nature-writing

Nature 风格科学写作 — 路由器

路由协议

对于新的撰写任务，请遵循以下路由。对于后续编辑，请复用已确定的任务选择和已加载的指南；仅当请求的范围发生变化时，才读取额外的片段。

1. 加载清单和核心层

读取 manifest.yaml。它声明了各个轴（task、paper_type、section、language、journal）、允许的取值，以及每个取值映射到的文件路径。

同时读取 always_load 下列出的每个文件。这些文件包含适用于每个撰写任务的默认立场、写作工作流和输出格式。

2. 检测此请求的轴取值

对于清单中的每个轴，使用清单的 detect: 提示和用户的输入来确定取值：

• task — manuscript / submission-package。对于首次投稿材料使用 submission-package，绝不用于修稿通信。
• paper_type — research / methods / hypothesis / algorithmic / review。默认：research。
• section — abstract / intro / related-work / method / experiments / discussion / conclusion / title。可以有多个。如果有歧义且对草稿有影响，请询问用户。
• language — en 或 zh-to-en。从用户自己的笔记中检测。
• journal — nature / nature-family / nat-comms / nat-mach-intell / generic。 默认：generic。仅对旗舰期刊 Nature 使用 nature， 对 Nature Communications 使用 nat-comms，对 Nature Machine Intelligence（NMI）使用 nat-mach-intell，对其他 Nature Portfolio 期刊或 未指明的 Nature 系列请求使用 nature-family。

在撰写之前，用一行简短的话向用户说明检测到的轴取值，以便他们可以低成本地纠正你。这是进度更新，不是审批关卡；除非仍有必要的决定未解决，否则继续。

3. 加载匹配的片段

对于每个轴取值，读取清单中映射的文件。当任务为 submission-package 或用户明确要求一段没有章节上下文的自由论证段落时，跳过 section 轴。

不要读取 static/ 中的每个片段。只加载第 2 步选中的内容。

4. 使用已加载的材料起草

按以下优先级顺序应用已加载的片段：

1. 核心立场 + 信息采集（core/stance.md）—— 在起草前揭示缺失的论断 / 证据 / 边界。
2. 论文类型操作手册 —— 论证链、起草顺序。
3. 章节特定的起草规则与结构。
4. 当 task=submission-package 时，任务特定的投稿规则。
5. 期刊特定的框架与约束。
6. 语言特定的句子与段落规则（最后应用）。

对于 task=manuscript，按要求的规模使用 core/workflow.md。为新章节或重大重构规划论证；标题、单个段落或局部后续补充只需适用的证据、措辞和一致性检查。完成所要求的正文，除非有未解决的重大决策阻碍，或用户要求先提供大纲以供批准。

在起草或重构 Results，或压缩完整稿件的主 文时，还要在构建段落图之前加载 ../nature-shared/core/main-text-discipline.md。按功能对每个结果进行分类，将其分配到主文、图注、Methods/source data 和 SI，然后起草最短的充分证据链。不要将完整的分析记录等同于完整的主文。

当目标为旗舰 Nature、Nature Communications、Nature Machine Intelligence 或其他 Nature Portfolio 刊物时，为正在起草的章节加载匹配的共享 Nature 风格语料指南：

• Results 或 Discussion → ../nature-shared/core/nature-results-discussion.md
• Introduction 或整稿叙事 → ../nature-shared/core/nature-introduction.md
• Abstract → ../nature-shared/core/nature-abstract.md

使用这些文件进行论断升级、问题链对齐、 以发现为中心的压缩和综合。它们最初提炼自已发表的 NMI 论文，并作为 Nature 风格默认值加以泛化；不要将其作为官方政策呈现，并让目标期刊的当前规则覆盖它们。

对于任何 Discussion 起草、重构或章节审查，还要加载 ../nature-shared/core/discussion-argument-language.md。使用它来选择开篇锚点、控制反向漏斗式扩展、区分文献定位与引用装饰、根据证据校准情态强度，并将局限性与未来工作转化为针对具体论断的推理。这是一般写作指导，而非官方期刊规则。

对于 task=submission-package，请改为遵循 static/fragments/task/submission-package.md 和 references/submission-package.md。构建交付物矩阵和就绪度审查；不要将稿件段落架构强加于行政投稿材料。

如果缺少必要证据或边界，请写一个占位符，并将其列在 Assumptions or missing inputs: 下，而不是编造内容。

5. 仅在需要时才查阅参考资料

references/ 下的文件是深度参考资料和示例库，而非默认内容。请根据 manifest 中的 references.on_demand 表按需打开它们。典型触发条件：

• 用户要求提供具体示例或模板 → references/examples/index.md。
• 某章节的草稿存在结构性问题，而仅凭该章节片段无法解释 → 对应的 references/<section>.md。
• 用户需要面向广泛读者的 Nature 摘要开篇，或询问 summary paragraph → references/nature-summary-paragraph.md。
• 用户问“这段文字是否流畅？” → references/paragraph-flow.md。
• 用户要求自我审查或拒稿风险审计 → references/paper-review.md。
• 用户询问哪些内容应放在正文、图注或 SI 中；想要更短的 Results 章节；或正在添加由审稿人驱动的解释 → ../nature-shared/core/main-text-discipline.md。
• 用户要求完整的首次投稿材料包、模板，或投稿就绪度审计 → references/submission-package.md。
• 目标期刊是旗舰期刊 Nature，且确切的投稿或格式要求很重要 → ../nature-shared/journal-formats/nature.md。
• 目标期刊是 Nature Machine Intelligence，且确切的内容类型、投稿、 数据/代码或出版要求很重要 → ../nature-shared/journal-formats/nature-machine-intelligence.md。
• 任何 Nature / Nature Portfolio 目标需要 Results 主张推进、 证据约束的解释、稳健性内容的位置安排，或 Discussion 综合 → ../nature-shared/core/nature-results-discussion.md。
• 任何目标需要 Discussion 功能链、证据校准的情态语言、 针对具体主张的局限性、非冗余的文献定位， 或由不确定性驱动的未来工作 → ../nature-shared/core/discussion-argument-language.md。
• 任何 Nature / Nature Portfolio 目标需要 Introduction 漏斗、确切的空白、 文献逻辑、问题优先的新颖性、研究路线图，或与 Results 的一致性 → ../nature-shared/core/nature-introduction.md。
• 任何 Nature / Nature Portfolio 目标需要摘要证据链、 主要/支持性主张、数值结果，或最终收益决策 → ../nature-shared/core/nature-abstract.md。
• 该工作涉及受监管或专业研究的合规性 → ../nature-shared/core/research-compliance.md。

投稿边界

• nature-writing 负责同行评审前准备的首次投稿材料。
• nature-response 负责修改说明信、反驳信、逐点回复、标记稿、申诉，以及其他决定后的往来信件。
• 将图形摘要和 TOC 图转交给 nature-figure；将模拟的投稿前同行评审转交给 nature-reviewer。