关于 alterlab-ginkgo-cloud
alterlab-ginkgo-cloud 是使用 Ginkgo Cloud Lab 远程自动化实验室服务的研究技能，介绍现有实验方案及输入准备，并说明如何通过 EstiMate 评估自定义工作流的可行性与报价。
主要功能
- 01查看实验方案及要求
- 02准备序列或像素艺术输入
- 03了解结果内容与下单步骤
- 04通过 EstiMate 评估自定义工作流
- 05使用远程机器人实验室基础设施
适用场景
- 01筛查 DNA 序列的无细胞蛋白表达
- 02优化无细胞表达条件
- 03订购荧光细菌像素艺术
- 04评估自定义实验方案的可行性与报价
安装
复制下面的命令，在终端中运行。
npx skills add https:/安装后在 Claude Code 中输入/alterlab-ginkgo-cloud确认已加载。
包含的文件
除 SKILL.md 外，安装时一起下载的参考资料和脚本。
evals/evals.jsonreferences/cell-free-protein-expression-optimization.mdcell-free-protein-expression-validation.mdfluorescent-pixel-art-generation.md详细介绍
Ginkgo Cloud Lab
概述
Ginkgo Cloud Lab（https://cloud.ginkgo.bio）提供对 Ginkgo Bioworks 自主实验室基础设施的远程访问。实验方案由可重构自动化推车（RAC）执行——这些模块化设备配备机械臂、磁悬浮样品运输系统，以及覆盖 70 多种仪器的工业级软件。
该平台还包括 EstiMate，这是一个 AI Agent，可接收自然语言描述的实验方案，并针对列表中未列出的自定义工作流提供可行性评估和报价。
何时使用此技能
- 选择和订购 Cloud Lab 列出的实验方案（无细胞表达验证或优化、荧光像素画，以及下方列出的较新项目）
- 准备输入材料（DNA 序列文件、像素画设计），并了解输出、价格和交付时间
- 通过 EstiMate 获取自定义实验方案的可行性评估和报价
不适用的情况
| 场景 | 改用 |
|---|---|
| 将设计好的蛋白质提交至 Adaptyv Bio Foundry，以进行结合、表达或稳定性检测 | alterlab-adaptyv |
| 为自己的 Opentrons OT-2/Flex 机器人编写实验方案 | alterlab-opentrons |
| 为自己的多供应商液体处理器（Hamilton、Tecan）编写脚本 | alterlab-pylabrobot |
| 发布或查找带有 DOI 的书面实验方案 | alterlab-protocolsio |
可用实验方案
以下价格和交付时间为 2026-09-23 在 cloud.ginkgo.bio 上列出的信息；这些信息可能会变动，引用前请在实验方案页面确认。
1. 无细胞蛋白质表达验证
使用重构的大肠杆菌 CFPS，快速筛查表达是否可行。提交线性 DNA 序列（最长 1800 bp；支持 .fasta、.csv、.xlsx、.txt、.pdf 或 .zip），即可获得表达确认、基准滴度（mg/L）和初步纯度，并附虚拟凝胶图像。
- 价格：$39/样品 | **交付时间：**最长 10 天 | **状态：**已认证
- **详情：**参见 references/cell-free-protein-expression-validation.md
2. 无细胞蛋白质表达优化
采用基于 DoE 的方法，为每种蛋白质优化最多 24 种条件（裂解液、温度、伴侣蛋白、二硫键增强剂、辅因子）。适用于难表达蛋白质和膜蛋白。
- 价格：$199/样品 | **交付时间：**最长 11 天 | **状态：**已认证
- **详情：**参见 references/cell-free-protein-expression-optimization.md
3. 荧光像素画生成
将使用 Design Tool 创作的设计（上传图像或自由绘制）转化为荧光细菌艺术作品：颜色会映射至包含 7 种菌株的荧光大肠杆菌调色板，并通过声波分液在 Echo 1536 布局上打印（32×48 个点；已宣布即将推出 6144 布局）。交付高分辨率 UV 照片（TIFF/JPEG）。
- 价格：$25/板 | **交付时间：**最长 7 天 | **状态：**Beta
- **详情：**参见 references/fluorescent-pixel-art-generation.md
较新的目录项目
目录已扩展，不再局限于上述三个实验方案。截至 2026-09-23，目录还列出了 IVT mRNA/circRNA qPCR；采用 His-/Strep 标签纯化并通过 A280 或 LabChip 读取结果的无细胞和大肠杆菌表达（包括 minibinder 变体）；HiBiT 发光表达读数；毕赤酵母表达（LabChip）；无细胞热迁移；Echo-MS；SPR 动力学（Beta）；以及酶标仪方法接入。请打开各实验方案页面查看其输入要求、价格和交付时间——此技能目前尚无这些项目的详细参考资料。
通用下单工作流
- 在 https://cloud.ginkgo.bio/protocols 选择一项协议
- 配置参数（样本／蛋白质数量、重复次数、板数）
- 上传输入文件（蛋白质协议需上传序列文件；像素艺术需使用 Design Tool）
- 在 Additional Details 字段中添加任何特殊要求
- 提交后获取可行性报告和报价
对于上文未列出的协议，请使用 EstiMate 聊天功能，用通俗语言描述自定义协议，并获取兼容性评估和报价。
提交序列前，请确认所在机构关于向外部提供方分享未发表或受控序列的规定，并遵守相关构建体的生物安全审查要求。
身份验证
访问 Ginkgo Cloud Lab： https://cloud.ginkgo.bio。可能需要创建账户或通过机构访问。如有访问问题，请联系 Ginkgo：[email protected]。
核心基础设施
- RACs（可重构自动化推车）： 配备高精度机械臂和磁悬浮运输系统的模块化机器人单元
- Catalyst Software： 用于协议编排、调度、参数配置和实时监控
- 70+ 集成仪器： 用于样本制备、液体处理、分析读数、存储和培养
- Nebula： Ginkgo 位于马萨诸塞州波士顿的自主实验室设施
属于 AlterLab Academic Skills 套件。