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data-availability

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github.com/boom5426文档处理63780 次安装2 周前更新
代码仓库

关于 data-availability

data-availability 面向需要为稿件准备期刊投稿级数据共享材料的作者。它将支撑研究结论的数据集对应到访问途径,起草明确的可用性声明,并标出缺失标识符或未解决的限制,而不臆造信息。

主要功能

  1. 01盘点支撑研究结论的数据集
  2. 02为每个数据集指定访问途径
  3. 03起草数据集与位置对应声明
  4. 04检查新生成及复用数据的覆盖
  5. 05标出信息缺失和访问风险

适用场景

  1. 01准备期刊数据可用性声明
  2. 02处理缺失的 DOI 或登录号
  3. 03说明公开与受限数据集
  4. 04投稿前检查数据共享文本

安装

复制下面的命令,在终端中运行。

$npx skills add https://github.com/boom5426/nature-paper-skills --skill data-availability

安装后在 Claude Code 中输入/data-availability确认已加载。

包含的文件

除 SKILL.md 外,安装时一起下载的参考资料和脚本。

references/
chinese-author-alignment.md
fair-metadata-checklist.md
repository-routing.md
source-data-checks.md
statement-patterns.md

详细介绍

数据可用性

概述

使用此技能,将支持稿件的数据整理成可直接用于投稿的可用性资料包:声明文本、仓库计划、源数据映射,以及未解决风险标记。

此技能的适用范围比 submission-audit 更窄,比 scientific-writing 更偏重实际操作。当瓶颈不再是论文的叙事,而是数据共享资料包是否具体、持久且符合期刊投稿要求时,请使用此技能。

适用场景

在以下情况下使用此技能:

  • 稿件需要 Data Availability 声明
  • 登录号、DOI、仓库记录或源数据文件缺失或不稳定
  • 论文同时包含生成的数据、重复使用的公共数据和受限数据
  • 需要收紧或替换「应要求提供」的措辞
  • 投稿或修订需要编辑能快速审核的数据共享文本

以下情况请勿使用此技能:

  • 与数据共享无关的通用章节改写
  • 全面重构稿件
  • 不影响数据集可用性的参考文献清理

工作流程

  1. 确定目标期刊和文章类型。
  2. 清点支持主要结论和补充结论的数据集:
    • 原始数据
    • 处理后数据
    • 图表源数据
    • 重复使用的公共数据集
    • 检查结果所必需的代码相关输出
  3. 为每个数据集指定唯一一种访问途径:
    • 公共仓库
    • 受控访问仓库
    • 收录于论文或补充材料中
    • 重复使用的公共来源
    • 第三方限制访问
    • 有正当理由的申请途径
  4. 起草声明前,确定仓库和标识符方案。
  5. 明确写出数据集与存放位置的对应关系。
  6. 检查声明是否涵盖新生成的数据和重复使用的数据。
  7. 标记未解决的字段,不要捏造仓库名称、登录 ID、DOI 或访问规则。

工作规则

  • 尽可能优先选择公共的学科专用仓库。
  • 除非确实存在法律、伦理、商业或第三方限制,否则应将 available upon request 视为较弱的表述。
  • 如果数据无法公开,应说明:
    • 限制访问的原因
    • 由谁控制访问
    • 如何审核申请
    • 哪些元数据、源数据或衍生数据仍可公开
  • 除非期刊明确要求,否则不要将数据、代码、方案和材料合并成一句含糊的可用性声明。
  • 不要捏造登录号、DOI、仓库名称、审稿人链接或禁运条款。
  • 只列出分析实际使用的资源,并明确说明其来源(「所有响应数据均来自 [collection],[DOI]」)。不得列出研究未使用的资源;如果来源中没有记录某个标识符,应直接省略,而不是坦承其「未公开」或「无法识别」;应将此类缺漏标记给作者。
  • 不作任何承诺:只说明当前实际存在的途径和文件。只有在确实存在相应途径或文件时,才提及「应要求提供」和「源数据文件」;不得提及未来发布或安排访问(「将发布」「计划在接收前发布」「可以安排」)。
  • 写明科学内容,而非仓库布局:声明中不得出现文件夹路径(source_data/)、文件操作细节或工作簿使用说明。
  • 写出实际使用的公共仓库名称,例如,用于处理后输入的 Hugging Face 数据集和用于代码的 GitHub 仓库;并确保代码可用性声明与已发布仓库的内容一致。
  • 补充材料中的数据来源表每项已用资源占一行,不应包含每行内容都相同的列;引用的出版物应取自稿件自身的参考文献,以避免两者不一致。尽可能根据分析表生成此表。

相关文件

仅在需要时打开以下文件:

  • references/statement-patterns.md 用于起草或修订实际声明文本。
  • references/repository-routing.md 用于确定每个数据集应存放的位置,以及所需的标识符类型。
  • references/source-data-checks.md 用于检查图表和补充材料是否提供了足够的底层数据。
  • references/fair-metadata-checklist.md 当期刊要求提供符合 FAIR 或 DataCite 风格的数据集元数据或正式的数据集引用时使用。
  • references/chinese-author-alignment.md 用于将中文数据可用性声明草稿与英文投稿措辞对齐。

输出标准

使用此技能时,返回:

  • 可直接粘贴的 Data Availability 文本
  • 仍需完成的存储库和标识符操作
  • 缺失信息或阻碍风险
  • 一则简短说明,指出当前材料属于以下哪种状态:
    • ready_to_submit
    • draft_with_placeholders
    • needs_author_input
    • blocked

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