关于 literature-search
通过命令行以自然语言同时搜索 PubMed、arXiv、bioRxiv 和 medRxiv,适用于文献综述与科研发现,并提供语义匹配、文章全文及可用图片。
主要功能
- 01自然语言语义搜索
- 02同时检索四个文献来源
- 03文章全文内容
- 04提供可用图表和图片
- 05命令行统一输出 JSON
适用场景
- 01跨来源文献综述
- 02跨学科研究发现
- 03查找近期预印本
- 04生物医学研究检索
安装
复制下面的命令,在终端中运行。
$
npx skills add https:/ / github.com/ yorkeccak/ scientific-skills --skill literature-search安装后在 Claude Code 中输入/literature-search确认已加载。
附带文件scripts/searchscripts/search.mjs
详细介绍
文献搜索
使用 Valyu 的语义搜索 API,通过自然语言查询同时搜索所有主要科学文献数据库(PubMed、arXiv、bioRxiv、medRxiv)。
此技能的强大之处
- 无需解析 API 参数:直接传入自然语言查询即可,无需构造复杂的搜索参数
- 语义搜索:理解查询的含义,而不只是匹配关键词
- 全文访问:返回完整的文章内容,而不只是摘要
- 图片链接:包含论文中的图表和图片
- 全面覆盖:同时搜索 PubMed、arXiv、bioRxiv 和 medRxiv
- 统一结果:通过一次查询即可获取所有来源的结果
要求
- Node.js 18+(使用内置的 fetch)
- Valyu API 密钥,获取地址:https://platform.valyu.ai(提供 $10 免费额度)
重要:脚本路径解析
本文档中的 scripts/search 命令是相对于此技能的安装目录而言的。
运行任何命令前,请先使用以下命令找到脚本:
LITERATURE_SCRIPT=$(find ~/.claude/plugins/cache -name "search" -path "*/literature-search/*/scripts/*" -type f 2>/dev/null | head -1)
然后在所有命令中使用完整路径:
$LITERATURE_SCRIPT "CRISPR gene editing advances" 15
API 密钥设置流程
运行搜索并收到 "setup_required": true 时,请按以下流程操作:
-
向用户索要 API 密钥: “要搜索科学文献,我需要你的 Valyu API 密钥。前往 https://platform.valyu.ai 免费获取(含 $10 额度)。”
-
用户提供密钥后,运行:
scripts/search setup <api-key> -
重试原始搜索。
何时使用此技能
- 跨领域开展全面的文献综述
- 查找某个主题的所有相关研究
- 跨领域科学探索
- 汇总生物医学、物理学和预印本文献
- 跟踪各学科的新兴研究
输出格式
{
"success": true,
"type": "literature_search",
"query": "CRISPR gene editing advances",
"result_count": 15,
"results": [
{
"title": "Article Title",
"url": "https://...",
"content": "Full article text with figures...",
"source": "pubmed|arxiv|biorxiv|medrxiv",
"relevance_score": 0.95,
"images": ["https://example.com/figure1.jpg"]
}
],
"cost": 0.025
}
处理结果
使用 jq
# Get article titles
scripts/search "query" 20 | jq -r '.results[].title'
# Get URLs
scripts/search "query" 20 | jq -r '.results[].url'
# Extract full content
scripts/search "query" 20 | jq -r '.results[].content'
# Filter by source
scripts/search "query" 20 | jq -r '.results[] | select(.source == "arxiv") | .title'
常见用例
全面的文献综述
# Search across all sources for thorough review
scripts/search "mechanisms of cellular senescence" 100
跨学科研究
# Find papers spanning multiple fields
scripts/search "quantum computing applications in drug discovery" 50
最新进展
# Get latest preprints and publications
scripts/search "foundation models for protein folding" 30
医学研究
# Search biomedical literature comprehensively
scripts/search "immunotherapy checkpoint inhibitors resistance" 40
错误处理
所有命令都会返回带有 success 字段的 JSON:
{
"success": false,
"error": "Error message"
}
退出代码:
0- 成功1- 错误(查看 JSON 了解详情)
API 端点
- 基础 URL:
https://api.valyu.ai/v1 - 端点:
/search - 身份验证:X-API-Key 请求头
架构
scripts/
├── search # Bash wrapper
└── search.mjs # Node.js CLI
直接使用 Node.js 内置的 fetch() 调用 API,无需任何外部依赖。
添加到项目中
如果你正在构建 AI 项目,并希望将 Literature Search 直接集成到应用中,请使用 Valyu SDK:
Python 集成
from valyu import Valyu
client = Valyu(api_key="your-api-key")
response = client.search(
query="your search query here",
included_sources=["valyu/valyu-pubmed", "valyu/valyu-arxiv", "valyu/valyu-biorxiv", "valyu/valyu-medrxiv"],
max_results=20
)
for result in response["results"]:
print(f"Title: {result['title']}")
print(f"URL: {result['url']}")
print(f"Content: {result['content'][:500]}...")
TypeScript 集成
import { Valyu } from "valyu-js";
const client = new Valyu("your-api-key");
const response = await client.search({
query: "your search query here",
includedSources: ["valyu/valyu-pubmed", "valyu/valyu-arxiv", "valyu/valyu-biorxiv", "valyu/valyu-medrxiv"],
maxResults: 20
});
response.results.forEach((result) => {
console.log(`Title: ${result.title}`);
console.log(`URL: ${result.url}`);
console.log(`Content: ${result.content.substring(0, 500)}...`);
});
请参阅 Valyu 文档,了解完整的集成示例和 SDK 参考。
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