关于 alterlab-scientific-thinking
alterlab-scientific-thinking 是用于评估科学研究和论证的技能,面向研究者、文献综述者及分析科学主张的用户。它结合偏倚识别、统计审查和 GRADE 等证据评估方法,也可为研究设计提供指导。
主要功能
- 01审查研究方法与实验设计
- 02识别偏倚和混杂因素
- 03评估统计方法与报告
- 04按 GRADE 评估证据质量
- 05识别科学论证中的逻辑谬误
- 06为研究设计提供指导
适用场景
- 01评估论文中的研究结论
- 02筛查系统综述纳入研究的偏倚风险
- 03审查科学报道是否夸大证据
- 04规划更严谨的研究方案
安装
复制下面的命令,在终端中运行。
npx skills add https:/ / github.com/ alterlab-ieu/ alterlab-academic-skills --skill alterlab-scientific-thinking安装后在 Claude Code 中输入/alterlab-scientific-thinking确认已加载。
包含的文件
除 SKILL.md 外,安装时一起下载的参考资料和脚本。
evals/evals.jsonreferences/common_biases.mdevaluation_checklists.mdevidence_hierarchy.mdexperimental_design.mdlogical_fallacies.mdscientific_method.mdstatistical_pitfalls.md详细介绍
科学批判性思维
概述
批判性思维是一种系统评估科学严谨性的过程。使用 GRADE 和 Cochrane 偏倚风险工具(随机试验使用 RoB 2,非随机干预研究使用 ROBINS-I),评估方法、实验设计、统计有效性、偏倚、混杂因素和证据质量。使用此技能对科学主张进行批判性分析。
何时使用此技能
在以下情况下应使用此技能:
- 评估研究方法和实验设计
- 评估统计有效性和证据质量
- 识别研究中的偏倚和混杂因素
- 审查科学主张和结论
- 评估系统综述纳入的研究(偏倚风险、GRADE 确定性)
- 应用 GRADE 或 Cochrane 偏倚风险评估
- 对研究论文进行批判性分析
不适用的情况
| 场景 | 改用 |
|---|---|
| 为期刊或资助项目撰写正式、可提交的审稿报告 | alterlab-peer-review |
| 对整篇稿件进行多位审稿人的模拟评审并作出裁定 | alterlab-paper-reviewer |
| 对论文、学位论文或提案进行评分 | alterlab-scholar-eval |
| 实际运行统计检验或模型 | alterlab-statistical-analysis |
| 汇总多项研究的效应量(森林图、异质性、发表偏倚) | alterlab-meta-analysis |
核心能力
1. 方法学批判
评估研究方法的严谨性、有效性和潜在缺陷。
适用于:
- 审阅研究论文
- 评估实验设计
- 评估研究方案
- 规划新研究
评估框架:
-
研究设计评估
- 该设计是否适合研究问题?
- 该设计能否支持所提出的因果主张?
- 对照组是否恰当且充分?
- 考虑实验性、准实验性或观察性设计是否合理
-
有效性分析
- 内部有效性: 我们能否信任因果推断?
- 检查随机化质量
- 评估混杂因素控制
- 评估选择偏倚
- 审查退出/脱落模式
- 外部有效性: 结果能否推广?
- 评估样本的代表性
- 考虑研究环境的生态效度
- 评估研究条件是否符合目标应用场景
- 构念效度: 测量是否反映预期构念?
- 审查测量工具的验证情况
- 检查操作性定义
- 评估测量是直接测量还是代理指标
- 统计结论效度: 统计推断是否可靠?
- 验证检验效能/样本量是否充足
- 检查是否符合假设条件
- 评估检验是否恰当
- 内部有效性: 我们能否信任因果推断?
-
对照与盲法
- 随机化是否得到正确实施(序列生成、分配隐藏)?
- 盲法是否可行且已实施(参与者、提供者、评估者)?
- 对照条件是否恰当(安慰剂、主动对照、不治疗)?
- 实施偏倚或检测偏倚是否可能影响结果?
-
测量质量
- 测量工具是否经过验证且可靠?
- 在可能的情况下,测量是否客观;若为主观测量,是否说明了其局限性?
- 结局评估是否标准化?
- 是否使用多种测量方法对研究结果进行交叉验证?
参考: 详细原则请参阅 references/scientific_method.md,完整的设计检查清单请参阅 references/experimental_design.md。
2. 偏差检测
识别并评估可能导致研究结果失真的偏差来源。
适用于:
- 审阅已发表的研究
- 设计新研究
- 解读相互矛盾的证据
- 评估研究质量
系统性偏差审查涵盖五类偏差:认知偏差(确认偏差、HARKing、发表偏差、选择性取材)、选择偏差(抽样偏差、志愿者偏差、脱落偏差、生存者偏差)、测量偏差(观察者偏差、回忆偏差、社会期望偏差、测量工具偏差)、分析偏差(p 值操纵、结果切换、选择性报告、亚组筛选)以及混杂因素(已测量、未测量因素和替代解释)。
**参考:**各类偏差的完整检测问题清单已移至 references/evaluation_checklists.md(偏差检测部分)。全面的偏差分类及缓解策略见 references/common_biases.md。
3. 统计分析评估
批判性地评估统计方法、解读方式和报告。
适用于:
- 审阅定量研究
- 评估数据驱动的主张
- 评估临床试验结果
- 审阅荟萃分析
统计审查清单涵盖八个方面:样本量与检验效能、统计检验的适用性、多重比较校正、p 值解读、效应量与置信区间、缺失数据处理、回归/建模假设,以及常见误区(将相关性视为因果关系、均值回归、忽视基准率、得克萨斯神枪手谬误、辛普森悖论)。
**参考:**涵盖全部八个方面的逐项完整问题清单已移至 references/evaluation_checklists.md(统计分析评估部分)。详细误区及正确做法见 references/statistical_pitfalls.md。
4. 证据质量评估
系统地评估证据的强度和质量。
适用于:
- 权衡决策所依据的证据
- 开展文献综述
- 比较相互矛盾的研究结果
- 确定对结论的信心
证据评估框架包括五个组成部分:研究设计层级(从荟萃分析到专家意见,同时注意层级并不能保证质量)、同一设计类型内的质量(偏差风险工具、严谨性、透明度、利益冲突)、GRADE 考量(先根据设计类型确定起点,再降级/升级)、证据一致性(哪些因素会增强或削弱一致性),以及背景因素(合理性、一致性、时间先后关系、特异性、强度)。
**参考:**包含完整 GRADE 降级/升级标准和证据一致性信号的完整框架已移至 references/evaluation_checklists.md(证据质量评估部分)。详细层级、GRADE 体系和质量评估工具见 references/evidence_hierarchy.md。
5. 逻辑谬误识别
检测并指出科学论证和主张中的逻辑错误。
适用于:
- 评估科学主张
- 审阅讨论/结论部分
- 评估科普传播
- 识别有缺陷的推理
科学中常见的谬误分为六类:因果谬误(事后归因、将相关性等同于因果关系、倒置因果、单一原因)、概括谬误(草率概括、轶事论证、择取证据、生态谬误)、权威/来源谬误(诉诸权威、人身攻击、起源谬误、诉诸自然)、统计谬误(忽视基率、得克萨斯神枪手谬误、多重比较、检察官谬误)、结构性谬误(虚假两难、移动目标、循环论证、稻草人谬误)以及科学特有谬误(伽利略伎俩、诉诸无知、涅槃谬误、不可证伪)。
**参考:**每种已命名谬误的通俗定义已移至 references/evaluation_checklists.md(逻辑谬误识别部分),其中包含完整的谬误目录。示例和识别策略请参见 references/logical_fallacies.md。
识别谬误时:
- 指出具体的谬误
- 解释推理有何缺陷
- 指明有效推断所需的证据
- 注意,存在谬误并不能证明结论为假,只能说明该论证无法支持结论
**参考:**完整的谬误目录、示例和识别策略请参见 references/logical_fallacies.md。
6. 研究设计指导
为规划严谨的研究提供建设性指导。
适用于:
- 协助设计新实验
- 规划研究项目
- 审阅研究计划书
- 改进研究方案
设计流程:
-
细化研究问题
- 确保问题具体、可回答且可证伪
- 确认问题针对文献中的空白或矛盾
- 确认研究可行性(资源、伦理、时间)
- 对变量进行操作性定义
-
选择设计
- 根据问题选择设计(因果问题 → 实验设计;关联问题 → 观察性设计)
- 考虑可行性和伦理限制
- 选择组间、组内或混合设计
- 若检验多个因素,则规划析因设计
-
偏差最小化策略
- 尽可能实施随机化
- 在所有可行层面规划盲法(参与者、实施者、评估者)
- 识别混杂因素并规划控制方法(随机化、匹配、分层、统计调整)
- 标准化所有流程
- 规划减少样本流失的方法
-
样本规划
- 事先进行功效分析(明确预期效应、目标功效和 alpha)
- 在样本量中考虑样本流失
- 明确纳入/排除标准
- 考虑招募策略及其可行性
- 规划确保样本具有代表性的方法
-
测量策略
- 选择经过验证且可靠的工具
- 尽可能使用客观测量
- 对关键构念采用多种测量方式(三角验证)
- 确保测量对预期变化足够敏感
- 建立评估者间信度流程
-
分析规划
- 预先明确所有假设和分析
- 清晰指定主要结局
- 规划统计检验并检查其假设
- 明确说明如何处理缺失数据
- 规划报告效应量和置信区间
- 考虑多重比较校正
-
透明度与严谨性
- 预注册研究和分析计划
- 使用报告指南(CONSORT、STROBE、PRISMA)
- 规划报告所有结局,而不仅是显著结果
- 区分验证性分析与探索性分析
- 承诺共享数据/代码
**参考:**完整的设计清单涵盖从研究问题到成果传播的所有阶段,详见 references/experimental_design.md。
7. 主张评估
系统地评估科学主张的有效性与支持程度。
适用场景:
- 评估论文中的结论
- 评价研究相关的媒体报道
- 审阅摘要或引言中的主张
- 检查数据是否支持结论
主张评估流程:
-
识别主张
- 具体主张是什么?
- 它是因果性主张、关联性主张,还是描述性主张?
- 该主张的强度如何(已证实、很可能、有迹象表明、可能)?
-
评估证据
- 提供了什么证据?
- 证据是直接的还是间接的?
- 证据是否足以支撑该主张的强度?
- 是否排除了其他解释?
-
检查逻辑关联
- 结论是否由数据推导而来?
- 是否存在逻辑跳跃?
- 是否使用相关性数据来支持因果性主张?
- 是否说明了局限性?
-
评估相称性
- 置信度是否与证据强度相称?
- 模糊限定词的使用是否恰当?
- 是否淡化了局限性?
- 推测是否被明确标注?
-
检查是否存在过度泛化
- 主张是否超出了所研究的样本范围?
- 是否说明了人群限制?
- 是否认识到情境依赖性?
- 是否包含关于泛化的注意事项?
-
危险信号
- 相关性研究使用因果性语言
- “证明”或绝对确定性
- 挑选有利的引用
- 忽视矛盾证据
- 对局限性不予理会
- 超出数据进行外推
提供具体反馈:
- 引用有问题的主张
- 解释需要什么证据才能支持它
- 如有必要,建议使用恰当的模糊限定语言
- 区分数据(发现了什么)与解释(这意味着什么)
应用指南
总体方法
-
建设性
- 既指出优点,也指出不足
- 提出改进建议,而不仅仅是批评
- 区分致命缺陷与次要局限
- 认识到所有研究都有局限性
-
具体明确
- 指向具体位置(例如,“表 2 显示……”或“在方法部分……”)
- 引用有问题的表述
- 提供问题的具体示例
- 引用被违反的具体原则或标准
-
恰如其分
- 使批评的严厉程度与问题的重要性相匹配
- 区分对有效性的重大威胁与次要关切
- 考虑问题是否影响主要结论
- 承认自己评估中的不确定性
-
采用一致标准
- 对所有研究使用相同标准
- 不要对自己不喜欢的发现采用更严格的标准
- 承认自己可能存在的偏见
- 判断基于方法学,而非结果
-
考虑情境
- 承认实际与伦理约束
- 考虑特定领域关于效应量和方法学的规范
- 区分探索性与验证性情境
- 在评估研究时考虑资源限制
提供批评时
按以下结构组织反馈:
- 总结: 简要概述所评估的内容
- 优点: 做得好的地方(对可信度和学习很重要)
- 关切: 按严重程度组织的问题
- 关键问题(威胁主要结论的有效性)
- 重要问题(影响解释,但不致命)
- 次要问题(值得注意,但不改变结论)
- 具体建议: 可操作的改进建议
- 总体评估: 关于证据质量及可得出什么结论的平衡结论
使用精确术语:
- 指出具体的偏见、谬误和方法学问题
- 引用公认的标准和指南
- 引用科学方法学的原则
- 准确使用技术术语
不确定时
- 承认不确定性:“这可能是 X,也可能是 Y;还需要 Z 信息”
- 提出澄清问题:“是否采用了[方法学细节]?这会影响解读。”
- 提供有条件的评估:“如果采用了 X,那么可以得出 Y;如果没有,那么 Z 就是一个值得关注的问题”
- 说明哪些额外信息有助于消除不确定性
参考资料
此技能包含全面的参考资料,为批判性评估提供详细框架:
-
references/scientific_method.md- 科学方法学的核心原则、科学流程、批判性评估标准、科学论断中的危险信号、因果推断标准、同行评审和开放科学原则 -
references/common_biases.md- 认知、实验、方法学、统计和分析偏差的全面分类,以及检测和缓解策略 -
references/statistical_pitfalls.md- 常见统计错误和误读,包括对 p 值的误解、多重比较问题、样本量问题、效应量误用、混淆相关性与因果关系、回归陷阱和荟萃分析问题 -
references/evidence_hierarchy.md- 传统证据等级、GRADE 体系、研究质量评估标准、领域特定考量、证据综合原则和实用决策框架 -
references/logical_fallacies.md- 科学论述中常见的逻辑谬误,按类型分类(因果、概括、诉诸权威、相关性、结构、统计),并提供示例和识别策略 -
references/experimental_design.md- 全面的实验设计检查清单,涵盖研究问题、假设、研究设计选择、变量、抽样、盲法、随机化、对照组、流程、测量、偏差最小化、数据管理、统计规划、伦理考量、效度威胁和报告标准 -
references/evaluation_checklists.md- 针对偏差检测、统计分析评估、证据质量评估和逻辑谬误识别能力的可操作问答式审查清单(从核心能力部分移出的完整逐项详情)
何时查阅参考资料:
- 需要详细框架时,将参考资料载入上下文
- 使用 grep 搜索参考资料中的特定主题:
grep -r "pattern" references/ - 参考资料提供深入内容;SKILL.md 提供流程指导
- 如需完整列表、详细标准和具体示例,请查阅参考资料
请记住
科学批判性思维包括:
- 运用既定原则进行系统评估
- 提出有助于改进科学的建设性批评
- 根据证据强度调整信心程度
- 透明说明不确定性和局限性
- 始终如一地应用标准
- 认识到所有研究都有局限性
- 在怀疑与对证据保持开放之间取得平衡
始终区分:
- 数据(观察到的内容)与解读(其含义)
- 相关性与因果关系
- 统计显著性与实际重要性
- 探索性发现与验证性发现
- 已知内容与不确定内容
- 反对某项主张的证据与支持零假设的证据
批判性思维的目标:
- 准确识别优点和缺点
- 确定哪些结论有证据支持
- 认识局限性和不确定性
- 为未来工作提出改进建议
- 推进科学认知
这是 AlterLab Academic Skills 套件的一部分。