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drugbank-search

drugbank-search

github.com/yorkeccak生产力64132 次安装3 周前更新
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关于 drugbank-search

drugbank-search 是通过自然语言查询 DrugBank 药物信息的命令行技能。它使用 Valyu 语义搜索,返回作用机制、相互作用、靶点和药理学等信息。

主要功能

  1. 01自然语言语义搜索
  2. 02药物信息与作用机制
  3. 03相互作用与靶点
  4. 04分子结构图片链接
  5. 05命令行输出 JSON

适用场景

  1. 01查询药物药代动力学
  2. 02研究药物相互作用
  3. 03研究作用机制
  4. 04识别药物靶点

安装

复制下面的命令,在终端中运行。

$npx skills add https://github.com/yorkeccak/scientific-skills --skill drugbank-search

安装后在 Claude Code 中输入/drugbank-search确认已加载。

附带文件scripts/searchscripts/search.mjs

详细介绍

DrugBank 搜索

使用 Valyu 的语义搜索 API,通过自然语言查询搜索 DrugBank 完整药物信息数据库,包括作用机制、相互作用、靶点和药理学信息。

此技能为何强大

  • 无需解析 API 参数:直接传入自然语言查询即可,无需构造复杂的搜索参数
  • 语义搜索:理解查询的含义,而不只是匹配关键词
  • 全文访问:返回完整的药物信息,包括作用机制、相互作用和靶点
  • 图像链接:包含分子结构和数据可视化
  • 全面覆盖:可访问 DrugBank 的所有药物数据

要求

  1. Node.js 18+(使用内置 fetch)
  2. Valyu API 密钥,可从 https://platform.valyu.ai 获取(含 $10 免费额度)

关键:脚本路径解析

本文档中的 scripts/search 命令是相对于此技能的安装目录而言的。

运行任何命令前,请先定位脚本:

DRUGBANK_SCRIPT=$(find ~/.claude/plugins/cache -name "search" -path "*/drugbank-search/*/scripts/*" -type f 2>/dev/null | head -1)

然后对所有命令使用完整路径:

$DRUGBANK_SCRIPT "ACE inhibitors" 15

API 密钥设置流程

运行搜索并收到 "setup_required": true 时,请按以下流程操作:

  1. 向用户索取 API 密钥: “要搜索 DrugBank,我需要你的 Valyu API 密钥。前往 https://platform.valyu.ai 免费获取(含 $10 额度)。”

  2. 用户提供密钥后,运行:

    scripts/search setup <api-key>
    
  3. 重试原始搜索。

何时使用此技能

  • 全面查询药物信息
  • 研究药物相互作用和副作用
  • 识别并验证靶点
  • 研究作用机制
  • 研究药代动力学和药效学
  • 查询药物代谢和不良事件数据

输出格式

{
  "success": true,
  "type": "drugbank_search",
  "query": "ACE inhibitors",
  "result_count": 10,
  "results": [
    {
      "title": "Drug Name",
      "url": "https://drugbank.com/...",
      "content": "Drug information, mechanism, interactions...",
      "source": "drugbank",
      "relevance_score": 0.95,
      "images": ["https://example.com/structure.png"]
    }
  ],
  "cost": 0.025
}

处理结果

使用 jq
# Get drug names
scripts/search "query" 10 | jq -r '.results[].title'

# Get URLs
scripts/search "query" 10 | jq -r '.results[].url'

# Extract full content
scripts/search "query" 10 | jq -r '.results[].content'

常见使用场景

药物信息
# Find drug details
scripts/search "metformin pharmacokinetics" 50
药物相互作用
# Search for interactions
scripts/search "CYP3A4 inhibitor drug interactions" 20
作用机制研究
# Find mechanism data
scripts/search "selective serotonin reuptake inhibitors mechanism" 15
靶点识别
# Search for drug targets
scripts/search "drugs targeting BCR-ABL fusion protein" 25

错误处理

所有命令均返回包含 success 字段的 JSON:

{
  "success": false,
  "error": "Error message"
}

退出代码:

  • 0 - 成功
  • 1 - 出错(查看 JSON 获取详情)

API 端点

  • 基础 URL:https://api.valyu.ai/v1
  • 端点:/search
  • 身份验证:X-API-Key 标头

架构

scripts/
├── search          # Bash wrapper
└── search.mjs      # Node.js CLI

使用 Node.js 内置的 fetch() 直接调用 API,无需任何外部依赖。

添加到你的项目

如果你正在构建 AI 项目,并希望将 DrugBank 搜索直接集成到应用中,请使用 Valyu SDK:

Python 集成
from valyu import Valyu

client = Valyu(api_key="your-api-key")

response = client.search(
    query="your search query here",
    included_sources=["valyu/valyu-drugbank"],
    max_results=20
)

for result in response["results"]:
    print(f"Title: {result['title']}")
    print(f"URL: {result['url']}")
    print(f"Content: {result['content'][:500]}...")
TypeScript 集成
import { Valyu } from "valyu-js";

const client = new Valyu("your-api-key");

const response = await client.search({
  query: "your search query here",
  includedSources: ["valyu/valyu-drugbank"],
  maxResults: 20
});

response.results.forEach((result) => {
  console.log(`Title: ${result.title}`);
  console.log(`URL: ${result.url}`);
  console.log(`Content: ${result.content.substring(0, 500)}...`);
});

有关完整的集成示例和 SDK 参考,请参阅 Valyu 文档。

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