sci-search

Sci-Search — Sci Search 技能

用于科研工作流的学术论文搜索和指标分析工具。

触发短语

-“搜索关于 [主题] 的高影响因子论文” -“在 Web of Science 上查找 [主题] 的最新文献” -“搜索关于 [topic] 的学术论文” -“在 Web of Science 上查找关于 [topic] 的最新论文” -“获取 [topic] 论文的影响因子”

功能

• 七大来源搜索：同时搜索 arXiv、PubMed、Web of Science、Springer Nature、Scopus、Semantic Scholar 和 OpenAlex（配置密钥后可启用需要 API 密钥的来源）。
• Web of Science 集成：返回 SCI 收录论文及其被引次数，这是学术质量筛选的黄金标准。
• Springer Nature 集成：返回 Springer、Nature、Palgrave Macmillan 及其他 Springer Nature 品牌旗下的文章，并附带 DOI 链接。
• Scopus 集成：Elsevier 最大的摘要和引文数据库；返回被引次数。
• Semantic Scholar 集成：由 AI 驱动的学术图谱，包含引用次数；无需 API 密钥。
• OpenAlex 集成：免费开放的学术作品目录，收录超过 2 亿篇作品；无需 API 密钥。
• 期刊指标：自动为搜索结果补充 JCR 分区和影响因子（IF）。
• 排名与突出显示：突出显示顶级期刊（Nature、Science、Advanced Materials 等）。
• Markdown 导出：生成格式化的搜索结果 Markdown 报告。
• 来源选择：使用 --source scopus、--source springer、--source semantic_scholar、--source openalex、--source wos 或 --source all 搜索所有来源。

配置

Web of Science API（推荐用于 SCI 文献）

将 WOS_API_KEY 添加到统一的 ~/.aut_sci_write/.env 文件中，以启用 Web of Science 搜索：

WOS_API_KEY=your_wos_api_key

在此申请免费 API 密钥：https://developer.clarivate.com/apis/wos-starter

WoS Starter API 可免费申请，并可访问 Web of Science Core Collection——最权威的 SCI/SSCI 期刊索引。

Springer Nature API（两个端点）

Springer Nature API 提供两个独立的端点：

1. Metadata API（/meta/v2/json）——Springer Nature 所有内容（期刊 + 图书）的元数据。 将 SPRINGER_API_KEY 添加到 ~/.aut_sci_write/.env：

SPRINGER_API_KEY=your_springer_api_key

2. Open Access API（/openaccess/json）——来自 BMC、SpringerOpen 和 Nature OA 文章的全文开放获取内容。 将 SPRINGER_OA_API_KEY 添加到 ~/.aut_sci_write/.env（如果未设置，则使用 SPRINGER_API_KEY）：

SPRINGER_OA_API_KEY=your_oa_api_key

在此免费申请 API 密钥：https://dev.springernature.com/

使用 --source springer 搜索两者，使用 --source springer_meta 仅搜索元数据，或使用 --source springer_oa 仅搜索开放获取内容。

Scopus API（Elsevier——最大的摘要数据库）

将 SCOPUS_API_KEY 添加到 ~/.aut_sci_write/.env，以启用 Scopus 搜索：

SCOPUS_API_KEY=your_scopus_api_key

在此申请免费 API 密钥：https://dev.elsevier.com/

Scopus Search API 涵盖科学、技术、医学、社会科学以及艺术与人文学科领域的 9,000 多万条记录。完整访问权限需要机构 affiliation。

Semantic Scholar（免费，无需密钥）

开箱即用。如需更高的请求速率限制，可选择添加：

SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY=your_key

在此申请密钥：https://www.semanticscholar.org/product/api#api-key

OpenAlex（免费，无需密钥）

开箱即用。如需使用礼貌请求池（更快的请求速率限制），可选择添加：

[email protected]

其他可选的 .env 值（均在 ~/.aut_sci_write/.env 中）

• SPRINGER_API_KEY - Springer Nature Metadata API 密钥（见上文）
• SPRINGER_OA_API_KEY - Springer Nature Open Access API 密钥（未设置时使用 SPRINGER_API_KEY）
• SCOPUS_API_KEY - Elsevier Scopus API 密钥（见上文）
• SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY - 可选，用于提高速率限制
• OPENALEX_EMAIL - 可选，用于访问礼貌池
• NCBI_API_KEY - 可选的 PubMed/NCBI E-utilities API 密钥，用于提高速率限制
• NCBI_EMAIL - 可选，发送给 NCBI E-utilities 的联系邮箱
• NCBI_TOOL - 可选的 NCBI 工具名称；默认为 sci-search
• ZOTERO_USER_ID — 用于 Zotero 集成
• ZOTERO_API_KEY — 用于 Zotero 集成

用法

主脚本：./sci_search.py

# Search all sources (arXiv + PubMed + WoS + Springer + Scopus + Semantic Scholar + OpenAlex)
python skills/sci-search/sci_search.py "perovskite solar cells" --limit 5

# Search Web of Science only
python skills/sci-search/sci_search.py "solid state electrolyte" --source wos --limit 10

# Search PubMed only with NCBI E-utilities
python skills/sci-search/sci_search.py "cancer immunotherapy" --source pubmed --limit 10

# Search Springer Nature only
python skills/sci-search/sci_search.py "machine learning materials science" --source springer --limit 10

# Search Scopus only
python skills/sci-search/sci_search.py "lithium ion battery" --source scopus --limit 10

# Search Semantic Scholar only (no key needed)
python skills/sci-search/sci_search.py "transformer attention mechanism" --source semantic_scholar --limit 10

# Search OpenAlex only (no key needed)
python skills/sci-search/sci_search.py "CRISPR gene editing" --source openalex --limit 10

# Export results to markdown
python skills/sci-search/sci_search.py "graphene battery" --output results.md

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• 作者：Shuo Zhao
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