claude.ai、ChatGPT 和其他平台

添加 https://mcp.pho.chat/mcp 作为自定义连接器；各应用的分步说明见 https://pho.chat/tools/mcp/。如果没有连接器，可将参考文献列表粘贴到免费的检查工具 https://pho.chat/tools/citation-checker/ 中。

自行运行

需要 Node 22+ 和 pnpm 9。

pnpm install
pnpm dev            # http://localhost:8787/mcp

本地运行时所有设置均为可选；请参阅 apps/mcp/.env.example。apps/mcp/ 中提供了 Dockerfile（docker build -f apps/mcp/Dockerfile -t pho-mcp .）。

仓库结构

路径	内容
apps/mcp	MCP 服务（Streamable HTTP、Hono）。配额、可选登录和分析功能默认均关闭，除非进行配置。
packages/scholar-core	验证、撤稿检查、搜索、引用格式化和 PRISMA 渲染。纯 TypeScript，不使用 AI SDK 或数据库。
packages/citation-engine	DOI、BibTeX 和 RIS 解析及 Crossref 辅助工具。
docs/samples/scholar-core	示例输出，由测试套件重新生成并检查。
skills/verified-citations	Verified Citations Agent Skill。
.claude-plugin/、.mcp.json	Claude Code 插件 + 单插件市场（一次安装 skill 和 MCP 服务）。
plugin.json、mcp.json	面向 Cursor 和其他 Agent Plugins 客户端的 Agent Plugin 清单（从 skills/ 中查找 skills）。
assets/logo.svg	插件徽标，是 apps/mcp/public/icon.png 的矢量版本。
server.json、glama.json	MCP Registry 条目（由 .github/workflows/publish-mcp-registry.yml 发布）和 Glama 维护者认领信息。

pnpm test        # 190 tests, all replaying recorded API responses
pnpm typecheck

仅使用开放数据

此服务调用的所有数据源都提供开放 API 和开放元数据。不会获取或存储任何付费墙后的内容。内嵌的 CSL 样式采用 CC BY-SA 3.0 许可；详情见 NOTICE.md。

隐私

托管服务接收并保留哪些数据：https://pho.chat/tools/privacy/

贡献与许可证

欢迎提交问题和拉取请求；请先阅读 CONTRIBUTING.md。 安全问题报告请见 SECURITY.md。

代码采用 MIT 许可证。由 Phở 构建，这是一个面向医生和科学家的研究工作空间。

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Tiếng Việt: Phở Research Tools 是一款开源 MCP 服务，可帮助 AI 助手自行检查参考文献（验证引文、检查撤稿、格式化以及绘制 PRISMA 2020 流程图），仅使用开放的科学数据。