open-targets-search

Open Targets 搜索

使用由 Valyu 语义搜索 API 提供支持的自然语言查询，搜索完整的 Open Targets 药物-疾病关联和靶点验证数据数据库。

此技能的强大之处

• 无需解析 API 参数：直接传入自然语言查询即可，无需构造复杂的搜索参数
• 语义搜索：理解查询的含义，而不只是匹配关键词
• 全文访问：返回完整的靶点-疾病关联数据及证据评分
• 图片链接：在可用时包含数据可视化内容
• 全面覆盖：可访问所有 Open Targets 药物-疾病关联数据

要求

1. Node.js 18+（使用内置 fetch）
2. Valyu API 密钥，获取地址为 https://platform.valyu.ai（含 $10 免费额度）

重要：脚本路径解析

本文档中的 scripts/search 命令相对于此技能的安装目录。

运行任何命令之前，请先定位脚本：

OPEN_TARGETS_SCRIPT=$(find ~/.claude/plugins/cache -name "search" -path "*/open-targets-search/*/scripts/*" -type f 2>/dev/null | head -1)

然后在所有命令中使用完整路径：

$OPEN_TARGETS_SCRIPT "JAK2 inhibitors" 15

API 密钥设置流程

运行搜索并收到 "setup_required": true 时，请按以下流程操作：

1. 向用户索取 API 密钥： “要搜索 Open Targets，我需要你的 Valyu API 密钥。请前往 https://platform.valyu.ai 免费获取（含 $10 额度）。”

2. 用户提供密钥后，运行：

   scripts/search setup <api-key>
   

3. 重试原始搜索。

何时使用此技能

• 疾病的靶点验证
• 药物-疾病关联
• 研究中的靶点优先级排序
• 靶点的遗传学证据
• 靶点-疾病通路分析
• 治疗假设验证

输出格式

{
  "success": true,
  "type": "open_targets_search",
  "query": "JAK2 inhibitors",
  "result_count": 10,
  "results": [
    {
      "title": "Target-Disease Association",
      "url": "https://platform.opentargets.org/...",
      "content": "Association data, evidence, scores...",
      "source": "open-targets",
      "relevance_score": 0.95,
      "images": ["https://example.com/pathway.png"]
    }
  ],
  "cost": 0.025
}

处理结果

使用 jq

# Get association titles
scripts/search "query" 10 | jq -r '.results[].title'

# Get URLs
scripts/search "query" 10 | jq -r '.results[].url'

# Extract full content
scripts/search "query" 10 | jq -r '.results[].content'

常见用例

靶点验证

# Find target evidence
scripts/search "kinase targets in inflammatory diseases" 50

药物再利用

# Search for repurposing opportunities
scripts/search "drugs targeting IL-6 pathway" 20

遗传学证据

# Find genetic associations
scripts/search "loss of function variants protective effects" 15

疾病机制

# Search for mechanistic insights
scripts/search "immune checkpoint targets in cancer" 25

错误处理

所有命令都会返回包含 success 字段的 JSON：

{
  "success": false,
  "error": "Error message"
}

退出代码：

• 0 - 成功
• 1 - 错误（查看 JSON 了解详情）

API 端点

• 基础 URL：https://api.valyu.ai/v1
• 端点：/search
• 身份验证：X-API-Key 标头

架构

scripts/
├── search          # Bash wrapper
└── search.mjs      # Node.js CLI

使用 Node.js 内置 fetch() 直接调用 API，无任何外部依赖。

添加到你的项目

如果你正在构建 AI 项目，并希望将 Open Targets Search 直接集成到应用中，请使用 Valyu SDK：

Python 集成

from valyu import Valyu

client = Valyu(api_key="your-api-key")

response = client.search(
    query="your search query here",
    included_sources=["valyu/valyu-open-targets"],
    max_results=20
)

for result in response["results"]:
    print(f"Title: {result['title']}")
    print(f"URL: {result['url']}")
    print(f"Content: {result['content'][:500]}...")

TypeScript 集成

import { Valyu } from "valyu-js";

const client = new Valyu("your-api-key");

const response = await client.search({
  query: "your search query here",
  includedSources: ["valyu/valyu-open-targets"],
  maxResults: 20
});

response.results.forEach((result) => {
  console.log(`Title: ${result.title}`);
  console.log(`URL: ${result.url}`);
  console.log(`Content: ${result.content.substring(0, 500)}...`);
});

有关完整的集成示例和 SDK 参考，请参阅 Valyu 文档。