关于 ginkgo-cloud-lab
Ginkgo Cloud Lab 提供对 Ginkgo Bioworks 自动化实验室设施的远程访问,面向蛋白质表达实验及其他定制流程。用户可提交预设协议,或用 EstiMate 描述定制实验并获取可行性评估与报价。
主要功能
- 01提交蛋白质表达验证与优化实验
- 02将像素艺术转为荧光细菌图像
- 03上传序列或图像文件并配置实验
- 04通过 EstiMate 评估定制流程
- 05依托机器人设备执行实验
适用场景
- 01筛查蛋白质是否成功表达
- 02优化难表达或膜蛋白的表达条件
- 03制作荧光细菌像素艺术
- 04评估未列出实验流程的可行性与价格
安装
复制下面的命令,在终端中运行。
npx skills add https:/ / github.com/ crazymsn/ academic-skills --skill ginkgo-cloud-lab安装后在 Claude Code 中输入/ginkgo-cloud-lab确认已加载。
包含的文件
除 SKILL.md 外,安装时一起下载的参考资料和脚本。
references/cell-free-protein-expression-optimization.mdcell-free-protein-expression-validation.mdfluorescent-pixel-art-generation.md详细介绍
Ginkgo Cloud Lab
概述
Ginkgo Cloud Lab(https://cloud.ginkgo.bio)提供对 Ginkgo Bioworks 自主实验室基础设施的远程访问。协议在可重构自动化推车(RAC)上执行——这些模块化单元配备机械臂、磁悬浮样本运输系统,以及涵盖 70 多种仪器的工业级软件。
该平台还包含 EstiMate,这是一款 AI Agent,可接收自然语言描述的协议,并针对列表之外的定制工作流提供可行性评估和报价。
可用协议
1. 无细胞蛋白质表达验证
使用重构的大肠杆菌 CFPS,快速筛选表达是否可行。提交 FASTA 序列(最多 1800 bp),即可获得表达确认、基准滴度(mg/L)、初步纯度以及虚拟凝胶图像。
- **价格:**39 美元/样本 | **周转时间:**5-10 天 | **状态:**已认证
- **详情:**参见 references/cell-free-protein-expression-validation.md
2. 无细胞蛋白质表达优化
基于 DoE 的优化,每种蛋白质最多测试 24 种条件(裂解液、温度、伴侣蛋白、二硫键增强剂、辅因子)。适用于难以表达的蛋白质和膜蛋白。
- **价格:**199 美元/样本 | **周转时间:**6-11 天 | **状态:**已认证
- **详情:**参见 references/cell-free-protein-expression-optimization.md
3. 荧光像素艺术生成
将像素艺术图像(48x48 至 96x96 px,PNG/SVG)转换为荧光细菌艺术作品,使用声学分液技术,最多可用 11 种大肠杆菌菌株。交付高分辨率紫外照片。
- **价格:**25 美元/板 | **周转时间:**5-7 天 | **状态:**Beta
- **详情:**参见 references/fluorescent-pixel-art-generation.md
常规订购流程
- 在 https://cloud.ginkgo.bio/protocols 选择协议
- 配置参数(样本/蛋白质数量、重复次数、板数)
- 上传输入文件(蛋白质协议需上传 FASTA,像素艺术需上传 PNG/SVG)
- 在 Additional Details 字段中填写任何特殊要求
- 提交后即可收到可行性报告和报价
对于上述列表中未列出的协议,请使用 EstiMate 聊天功能,以通俗语言描述自定义协议,并获取兼容性评估和报价。
身份验证
访问 Ginkgo Cloud Lab:https://cloud.ginkgo.bio。可能需要创建账户或通过机构访问。如有访问问题,请联系 Ginkgo:[email protected]。
核心基础设施
- **RAC(可重构自动化推车):**配备高精度机械臂和磁悬浮运输系统的模块化机器人单元
- **Catalyst Software:**用于协议编排、调度、参数设置和实时监控
- **70 多种集成仪器:**用于样本制备、液体处理、分析检测、存储和孵育
- **Nebula:**Ginkgo 位于马萨诸塞州波士顿的自主实验室设施