alterlab-scientific-writing

科学写作

概述

科学写作以精准、清晰的方式传达研究成果。使用 IMRAD 结构撰写稿件，采用引文格式（APA/AMA/Vancouver），并制作图表、遵循报告指南（CONSORT/STROBE/PRISMA）。研究论文和期刊投稿均可使用此技能。论点应以通过 alterlab-research-lookup 技能搜集的文献为依据，并逐条对照来源核实引文。

核心原则：最终稿件应以流畅的完整段落撰写，而非要点列表——审稿人和编辑会将要点列表视为尚未成形的思路，而研究发现之间的逻辑联系体现在列表所省略的过渡中。采用两阶段流程：首先使用 alterlab-research-lookup 创建包含关键要点的章节大纲，然后将大纲扩写为完整段落。

何时使用此技能

以下情况应使用此技能：

• 撰写或修订科学稿件的任何章节（摘要、引言、方法、结果、讨论）
• 使用 IMRAD 或其他标准格式构建研究论文
• 按特定格式规范整理引文和参考文献（APA、AMA、Vancouver、Chicago、IEEE）
• 创建、排版或改进图表及数据可视化内容
• 应用针对特定研究的报告指南（试验使用 CONSORT，观察性研究使用 STROBE，综述使用 PRISMA）
• 撰写符合期刊要求的摘要（结构式或非结构式）
• 准备投往特定期刊的稿件
• 提高写作的清晰度、简洁性和准确性
• 确保正确使用领域专用术语和命名法
• 回复审稿意见并修订稿件

不适用的情况

场景	改用
通过多 Agent 流水线端到端地完成论文，包括 APA 7 LaTeX/DOCX/PDF 输出、双语摘要，或根据审稿意见信制定完整的修订路线图	alterlab-paper-writer
特定期刊或会议的 LaTeX 模板、页数限制和格式规范	alterlab-venue-templates
构建或清理 BibTeX 参考文献库本身	alterlab-citation-mgmt
采用导师式工作流程撰写论文或学位论文的章节	alterlab-thesis-supervisor
土耳其期刊的稿件（TR Dizin 规则、土耳其语 APA 7、双语 öz）	alterlab-tr-academic-style

图表和视觉元素（可选）

精心选择的图表（例如图形摘要、方法流程图或概念图）可以增强稿件的表现力，但并非必需，只有在确实有助于提升清晰度时才应添加。如果图示或图表有助于理解，请调用 alterlab-scientific-schematics 技能（图表/示意图）或 alterlab-generate-image 技能（图像）。

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核心能力

1. 稿件结构与组织

IMRAD 格式：按照大多数科学学科采用的标准“引言、方法、结果和讨论”结构指导论文写作。包括：

• 引言：介绍研究背景，指出研究空白，陈述研究目标
• 方法：详细说明研究设计、研究对象、流程和分析方法
• 结果：客观呈现研究发现，不作解读
• 讨论：解读结果，承认局限性，提出未来研究方向

有关 IMRAD 结构的详细指南，请参阅 references/imrad_structure.md。

替代结构：支持特定学科的格式，包括：

• 综述文章（叙述性、系统性、范围综述）
• 病例报告和病例系列
• 荟萃分析和汇总分析
• 理论/建模论文
• 方法论文和方案

2. 特定章节的写作指南

摘要撰写：撰写简洁、独立成篇的摘要（100-250 词），概述论文的目的、方法、结果和结论。支持带有明确分节标题的结构式摘要，以及单段式非结构化摘要。

引言撰写：撰写引人入胜的引言，以：

• 阐明研究问题的重要性
• 系统回顾相关文献
• 指出知识空白或争议
• 明确提出研究问题或假设
• 说明研究的新颖性和重要意义

方法撰写：通过以下内容确保研究可重复：

• 详细描述参与者/样本
• 清晰记录研究流程
• 说明统计方法并阐述选择理由
• 详细说明设备和材料
• 声明伦理审批和知情同意情况

结果呈现：呈现研究发现时，应：

• 按照从主要结局到次要结局的逻辑顺序展开
• 结合图和表呈现结果
• 报告统计显著性和效应量
• 客观报告，不作解读

讨论撰写：综合研究发现时，应：

• 将结果与研究问题联系起来
• 与现有文献进行比较
• 如实承认局限性
• 提出可能的机制解释
• 探讨实际意义和未来研究方向

3. 引文和参考文献管理

在不同学科中正确应用引文格式。完整的格式指南请参阅 references/citation_styles.md。

主要引文格式：

• AMA（美国医学会）：采用上标编号引文，医学领域常用
• Vancouver：采用方括号编号引文，是生物医学领域的标准格式
• APA（美国心理学会）：采用作者-日期文内引文，社会科学领域常用
• Chicago：采用注释-书目制或作者-日期制，适用于人文和科学领域
• IEEE：采用方括号编号引文，适用于工程和计算机科学领域

最佳实践：

• 尽可能引用原始来源
• 纳入近期文献（活跃领域近 5-10 年的文献）
• 在引言和讨论中均衡分布引文
• 对照原始来源核实所有引文
• 使用参考文献管理软件（Zotero、Mendeley、EndNote）

4. 图和表

制作有助于理解的有效数据可视化。详细的最佳实践请参阅 references/figures_tables.md。

何时使用表格，何时使用图：

• 表格：适用于精确数值数据、复杂数据集，以及需要呈现确切数值的多个变量
• 图：适用于趋势、模式、关系和通过视觉呈现更易理解的比较

设计原则：

• 为每个表/图添加完整标题，使其内容不言自明
• 在所有展示内容中使用一致的格式和术语
• 为所有坐标轴、列和行标注单位
• 注明样本量（n）和统计标注
• 遵循“每 1000 词一张表/图”的原则
• 避免在正文、表和图之间重复信息

常见图表类型：

• 柱状图：比较离散类别
• 折线图：显示随时间变化的趋势
• 散点图：展示相关性
• 箱线图：显示分布和离群值
• 热力图：可视化矩阵和模式

5. 按研究类型划分的报告指南

遵循既定的报告标准，确保内容完整、透明。有关指南的详细信息，请参阅 references/reporting_guidelines.md。

主要指南（截至 2026-09 的当前版本；如需了解扩展内容，请查看 equator-network.org）：

• CONSORT 2025：随机对照试验（30 个条目，新增开放科学章节）
• STROBE：观察性研究（队列研究、病例对照研究、横断面研究）
• PRISMA 2020：系统综述和荟萃分析
• STARD 2015：诊断准确性研究
• TRIPOD+AI (2024)：预测模型研究，包括回归或机器学习（取代 TRIPOD 2015）
• ARRIVE 2.0：动物研究
• CARE：病例报告
• SQUIRE 2.0：质量改进研究
• SPIRIT 2025：临床试验研究方案（34 个条目）
• CHEERS 2022：经济学评价

每项指南都提供检查清单，确保报告涵盖所有关键方法学要素。

6. 写作原则与风格

遵循科学写作的基本原则。详细指导请参阅 references/writing_principles.md。

清晰：

• 使用准确、明确的语言
• 首次使用时定义专业术语和缩写
• 确保段落内部及段落之间逻辑连贯
• 适当使用主动语态，以提升清晰度

简洁：

• 删除冗余的词语和短语
• 尽量使用较短的句子（平均每句 15–20 个词）
• 删除不必要的限定语
• 严格遵守字数限制

准确：

• 以适当的精度报告确切数值
• 全文使用一致的术语
• 区分观察结果与解释
• 适当说明不确定性

客观：

• 不带偏见地呈现结果
• 避免夸大研究发现或其意义
• 承认相互矛盾的证据
• 保持专业、中立的语气

7. 写作流程：从提纲到完整段落

每个章节都应写成完整段落，并采用相同的两阶段流程：

1. 提纲（仅用于规划）——使用 research-lookup 搜集文献，然后记下要点，标明主要论点、要引用的关键研究以及要纳入的数据。这些内容是写作框架，并非稿件正文。
2. 转换为正文——将每个要点扩展为完整句子，通过自然的过渡语将引文融入正文，灵活变换句式，并确保逻辑连贯。

只有方法部分（纳入/排除标准、材料）和补充材料中可以使用列表——摘要、引言、结果、讨论或结论中均不得使用列表。摘要应写成连贯的段落，而非带标签的分节，除非期刊明确要求采用结构式格式。

完整的演示示例（从提纲到正文）、提纲与最终稿对照表、完整的应避免错误清单，以及 research-lookup 的整合方式，请参阅 references/outline_to_prose.md。

8. 专业报告格式（非期刊文档）

对于研究报告、技术报告、白皮书、资助/进度报告以及其他非期刊稿件的专业文档，请使用 scientific_report.sty LaTeX 样式包（Helvetica 字体、彩色框环境、专业表格，以及用于 p 值/效应量/CI 的科学记数法命令）。期刊稿件和会议论文应改用 alterlab-venue-templates；学位论文则使用所在机构的模板。

框环境、表格格式、符号命令、入门导言区，以及 XeLaTeX/LuaLaTeX 编译方法均记录在 references/professional_report_quickref.md 中；完整指南见 references/professional_report_formatting.md，样式包本身及模板位于 assets/。

9. 期刊特定格式要求

使稿件符合期刊要求：

• 遵循作者指南对结构、篇幅和格式的要求
• 采用期刊特定的引文格式
• 满足图表规范（分辨率、文件格式、尺寸）
• 包含必要声明（经费来源、利益冲突、数据可用性、伦理审批，以及披露准备稿件时是否使用了生成式 AI 协助——ICMJE 和大多数出版商都要求披露，且 AI 工具不能列为作者）
• 遵守各章节的字数限制
• 如提供模板，按照模板要求排版

10. 领域特定语言与术语

调整语言、术语和惯例，使其符合特定科学学科的规范。每个领域都有成熟的词汇、偏好的表达方式和领域特定惯例，这些都能体现专业性，并确保目标读者清晰理解。可通过查看目标期刊近期发表的高影响力论文，了解相关惯例，留意领域特定的缩写、单位、符号和偏好术语（例如，“参与者”与“受试者”）。

各领域普遍适用的原则包括：术语应与读者的专业水平相匹配（面向广泛读者的期刊，如 Nature/Science，应提供更多定义）；缩写首次出现时应予以定义；全文术语和命名法应保持一致；避免跨领域混用错误（不要把小鼠称为“患者”）；并参照领域风格指南、本体（Gene Ontology、MeSH）和近期论文核实用法。

有关各学科（生物医学/临床、分子生物学与遗传学、化学、生态学、物理学/工程学、神经科学、社会科学与行为科学）的惯例，以及完整的一般原则，请参阅 references/field_terminology.md。

11. 应避免的常见问题

主要拒稿原因：

1. 统计方法不恰当、不完整或描述不充分
2. 过度解读结果或得出缺乏依据的结论
3. 方法描述不充分，影响研究的可重复性
4. 样本量过小、存在偏差或不恰当
5. 写作质量不佳或文本难以理解
6. 文献综述或背景介绍不充分
7. 图表不清晰或设计不佳
8. 未遵循报告指南

写作质量问题：

• 时态混用不当（方法和结果使用过去时，公认事实使用现在时）
• 术语过多或缩写未定义
• 段落划分打断逻辑脉络
• 章节之间缺少衔接
• 符号或术语不一致

手稿撰写工作流

阶段 1：规划

1. 确定目标期刊并查看作者指南
2. 确定适用的报告指南（CONSORT、STROBE 等）
3. 拟定手稿结构（通常采用 IMRAD）
4. 将图表作为论文的骨架进行规划

阶段 2：起草（每个部分都采用两阶段写作流程）

1. 从图表开始（核心数据叙事）
2. 对以下各部分采用两阶段流程：
   • 第一步：使用 research-lookup 创建要点大纲
   • 第二步：将要点扩展为流畅的完整段落
3. 撰写方法部分（通常最容易先起草）
4. 起草结果部分（客观描述图表）
5. 撰写讨论部分（解读研究发现）
6. 撰写引言（提出研究问题）
7. 撰写摘要（概述完整的研究内容）
8. 拟定标题（简洁且具有描述性）

要点只是规划用的脚手架；在交出草稿前，请将其改写为段落。

阶段 3：修订

1. 检查全文逻辑流畅，并贯穿“红线”
2. 确认术语和符号的一致性
3. 确保图表无需额外说明即可理解
4. 确认符合报告指南
5. 核实所有引文准确无误且格式正确
6. 检查各部分的字数
7. 校对语法、拼写和表达清晰度

阶段 4：最终准备

1. 按照期刊要求排版
2. 准备补充材料
3. 撰写强调研究意义的投稿附信
4. 完成投稿检查清单
5. 收集所有必需的声明和表格

与其他科学写作技能的协作

使用此技能掌握一般科学写作技巧（IMRAD、表达清晰度、行文，以及正文中的引文样式）。如果任务属于其他技能的范围，请交由相应的同类技能处理：

• alterlab-research-lookup — 搜索文献，为阶段 1 的大纲补充内容并为论点提供依据。
• alterlab-venue-templates — 了解特定投稿渠道的 LaTeX 模板、页数限制／排版规则和专属写作风格（Nature／Science、Cell Press、医学期刊、ML／CS 会议）。先应用此技能的原则，再根据该技能适配。
• alterlab-citation-mgmt — 构建／验证 BibTeX 参考文献库并获取参考文献元数据（此技能负责正文中的引文样式，但不构建参考文献库）。
• alterlab-scientific-schematics / alterlab-generate-image — 在图示有助于清晰表达时，制作示意图／图表和图像。

排版路由：期刊手稿和会议论文使用 alterlab-venue-templates。研究报告、白皮书、技术报告和资助／进展报告使用 scientific_report.sty（此技能，第 8 节）。学位论文使用院校模板。

参考资料

此技能包含全面的参考文件，涵盖科学写作的具体方面：

• references/imrad_structure.md：IMRAD 格式和各部分具体内容的详细指南
• references/citation_styles.md：完整的引文样式指南（APA、AMA、Vancouver、Chicago、IEEE）
• references/figures_tables.md：创建有效数据可视化的最佳实践
• references/reporting_guidelines.md：针对不同研究的报告标准和检查清单
• references/writing_principles.md：有效科学沟通的核心原则
• references/outline_to_prose.md：从大纲到段落的两阶段流程，包含完整示例和应避免的错误
• references/field_terminology.md：各学科的语言惯例和通用术语原则
• references/professional_report_quickref.md：scientific_report.sty 的方框环境、表格排版、符号命令和入门导言区
• references/professional_report_formatting.md：使用 scientific_report.sty 进行专业报告排版的综合指南

资源

此技能包含用于专业报告排版的 LaTeX 样式包和模板：

• assets/scientific_report.sty：专业的 LaTeX 样式包，包含 Helvetica 字体、彩色文本框和美观的表格
• assets/scientific_report_template.tex：完整的报告模板，展示了所有样式特性
• assets/REPORT_FORMATTING_GUIDE.md：样式包快速参考指南

scientific_report.sty 的主要特性：

• Helvetica 字体系列，呈现现代、专业的外观
• 专业的配色方案（蓝色、绿色、橙色、紫色）
• 文本框环境：keyfindings、methodology、resultsbox、recommendations、limitations、criticalnotice、definition、executivesummary、hypothesis
• 具有交替行颜色和专业表头的表格
• 用于表示 p 值、效应量和置信区间的科学记数法命令
• 专业的页眉和页脚

根据需要加载这些参考资料，以便撰写科学文本的特定部分。

AlterLab Academic Skills 套件的一部分。