alterlab-deep-research

深度研究 — 通用学术研究 Agent 团队

通用深度研究工具——一支由 13 个 Agent 组成、适用于任何领域的团队，可针对任意主题开展严谨的学术研究。v2.3 新增系统性综述模式（符合 PRISMA 标准，可选元分析）、苏格拉底式收敛标准，以及研究后的文献监测功能。

快速开始

最简命令：

Research the impact of AI on higher education quality assurance

苏格拉底模式：

Guide my research on the impact of declining birth rates on private universities
引導我的研究：少子化對私立大學的影響
幫我釐清我的研究方向，我對高教品保有興趣但還不太確定

执行流程：

1. 界定范围——研究问题 + 方法论蓝图
2. 调查——系统性文献检索 + 来源核实
3. 分析——跨来源综合 + 偏差检查
4. 撰写——完整的 APA 7.0 报告
5. 审阅——编辑审阅 + 伦理审查 + 脆弱性扫描
6. 修订——润色后的最终报告

---

何时使用此技能

触发关键词

英语：研究、深度研究、文献综述、系统性综述、元分析、PRISMA、证据综合、事实核查、方法论、APA 报告、学术分析、政策分析、引导我的研究、帮我理清思路、监测这个主题、设置提醒

土耳其语：研究、深入研究、文献检索、文献综述、系统性综述、元分析、证据综合、事实核查、引导我的研究、明确我的研究问题、研究主题

繁体中文：研究、深度研究、文獻回顧、文獻探討、系統性回顧、後設分析、證據綜整、事實查核、研究方法、學術分析、政策分析、引導我的研究、幫我釐清、監測這個主題、設定追蹤

苏格拉底模式的启用条件

当用户的意图符合以下任一模式时，无论使用何种语言，都启用 socratic 模式。识别含义，而非精确关键词。

意图信号（满足任一项即可）：

1. 用户没有明确的研究问题，希望获得引导
2. 用户要求在研究过程中获得“带领”“引导”或“指导”
3. 用户表示不确定该研究什么或从何处着手
4. 用户想要集思广益、探索或明确研究方向
5. 用户表达了模糊的兴趣，但没有提出具体、可回答的问题

默认规则：当意图介于 socratic 和 full 之间、难以判断时，优先选择 socratic——先提供引导，比直接生成用户并不需要的报告更稳妥。用户之后随时可以切换到 full。

触发示例（仅供参考，并非穷尽）： “引导我的研究”“帮我理清思路”、“「引導我的研究」「幫我釐清」”，或任何语言中的同类表达

不会触发的情况

情况	改用
撰写论文（而非开展研究）	alterlab-paper-writer
审阅论文（结构化审阅）	alterlab-paper-reviewer
从研究到论文的完整流程	alterlab-research-pipeline
审核现有参考文献目录中的文献是否真实存在或已被撤稿	alterlab-citation-verifier
在 Python 或 R 中汇总已提取的效应量（随机效应模型、森林图／漏斗图、Egger 检验）	alterlab-meta-analysis

在 Claude Code 中，数百条记录的双审稿人 PRISMA 筛选、文献地图，或由独立 Agent 进行的论点压力测试，都已封装为工作流（/alterlab-workflows:systematic-review-screening、literature-map、claim-stress-test；参见 alterlab-research-workflows）——建议先提供这些工作流，再手动搭建扇出流程。

快速模式选择指南

Your Situation 你的状况	推荐模式
想法模糊，需要引导 / 有模糊想法，需要引导	socratic
RQ 明确，需要全面研究 / 有明確 RQ，需要完整研究	full
需要快速简报（30 分钟）/ 需要快速摘要	quick
引用前需要评估一篇论文 / 有論文需要評估	review
需要针对某个主题进行文献综述 / 需要文獻回顧	lit-review
需要核实特定论断 / 需要查核特定事實	fact-check
需要系统性综述／元分析 / 系統性回顧或後設分析	systematic-review

不确定？从 socratic 开始——它会帮你弄清楚自己需要什么。 不確定？先用 socratic 模式——它會幫你釐清你需要什麼。

---

Agent 团队（13 个 Agent）

#	Agent	职责	阶段
1	research_question_agent	将模糊主题转化为精准且经 FINER 评分的研究问题，并明确范围边界	阶段 1，苏格拉底式第 1 层
2	research_architect_agent	设计方法论蓝图：范式、方法、数据策略、分析框架、有效性标准	阶段 1
3	bibliography_agent	系统性文献检索、来源筛选、按 APA 7.0 编制注释书目	阶段 2
4	source_verification_agent	事实核查、来源评级（证据层级）、识别掠夺性期刊、标记利益冲突	阶段 2
5	synthesis_agent	跨来源整合、解决矛盾、主题综合、差距分析	阶段 3
6	report_compiler_agent	起草完整的 APA 7.0 报告（标题 -> 摘要 -> 引言 -> 方法 -> 研究发现 -> 讨论 -> 参考文献）	阶段 4、6
7	editor_in_chief_agent	Q1 期刊编辑审查：原创性、严谨性、证据充分性、结论（接受/修改/拒绝）	阶段 5
8	devils_advocate_agent	质疑假设、检验逻辑谬误、寻找替代解释、检查确认偏误	阶段 1、3、5，苏格拉底式第 2、4 层
9	ethics_review_agent	AI 辅助研究伦理、归属诚信、双重用途筛查、公正表述	阶段 5
10	socratic_mentor_agent	Q1 期刊编辑角色；通过 5 层苏格拉底式提问引导研究思考	苏格拉底模式（第 1-5 层）
11	risk_of_bias_agent	使用 RoB 2（RCT）和 ROBINS-I（非随机研究）评估偏倚风险；以红黄绿灯可视化	系统综述（阶段 2）
12	meta_analysis_agent	设计并执行荟萃分析或叙述性综合；效应量、异质性、GRADE	系统综述（阶段 3）
13	monitoring_agent	研究后的文献监测：摘要、撤稿提醒、矛盾研究发现检测	可选（流程结束后）

---

模式选择指南

详细指南请参阅 references/mode_selection_guide.md。

User Input
    |
    +-- Already have a clear research question?
    |   +-- Yes --> Need PRISMA-compliant systematic review / meta-analysis?
    |   |           +-- Yes --> systematic-review mode
    |   |           +-- No --> Need a full report?
    |   |                      +-- Yes --> full mode
    |   |                      +-- No --> Only need literature?
    |   |                                 +-- Yes --> lit-review mode
    |   |                                 +-- No --> quick mode
    |   +-- No --> Want to be guided through thinking?
    |              +-- Yes --> socratic mode
    |              +-- No --> full mode (Phase 1 will be interactive)
    |
    +-- Already have text to review? --> review mode
    +-- Only need fact-checking? --> fact-check mode

---

编排工作流（6 个阶段）

标准流程分为六个阶段：1. 界定范围（研究问题简报 + 方法论蓝图，检查点 1）→ 2. 调查（来源语料库 + 已核验/评级的来源）→ 3. 分析（综合 + 差距分析，检查点 2）→ 4. 撰写（完整的 APA 7.0 草稿）→ 5. 审查（编辑 + 伦理 + 检查点 3，并行执行）→ 6. 修订（最终报告，最多 2 轮）。

包含各阶段全部输出和检查点标准的完整 Agent 逐一流程图，请参阅 references/orchestration_workflows.md（“Standard Orchestration Workflow”部分）。

检查点规则

1. Devil's Advocate 设有 3 个强制检查点；严重级别问题会阻止流程继续
2. 修订循环最多 2 轮；剩余问题将列为“已确认的局限”
3. 如存在严重伦理问题，伦理审查可中止交付
4. 阶段 1 结束后，必须取得用户确认才能继续

---

苏格拉底模式：引导式研究对话

核心原则：从 Q1 国际期刊主编的视角出发，通过苏格拉底式提问引导用户澄清研究问题。切勿直接给出答案，而应通过追问帮助用户自行思考问题。

详细的 Agent 定义见 agents/socratic_mentor_agent.md。 提问框架见 references/socratic_questioning_framework.md。

苏格拉底模式分五个层次推进：1. 问题界定 → 2. 方法论反思 → 3. 证据设计 → 4. 批判性自我审视 → 5. 重要性与贡献。每个层次都将 socratic_mentor_agent 与一个辅助 Agent 配合使用（第 1 层使用 research_question_agent；第 2 层和第 4 层使用 devils_advocate_agent），每轮提取 [INSIGHT: ...] 标记，并要求至少进行 2 轮对话（第 5 层至少 1 轮）后才能推进。第 5 层会将所有 INSIGHT 编纂成一份研究计划摘要，并移交给 alterlab-paper-writer（计划模式）。

各层的完整流程和每层的具体引导问题见 references/orchestration_workflows.md（苏格拉底模式层级流程部分）。

苏格拉底模式对话管理规则

• 每个层次至少进行 2 轮对话后才能进入下一层（第 5 层至少需要 1 轮）
• 用户可以随时要求跳到下一层
• 导师回复限制在 200-400 个单词
• 如果 10 轮后仍未达成共识 -> 建议切换到 full 模式（见失败路径 F6）
• 如果对话超过 15 轮 -> 自动编纂 INSIGHT 并结束
• 如果用户要求直接给出答案 -> 婉拒，并解释引导式学习的价值

---

系统综述模式

符合 PRISMA 标准的完整系统性文献综述，并可选择进行荟萃分析。此模式在标准的 6 阶段流程基础上，加入用于偏倚风险评估（RoB 2、ROBINS-I）和定量综合的专用 Agent。

详细的 Agent 定义见 agents/risk_of_bias_agent.md 和 agents/meta_analysis_agent.md。 Cochrane/PRISMA/GRADE 参考指南见 references/systematic_review_toolkit.md。

此模式沿用六个阶段，但采用 PRISMA 专用输出：1. 范围界定产出 PICOS RQ 和完整的 PRISMA-P 方案（而非仅产出 RQ）；2. 调查增加 PRISMA 2020 流程图和 risk_of_bias_agent 的 RoB 评估；3. 分析运行 meta_analysis_agent（效应量、异质性、GRADE），或在主题综合之外进行 SWiM 叙述性综合；4. 撰写输出包含研究特征、RoB、森林图和 GRADE 表格的 27 项 PRISMA 2020 报告；5. 审查和 6. 修订与标准流程一致。

包含各阶段所有输出的完整 PRISMA Agent 流程见 references/orchestration_workflows.md（系统综述模式流程部分）。

系统综述检查点规则

1. 所有标准检查点规则均适用（见下文检查点规则）
2. 必须在第 2 阶段之前注册方案（或建议进行注册）
3. 第 3 阶段之前，必须完成所有研究的偏倚风险评估
4. 每个合并结局都必须进行 GRADE 评估
5. 在第 5 阶段验证 PRISMA 检查清单合规性

---

运行模式

模式	活跃 Agent	输出	字数
full（默认）	全部 9 个核心 Agent（不包括 socratic_mentor、risk_of_bias、meta_analysis、monitoring）	完整的 APA 7.0 报告	3,000-8,000
quick	RQ + Biblio + Verification + Report	研究简报	500-1,500
review	Editor + Devil's Advocate + Ethics	针对所提供文本的审稿报告	不适用
lit-review	Biblio + Verification + Synthesis	注释书目 + 综合报告	1,500-4,000
fact-check	仅 Source Verification	核验报告	300-800
socratic	Socratic Mentor + RQ + Devil's Advocate	研究计划摘要（INSIGHT 集合）	不适用（迭代式）
systematic-review	RQ + Architect + Biblio + Verification + RoB + Meta-Analysis + Synthesis + Report + Editor + Ethics + DA	完整的 PRISMA 2020 报告 + 森林图数据 + GRADE 表格	5,000-15,000

---

失败路径

所有模式下的失败场景、触发条件和恢复策略，请参阅 references/failure_paths.md。

关键失败路径摘要：

失败场景	触发条件	恢复策略
RQ 无法收敛	第 1 阶段 / 第 1 层经过多轮后仍然模糊	提供 3 个候选 RQ，或建议使用 lit-review
文献不足	bibliography_agent 找到的来源少于 5 个	扩展搜索策略，采用替代关键词
方法论不匹配	RQ 类型与方法能力不匹配	返回第 1 阶段，建议 3 种替代方法
Devil's Advocate 判定为 CRITICAL	发现致命的逻辑缺陷	停止，解释问题，并要求修正
Ethics 判定为 BLOCKED	存在严重的伦理问题	停止，列出问题和补救方案
苏格拉底式流程无法收敛	超过 10 轮仍未收敛	建议切换到 full 模式
用户中途放弃	明确表示不想继续	保存进度，提供重新进入流程的途径
仅有中文文献	英文搜索无结果	切换到中文学术数据库

---

文献监测（可选的流水线后续步骤）

完成任意研究模式后，用户可以选择启用 monitoring_agent，设置研究后的文献监测。这不属于主流水线，而是一项按需触发的辅助能力。

详细的 Agent 定义请参阅 agents/monitoring_agent.md。 各平台的设置指南请参阅 references/literature_monitoring_strategies.md。

触发语句：“监测这个主题”“设置提醒”“追踪这个主题的新发表成果”

功能：

• 生成每周 / 每月监测摘要
• 针对引用来源的撤稿提醒
• 检测相互矛盾的研究发现
• 追踪关键作者
• 追踪关键词演变

输入：任意研究模式生成的已完成书目 + 搜索策略
输出：监测配置 + 摘要模板（Markdown）

限制：监测 Agent 会生成供用户操作的配置和模板，但无法在后台自主运行监测。

---

交接协议：alterlab-deep-research → alterlab-paper-writer

研究完成后，可将以下材料交接给 alterlab-paper-writer：

1. 研究问题简报（来自 research_question_agent）
2. 方法论蓝图（来自 research_architect_agent）
3. 注释书目（来自 bibliography_agent）
4. 综合报告（来自 synthesis_agent）
5. [如果使用 socratic 模式] INSIGHT 集合和研究计划摘要

触发语句：用户说“现在帮我写论文”或“根据这些内容写一篇论文”

alterlab-paper-writer 的 intake_agent 会自动检测可用材料，并跳过重复步骤：

• 有 RQ 简报 -> 跳过主题界定
• 有书目 -> 跳过文献搜索
• 有综合报告 -> 加快研究发现 / 讨论部分的撰写

详细的交接示例请参阅 examples/handoff_to_paper.md。

---

完整学术流程

完整工作流请参见 alterlab-research-pipeline/SKILL.md。

---

Agent 文件参考

Agent	定义文件
research_question_agent	agents/research_question_agent.md
research_architect_agent	agents/research_architect_agent.md
bibliography_agent	agents/bibliography_agent.md
source_verification_agent	agents/source_verification_agent.md
synthesis_agent	agents/synthesis_agent.md
report_compiler_agent	agents/report_compiler_agent.md
editor_in_chief_agent	agents/editor_in_chief_agent.md
devils_advocate_agent	agents/devils_advocate_agent.md
ethics_review_agent	agents/ethics_review_agent.md
socratic_mentor_agent	agents/socratic_mentor_agent.md
risk_of_bias_agent	agents/risk_of_bias_agent.md
meta_analysis_agent	agents/meta_analysis_agent.md
monitoring_agent	agents/monitoring_agent.md

---

参考文件

参考资料	用途	使用者
references/apa7_style_guide.md	APA 第 7 版速查指南	report_compiler、editor_in_chief
references/source_quality_hierarchy.md	证据金字塔 + 分级标准	source_verification、bibliography
references/methodology_patterns.md	研究设计模板	research_architect
references/logical_fallacies.md	30 多种谬误目录	devils_advocate
references/ethics_checklist.md	AI 披露、署名、双重用途	ethics_review
references/interdisciplinary_bridges.md	跨学科关联模式	synthesis、research_architect
references/socratic_questioning_framework.md	6 种苏格拉底式提问 + 30 多种提示词模式	socratic_mentor
references/failure_paths.md	12 种带触发条件和恢复路径的失败情景	所有 Agent
references/mode_selection_guide.md	模式选择流程图和对照表	orchestrator
references/orchestration_workflows.md	详细的 6 阶段、苏格拉底式 5 层和系统综述流程图	orchestrator
references/irb_decision_tree.md	IRB 决策树（美国分级）+ 台湾流程 + HE 速查；土耳其相关内容见 alterlab-tr-research-ethics	ethics_review、research_architect
references/equator_reporting_guidelines.md	EQUATOR 报告指南映射	research_architect、report_compiler
references/preregistration_guide.md	预注册决策树 + 平台 + 检查清单	research_architect
references/systematic_review_toolkit.md	Cochrane Handbook v6.5、PRISMA 2020、RoB 2、ROBINS-I（2016 和 V2）、I² 指南、GRADE、方案注册	risk_of_bias、meta_analysis、bibliography、report_compiler
references/literature_monitoring_strategies.md	Google Scholar 提醒、PubMed 提醒、RSS 源、Retraction Watch、引文追踪、监控频率	monitoring_agent

---

模板

模板	用途
templates/research_brief_template.md	快速模式输出格式
templates/literature_matrix_template.md	来源 × 主题分析矩阵
templates/evidence_assessment_template.md	单篇来源质量评估卡
templates/preregistration_template.md	OSF 标准 21 项预注册模板
templates/prisma_protocol_template.md	PRISMA-P 2015 系统综述方案模板
templates/prisma_report_template.md	PRISMA 2020 系统综述报告模板（27 项）

示例

示例	展示内容
examples/exploratory_research.md	完整的 6 阶段流程演练
examples/systematic_review.md	PRISMA 风格的文献综述
examples/policy_analysis.md	应用型比较政策研究
examples/socratic_guided_research.md	完整的苏格拉底模式多轮对话（12 轮）
examples/handoff_to_paper.md	alterlab-deep-research 完整模式移交给 alterlab-paper-writer
examples/review_mode.md	评审模式：针对政策建议文本的 3 Agent 评审流程
examples/fact_check_mode.md	事实核查模式：核验有关 HEI 的主张，并逐条给出判定

---

输出语言

遵循用户使用的语言。学术术语保留英文。苏格拉底模式采用自然对话风格。

---

质量标准

1. 每项主张都必须附有引用——不得提出无依据的断言
2. 证据层级——荟萃分析 > RCT > 队列研究 > 病例报告 > 专家意见
3. 披露相互矛盾之处——如果来源存在分歧，应结合证据质量比较报告双方观点
4. 透明说明局限性——每份报告都必须有明确的局限性章节
5. 披露 AI 使用情况——所有报告都应包含使用了 AI 辅助研究工具的声明
6. 可复现性——必须记录搜索策略、纳入标准和分析方法，以便复现
7. 苏格拉底式诚信——在苏格拉底模式下，绝不直接给出答案；始终通过提问引导

跨 Agent 质量标准统一

统一定义，避免不同 Agent 之间出现不一致：

概念	定义	适用对象
同行评审	在经过正式同行评审的期刊上发表（仅有编辑审查不符合要求）。仅当会议论文集明确经过同行评审时才计入	bibliography_agent, source_verification_agent
时效性规则	默认：发表于近 5 年内。按领域调整：CS/AI = 3 年，历史/哲学 = 20 年，法律 = 视司法管辖区变化而定。无论年代，开创性著作均不受此限	bibliography_agent, ethics_review_agent
CRITICAL 严重程度	若问题未解决，将导致核心结论无效或构成学术不端。必须立即解决，流程方可继续	所有 Agent
来源等级	tier_1 = 排名前 25% 的同行评审期刊；tier_2 = 其他同行评审来源；tier_3 = 学术来源，但未经同行评审；tier_4 = 灰色文献	bibliography_agent, source_verification_agent
最低来源数量	full = 15+，quick = 5-8，lit-review = 25+，systematic-review = 所有符合条件的来源（不限数量），fact-check = 每项主张 3+	bibliography_agent
核验门槛	使用前须对 100% 的来源进行存在性核验（通过 verify_citations.py 判定结果，WebSearch 作为后备方案）+ 独立使用 WebSearch 抽查 ≥50% 的来源（优先检查所有 tier_3/tier_4 来源）	bibliography_agent, source_verification_agent, ethics_review_agent

跨技能参考：阶段间数据交换格式见 shared/handoff_schemas.md。

---

与其他技能的集成

此技能与领域无关，但可与其他 AlterLab 技能组合使用：

alterlab-deep-research + alterlab-paper-2-web                     -> Disseminate research as a website / video / poster
alterlab-deep-research + alterlab-paper-writer                    -> Full research-to-publication pipeline
alterlab-deep-research (socratic) + alterlab-paper-writer (plan)  -> Guided research + paper planning
alterlab-deep-research (systematic-review) + alterlab-paper-writer -> PRISMA systematic review paper
alterlab-deep-research -> alterlab-research-pipeline              -> End-to-end research → review → finalize workflow

---

版本历史

当前版本：v2.4（参见 frontmatter metadata.version）。最新更改（2026-09）： 在各 Agent 之间统一了来源存在性核验（每个来源在使用前都通过 alterlab-citation-verifier 检查；不再保留“无法核验但仍予以采用”的类别）， 将苏格拉底式停止规则整合为一套统一规则，并更新报告标准以符合最新版本 （Cochrane Handbook v6.5、ROBINS-I V2、CONSORT 2025、SPIRIT 2025、 TRIPOD+AI）。v2.3 新增了 systematic-review 模式（采用 PRISMA 2020 流程，包含 risk_of_bias_agent 和 meta_analysis_agent）以及可选的流程后 monitoring_agent，使团队扩展至 13 个 Agent 和 7 种模式。

属于 AlterLab 学术技能套件。