drug-discovery-search

药物发现搜索

使用 Valyu 的语义搜索 API，通过自然语言查询同时搜索所有主要药物发现数据库（ChEMBL、DrugBank、FDA 药品标签、Open Targets）。

此技能的强大之处

• 无需解析 API 参数：直接传入自然语言查询即可，无需构造复杂的搜索参数
• 语义搜索：理解查询的含义，而不仅仅是匹配关键词
• 全文访问：返回完整的化合物、靶点和药物信息
• 图片链接：包含分子结构和数据可视化内容
• 全面覆盖：同时搜索 ChEMBL、DrugBank、药品标签和 Open Targets
• 统一结果：通过单次查询获取所有药物发现来源的结果

要求

1. Node.js 18+（使用内置的 fetch）
2. Valyu API 密钥，获取地址：https://platform.valyu.ai（含 $10 免费额度）

重要：脚本路径解析

本文档中的 scripts/search 命令是相对于此技能的安装目录而言的。

运行任何命令之前，请先定位脚本：

DRUG_DISCOVERY_SCRIPT=$(find ~/.claude/plugins/cache -name "search" -path "*/drug-discovery-search/*/scripts/*" -type f 2>/dev/null | head -1)

然后在所有命令中使用完整路径：

$DRUG_DISCOVERY_SCRIPT "JAK2 inhibitors" 20

API 密钥设置流程

运行搜索并收到 "setup_required": true 时，请按以下流程操作：

1. 向用户索取 API 密钥： “要搜索药物发现数据库，我需要你的 Valyu API 密钥。可在 https://platform.valyu.ai 免费获取（含 $10 额度）。”

2. 用户提供密钥后，运行：

   scripts/search setup <api-key>
   

3. 重试原始搜索。

何时使用此技能

• 获取端到端的药物发现信息
• 通过化合物和临床试验验证靶点
• 获取完整的药物开发信息
• 根据靶点数据优化化合物
• 开展安全性和有效性研究

输出格式

{
  "success": true,
  "type": "drug_discovery_search",
  "query": "JAK2 inhibitors",
  "result_count": 20,
  "results": [
    {
      "title": "Compound/Drug/Target Title",
      "url": "https://...",
      "content": "Full data including compounds, targets, mechanisms...",
      "source": "chembl|drugbank|drug-labels|open-targets",
      "relevance_score": 0.95,
      "images": ["https://example.com/structure.png"]
    }
  ],
  "cost": 0.035
}

处理结果

使用 jq

# Get titles
scripts/search "query" 20 | jq -r '.results[].title'

# Get URLs
scripts/search "query" 20 | jq -r '.results[].url'

# Extract full content
scripts/search "query" 20 | jq -r '.results[].content'

# Filter by source
scripts/search "query" 20 | jq -r '.results[] | select(.source == "chembl") | .title'

常见用例

靶点识别

# Find validated targets and compounds
scripts/search "BTK inhibitors for autoimmune diseases" 50

候选化合物优化

# Search SAR and compound data
scripts/search "EGFR inhibitors blood-brain barrier penetration" 40

药物再利用

# Find repurposing opportunities
scripts/search "mTOR inhibitors cancer and aging" 30

安全性评估

# Gather safety and interaction data
scripts/search "tyrosine kinase inhibitors cardiac toxicity" 60

错误处理

所有命令都会返回包含 success 字段的 JSON：

{
  "success": false,
  "error": "Error message"
}

退出代码：

• 0 - 成功
• 1 - 错误（查看 JSON 了解详情）

API 端点

• 基础 URL：https://api.valyu.ai/v1
• 端点：/search
• 身份验证：X-API-Key 标头

架构

scripts/
├── search          # Bash wrapper
└── search.mjs      # Node.js CLI

直接使用 Node.js 内置的 fetch() 调用 API，无需任何外部依赖。

添加到你的项目

如果你正在构建 AI 项目，并希望将药物发现搜索直接集成到应用程序中，请使用 Valyu SDK：

Python 集成

from valyu import Valyu

client = Valyu(api_key="your-api-key")

response = client.search(
    query="your search query here",
    included_sources=["valyu/valyu-chembl", "valyu/valyu-drugbank", "valyu/valyu-drug-labels", "valyu/valyu-open-targets"],
    max_results=20
)

for result in response["results"]:
    print(f"Title: {result['title']}")
    print(f"URL: {result['url']}")
    print(f"Content: {result['content'][:500]}...")

TypeScript 集成

import { Valyu } from "valyu-js";

const client = new Valyu("your-api-key");

const response = await client.search({
  query: "your search query here",
  includedSources: ["valyu/valyu-chembl", "valyu/valyu-drugbank", "valyu/valyu-drug-labels", "valyu/valyu-open-targets"],
  maxResults: 20
});

response.results.forEach((result) => {
  console.log(`Title: ${result.title}`);
  console.log(`URL: ${result.url}`);
  console.log(`Content: ${result.content.substring(0, 500)}...`);
});

请参阅 Valyu 文档，了解完整的集成示例和 SDK 参考。