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scientific-writing

scientific-writing

github.com/crazymsn文档处理2338 次安装22 周前更新
代码仓库

关于 scientific-writing

面向研究人员的科学论文写作技能,涵盖论文结构、引文、报告规范和图表,并指导从提纲扩展为完整段落。

主要功能

  1. 01IMRAD 与其他论文结构
  2. 02各论文部分的写作指导
  3. 03APA、AMA、Vancouver 等引文格式
  4. 04图表与研究报告规范

适用场景

  1. 01起草或修改论文部分
  2. 02准备期刊投稿稿件
  3. 03应用研究类型对应的报告规范

安装

复制下面的命令,在终端中运行。

$npx skills add https://github.com/crazymsn/academic-skills --skill scientific-writing

安装后在 Claude Code 中输入/scientific-writing确认已加载。

包含的文件

除 SKILL.md 外,安装时一起下载的参考资料和脚本。

assets/
REPORT_FORMATTING_GUIDE.md
scientific_report_template.tex
scientific_report.sty
references/
citation_styles.md
figures_tables.md
imrad_structure.md
professional_report_formatting.md
reporting_guidelines.md
writing_principles.md
scripts/
generate_image.py
generate_schematic_ai.py
generate_schematic.py

详细介绍

科学写作

概述

这是深度研究与写作工具的核心技能——将 AI 驱动的深度研究与格式规范的书面成果相结合。通过 research-lookup 技能进行全面的文献检索并核实引文,为生成的每份文档提供依据。

科学写作是以精准、清晰的方式传达研究成果的过程。撰写论文时应采用 IMRAD 结构,使用引文格式(APA/AMA/Vancouver)、图表和报告指南(CONSORT/STROBE/PRISMA)。研究论文和期刊投稿均可应用此技能。

**核心原则:始终使用完整段落和流畅的行文。最终稿件中绝不使用项目符号。**采用两阶段流程:首先使用 research-lookup 创建包含要点的章节提纲,然后将提纲扩展为完整段落。

何时使用此技能

在以下情况下应使用此技能:

  • 撰写或修改科学论文的任何部分(摘要、引言、方法、结果、讨论)
  • 使用 IMRAD 或其他标准格式组织研究论文
  • 按特定格式规范整理引文和参考文献(APA、AMA、Vancouver、Chicago、IEEE)
  • 创建、排版或改进图、表和数据可视化
  • 应用特定研究类型的报告指南(试验适用 CONSORT、观察性研究适用 STROBE、综述适用 PRISMA)
  • 撰写符合期刊要求的摘要(结构式或非结构式)
  • 准备稿件以投稿至特定期刊
  • 提高写作的清晰度、简洁性和精准度
  • 确保正确使用领域术语和命名法
  • 回复审稿意见并修改稿件

使用科学示意图增强视觉效果

⚠️ 强制要求:每篇科学论文都 MUST 包含图形摘要,以及使用 scientific-schematics 技能生成的 1-2 张额外图片。

这不是可选项。没有视觉元素的科学论文是不完整的。定稿前:

  1. 务必首先生成图形摘要,作为第一个视觉元素
  2. 使用 scientific-schematics 至少再生成一张示意图或图解
  3. 综合性论文建议共使用 3-4 张图(图形摘要 + 方法流程图 + 结果可视化图 + 概念图)
图形摘要(必需)

**每篇科学写作稿都 MUST 包含图形摘要。**图形摘要是对论文的可视化总结,要求如下:

  • 放在文字摘要之前或紧接其后
  • 通过一张图片概括论文的核心信息
  • 适合刊载于期刊目录中
  • 采用横向布局(通常为 1200x600px)

首先生成图形摘要:

python scripts/generate_schematic.py "Graphical abstract for [paper title]: [brief description showing workflow from input → methods → key findings → conclusions]" -o figures/graphical_abstract.png

图形摘要要求:

  • 内容:通过可视化呈现工作流程、关键方法、主要发现和结论
  • 风格:简洁、专业,适合期刊目录使用
  • 元素:包含 3-5 个关键步骤/概念,并用箭头或流程连接
  • 文字:标签尽量精简,字体清晰易读
  • 日志记录:[HH:MM:SS] GENERATED: Graphical abstract for paper summary
附加图示(大量生成)

⚠️ 重要:在所有文档中大量使用 scientific-schematics 和 generate-image。

每份文档都应配有丰富的图示。尽可能多地生成图示——拿不准时,就添加一张图。

最低图示要求:

文档类型最低数量建议数量
研究论文56-8
文献综述45-7
市场调研2025-30
演示文稿1/页1-2/页
海报68-10
资助申请45-7
临床报告34-6

大量使用 scientific-schematics 绘制技术图表:

python scripts/generate_schematic.py "your diagram description" -o figures/output.png
  • 研究设计和方法流程图(CONSORT、PRISMA、STROBE)
  • 概念框架图
  • 实验工作流示意图
  • 数据分析流程图
  • 生物通路或机制图
  • 系统架构可视化图
  • 神经网络架构图
  • 决策树、算法流程图
  • 对比矩阵、时间线图
  • 任何适合用示意图呈现的技术概念

大量使用 generate-image 创建视觉内容:

python scripts/generate_image.py "your image description" -o figures/output.png
  • 概念的写实插图
  • 医学/解剖学插图
  • 环境/生态场景
  • 设备和实验室设置可视化图
  • 艺术化可视化图、信息图
  • 封面图片、页眉图
  • 产品模型图、原型可视化图
  • 任何有助于提升理解或参与度的视觉内容

AI 将自动:

  • 创建格式规范、达到出版质量的图像
  • 通过多轮迭代进行审阅和完善
  • 确保无障碍性(色盲友好、高对比度)
  • 将输出保存到 figures/ 目录

拿不准时,就生成图示:

  • 复杂概念 → 生成示意图
  • 数据讨论 → 生成可视化图
  • 流程描述 → 生成流程图
  • 对比 → 生成对比图
  • 有益于读者 → 生成视觉内容

如需详细指南,请参阅 scientific-schematics 和 generate-image 技能文档。


核心能力

1. 稿件结构与组织

IMRAD 格式:按照科学领域普遍采用的标准引言、方法、结果与讨论结构指导论文撰写。包括:

  • 引言:阐明研究背景,指出研究空白,陈述研究目标
  • 方法:详细说明研究设计、研究人群、流程和分析方法
  • 结果:客观呈现发现,不作解释
  • 讨论:解读结果,承认局限性,提出未来研究方向

如需 IMRAD 结构的详细指南,请参阅 references/imrad_structure.md。

其他结构:支持特定学科的格式,包括:

  • 综述文章(叙述性、系统性、范围综述)
  • 病例报告和病例系列
  • Meta 分析和汇总分析
  • 理论/建模论文
  • 方法论文和方案
2. 特定章节的写作指南

摘要撰写:撰写简洁、独立成篇的摘要(100-250 词),概述论文的目的、方法、结果和结论。支持带有明确分节标题的结构式摘要,以及单段式非结构化摘要。

引言撰写:撰写引人入胜的引言,以:

  • 阐明研究问题的重要性
  • 系统回顾相关文献
  • 指出知识空白或争议
  • 明确提出研究问题或假设
  • 说明研究的新颖性和重要意义

方法撰写:通过以下内容确保研究可重复:

  • 详细描述参与者/样本
  • 清晰记录研究流程
  • 说明统计方法并阐述选择理由
  • 详细说明设备和材料
  • 声明伦理审批和知情同意情况

结果呈现:呈现研究发现时,应:

  • 按照从主要结局到次要结局的逻辑顺序展开
  • 结合图和表呈现结果
  • 报告统计显著性和效应量
  • 客观报告,不作解读

讨论撰写:综合研究发现时,应:

  • 将结果与研究问题联系起来
  • 与现有文献进行比较
  • 如实承认局限性
  • 提出可能的机制解释
  • 探讨实际意义和未来研究方向
3. 引文和参考文献管理

在不同学科中正确应用引文格式。完整的格式指南请参阅 references/citation_styles.md。

主要引文格式:

  • AMA(美国医学会):采用上标编号引文,医学领域常用
  • Vancouver:采用方括号编号引文,是生物医学领域的标准格式
  • APA(美国心理学会):采用作者-日期文内引文,社会科学领域常用
  • Chicago:采用注释-书目制或作者-日期制,适用于人文和科学领域
  • IEEE:采用方括号编号引文,适用于工程和计算机科学领域

最佳实践:

  • 尽可能引用原始来源
  • 纳入近期文献(活跃领域近 5-10 年的文献)
  • 在引言和讨论中均衡分布引文
  • 对照原始来源核实所有引文
  • 使用参考文献管理软件(Zotero、Mendeley、EndNote)
4. 图和表

制作有助于理解的有效数据可视化。详细的最佳实践请参阅 references/figures_tables.md。

何时使用表格,何时使用图:

  • 表格:适用于精确数值数据、复杂数据集,以及需要呈现确切数值的多个变量
  • 图:适用于趋势、模式、关系和通过视觉呈现更易理解的比较

设计原则:

  • 为每个表/图添加完整标题,使其内容不言自明
  • 在所有展示内容中使用一致的格式和术语
  • 为所有坐标轴、列和行标注单位
  • 注明样本量(n)和统计标注
  • 遵循“每 1000 词一张表/图”的原则
  • 避免在正文、表和图之间重复信息

常见图表类型:

  • 柱状图:比较离散类别
  • 折线图:显示随时间变化的趋势
  • 散点图:展示相关性
  • 箱线图:显示分布和离群值
  • 热力图:可视化矩阵和模式
5. 按研究类型划分的报告指南

遵循既定的报告标准,确保报告完整、透明。有关指南的详细信息,请参阅 references/reporting_guidelines.md。

主要指南:

  • CONSORT:随机对照试验
  • STROBE:观察性研究(队列研究、病例对照研究、横断面研究)
  • PRISMA:系统综述和荟萃分析
  • STARD:诊断准确性研究
  • TRIPOD:预测模型研究
  • ARRIVE:动物研究
  • CARE:病例报告
  • SQUIRE:质量改进研究
  • SPIRIT:临床试验研究方案
  • CHEERS:经济学评价

每项指南都提供核对清单,确保报告涵盖所有关键方法学要素。

6. 写作原则与风格

遵循科学写作的基本原则。有关详细指导,请参阅 references/writing_principles.md。

清晰:

  • 使用准确、明确的语言
  • 首次使用时定义专业术语和缩写
  • 确保段落内部及段落之间的逻辑连贯
  • 为提高表达清晰度,在适当情况下使用主动语态

简洁:

  • 删除冗余的词语和短语
  • 尽量使用较短的句子(平均 15–20 个单词)
  • 删除不必要的限定词
  • 严格遵守字数限制

准确:

  • 使用适当的精度报告精确数值
  • 全文使用一致的术语
  • 区分观察结果与解释
  • 适当说明不确定性

客观:

  • 不带偏见地呈现结果
  • 避免夸大研究发现或其意义
  • 承认相互矛盾的证据
  • 保持专业、中立的语气
7. 写作流程:从提纲到完整段落

重要:始终使用完整段落写作,切勿在科学论文中提交项目符号列表。

科学论文必须以完整、流畅的散文形式撰写。采用以下两阶段方法,有效完成写作:

阶段 1:创建包含要点的章节提纲

开始撰写新章节时:

  1. 使用 research-lookup 技能搜集相关文献和数据
  2. 创建结构化提纲,用项目符号标出:
    • 要阐述的主要论点或研究发现
    • 要引用的关键研究
    • 要纳入的数据点和统计信息
    • 逻辑脉络和组织结构
  3. 这些项目符号是写作的脚手架,不是最终稿件

提纲示例(引言部分):

- Background: AI in drug discovery gaining traction
  * Cite recent reviews (Smith 2023, Jones 2024)
  * Traditional methods are slow and expensive
- Gap: Limited application to rare diseases
  * Only 2 prior studies (Lee 2022, Chen 2023)
  * Small datasets remain a challenge
- Our approach: Transfer learning from common diseases
  * Novel architecture combining X and Y
- Study objectives: Validate on 3 rare disease datasets

阶段 2:将要点扩展为完整段落

提纲完成后,将每个要点扩展为规范的散文:

  1. 将项目符号转换为完整句子,补全主语、谓语和宾语
  2. 在句子和观点之间添加过渡(然而、此外、相比之下、随后)
  3. 自然地在句子中融入引文,而不是将其列成清单
  4. 补充项目符号中省略的背景和解释
  5. 确保段落内句与句之间逻辑连贯
  6. 变换句式结构,保持读者的阅读兴趣

扩展示例:

Artificial intelligence approaches have gained significant traction in drug discovery 
pipelines over the past decade (Smith, 2023; Jones, 2024). While these computational 
methods show promise for accelerating the identification of therapeutic candidates, 
traditional experimental approaches remain slow and resource-intensive, often requiring 
years of laboratory work and substantial financial investment. However, the application 
of AI to rare diseases has been limited, with only two prior studies demonstrating 
proof-of-concept results (Lee, 2022; Chen, 2023). The primary obstacle has been the 
scarcity of training data for conditions affecting small patient populations. 

To address this challenge, we developed a transfer learning approach that leverages 
knowledge from well-characterized common diseases to predict therapeutic targets for 
rare conditions. Our novel neural architecture combines convolutional layers for 
molecular feature extraction with attention mechanisms for protein-ligand interaction 
modeling. The objective of this study was to validate our approach across three 
independent rare disease datasets, assessing both predictive accuracy and biological 
interpretability of the results.

提纲与最终文本的主要区别:

提纲(规划阶段)最终稿件
项目符号和不完整片段完整句子和段落
电报式笔记带有背景信息的完整解释
引文清单融入散文中的引文
简略观点通过过渡展开的论证
仅供自己查看用于发表和同行评审

应避免的常见错误:

  • ❌ 切勿在最终稿件中保留项目符号
  • ❌ 切勿在应使用段落的地方提交列表
  • ❌ 不要在结果或讨论部分使用编号列表或项目符号列表(研究假设或纳入标准等特定情况除外)
  • ❌ 不要写不完整的句子或未表达完整的想法
  • ✅ 仅在方法部分偶尔使用列表(例如纳入/排除标准、材料清单)
  • ✅ 确保每个章节都由连贯的散文组成
  • ✅ 大声朗读段落,检查行文是否自然流畅

可以使用列表的情况(有限情况):

科学论文中仅可在特定情境下使用列表:

  • 方法:纳入/排除标准、材料和试剂、参与者特征
  • 补充材料:扩展版方案、设备清单、详细参数
  • 切勿在以下部分使用:摘要、引言、结果、讨论、结论

摘要格式规则:

  • ❌ 绝不要使用带标签的章节(背景:、方法:、结果:、结论:)
  • ✅ 始终采用流畅的段落形式,并使用自然的过渡
  • 例外:仅当期刊在作者指南中明确要求时,才使用结构化格式

与 Research Lookup 的结合:

research-lookup 技能对于阶段 1(创建提纲)至关重要:

  1. 使用 research-lookup 搜索相关论文
  2. 提取关键发现、方法和数据
  3. 将发现整理为提纲中的项目符号
  4. 然后在阶段 2 将提纲扩展为完整段落

这一两阶段流程可确保你:

  • 系统地搜集和整理信息
  • 在写作前构建合理的结构
  • 写出润色完善、可供发表的散文
  • 保持叙述脉络连贯
8. 专业报告排版(非期刊文档)

对于研究报告、技术报告、白皮书及其他非期刊论文类专业文档,请使用 scientific_report.sty LaTeX 样式包,打造精致、专业的外观。

何时使用专业报告排版:

  • 研究报告和技术报告
  • 白皮书和政策简报
  • 资助报告和进度报告
  • 行业报告和技术文档
  • 内部研究摘要
  • 可行性研究和项目交付成果

何时不使用(改用特定投稿机构的排版格式):

  • 期刊论文 → 使用 venue-templates 技能
  • 会议论文 → 使用 venue-templates 技能
  • 学位论文 → 使用机构模板

scientific_report.sty 样式包提供:

特性描述
字体排版Helvetica 字体系列,呈现现代、专业的外观
配色方案专业的蓝色、绿色和点缀色
盒状环境用于突出关键发现、方法、建议和局限性的彩色框
表格交替行颜色和专业表头
图统一的标题格式
科学命令用于 p 值、效应量和置信区间的快捷命令

用于组织内容的盒状环境:

% Key findings (blue) - for major discoveries
\begin{keyfindings}[Title]
Content with key findings and statistics.
\end{keyfindings}

% Methodology (green) - for methods highlights
\begin{methodology}[Study Design]
Description of methods and procedures.
\end{methodology}

% Recommendations (purple) - for action items
\begin{recommendations}[Clinical Implications]
\begin{enumerate}
    \item Specific recommendation 1
    \item Specific recommendation 2
\end{enumerate}
\end{recommendations}

% Limitations (orange) - for caveats and cautions
\begin{limitations}[Study Limitations]
Description of limitations and their implications.
\end{limitations}

专业表格排版:

\begin{table}[htbp]
\centering
\caption{Results Summary}
\begin{tabular}{@{}lccc@{}}
\toprule
\textbf{Variable} & \textbf{Treatment} & \textbf{Control} & \textbf{p} \\
\midrule
Outcome 1 & \meansd{42.5}{8.3} & \meansd{35.2}{7.9} & <.001\sigthree \\
\rowcolor{tablealt} Outcome 2 & \meansd{3.8}{1.2} & \meansd{3.1}{1.1} & .012\sigone \\
Outcome 3 & \meansd{18.2}{4.5} & \meansd{17.8}{4.2} & .58\signs \\
\bottomrule
\end{tabular}

{\small \siglegend}
\end{table}

科学记号命令:

命令输出用途
\pvalue{0.023}p = 0.023P 值
\psig{< 0.001}p = < 0.001显著的 p 值(粗体)
\CI{0.45}{0.72}95% CI [0.45, 0.72]置信区间
\effectsize{d}{0.75}d = 0.75效应量
\samplesize{250}n = 250样本量
\meansd{42.5}{8.3}42.5 ± 8.3均值和标准差
\sigone、\sigtwo、\sigthree、、显著性星号

快速入门:

\documentclass[11pt,letterpaper]{report}
\usepackage{scientific_report}

\begin{document}
\makereporttitle
    {Report Title}
    {Subtitle}
    {Author Name}
    {Institution}
    {Date}

% Your content with professional formatting
\end{document}

编译:使用 XeLaTeX 或 LuaLaTeX,以正确渲染 Helvetica 字体:

xelatex report.tex

完整文档请参阅:

  • assets/scientific_report.sty:样式包
  • assets/scientific_report_template.tex:完整模板示例
  • assets/REPORT_FORMATTING_GUIDE.md:快速参考指南
  • references/professional_report_formatting.md:完整排版指南
9. 期刊专用排版

根据期刊要求调整论文:

  • 遵循作者指南中的结构、篇幅和格式要求
  • 使用期刊专用的引用格式
  • 满足图表规范(分辨率、文件格式、尺寸)
  • 包含必需声明(资金来源、利益冲突、数据可用性、伦理审批)
  • 遵守各章节的字数限制
  • 提供模板时,按照模板要求排版
10. 领域专用语言和术语

调整语言、术语和惯例,以符合特定科学领域的要求。每个领域都有既定词汇、偏好表达和领域专用惯例,体现专业知识,并确保目标受众能够清晰理解。

识别领域专用语言惯例:

  • 查阅目标期刊近期高影响力论文中使用的术语
  • 留意领域专用缩写、单位和记号系统
  • 确定首选术语(例如,“参与者”还是“受试者”,“化合物”还是“药物”,“标本”还是“样本”)
  • 观察对方法、生物体或技术的常见描述方式 生物医学与临床科学:
  • 使用准确的解剖学和临床术语(例如,在正式写作中使用“心肌梗死”,而非“心脏病发作”)
  • 遵循标准化疾病命名法(ICD、DSM、SNOMED-CT)
  • 指明药物名称时优先使用通用名,必要时在括号中注明商品名
  • 临床研究中使用“患者”,社区研究中使用“参与者”
  • 遵循人类基因组变异学会(HGVS)的遗传变异命名法
  • 使用标准单位报告实验室数值(大多数国际期刊使用 SI 单位)

分子生物学与遗传学:

  • 基因符号使用斜体(例如,TP53),蛋白质使用常规字体(例如,p53)
  • 遵循物种特异性的基因命名法(人类基因使用大写:BRCA1;小鼠基因使用句首大写形式:Brca1)
  • 首次提及时写出完整的生物体名称,之后使用公认的缩写(例如,Escherichia coli,之后使用 E. coli)
  • 使用标准遗传学记法(例如,用 +/+、+/-、-/- 表示基因型)
  • 使用分子技术的规范术语(例如,使用“定量 PCR”或“qPCR”,而非“实时 PCR”)

化学与药学:

  • 遵循 IUPAC 化学化合物命名法
  • 新型化合物使用系统名称,广为人知的物质使用常用名称
  • 使用标准记法注明化学结构(例如,数据库中使用 SMILES、InChI)
  • 使用适当的单位报告浓度(mM、μM、nM 或 % w/v、v/v)
  • 使用公认的反应命名法描述合成路线
  • 按照领域定义一致使用“生物利用度”“药代动力学”“IC50”等术语

生态学与环境科学:

  • 使用双名法标注物种(斜体:Homo sapiens)
  • 首次提及物种时,在适用情况下注明分类学命名人
  • 使用标准化的栖息地和生态系统分类
  • 统一使用生态学指标术语(例如,“物种丰富度”“Shannon 多样性指数”)
  • 使用领域标准术语描述采样方法(例如,“样带”“样方”“标记重捕”)

物理学与工程学:

  • 统一使用 SI 单位,除非领域惯例另有规定
  • 使用物理量的标准记法(标量与向量、张量)
  • 使用已确立的现象术语(例如,“量子纠缠”“层流”)
  • 在适用情况下注明设备型号和制造商
  • 使用符合领域标准的数学记法(例如,用 ℏ 表示约化普朗克常数)

神经科学:

  • 使用标准化的脑区命名法(例如,参考 Allen Brain Atlas 等图谱)
  • 使用公认的立体定位系统注明脑区坐标
  • 遵循神经科学术语惯例(例如,在正式写作中使用“动作电位”,而非“尖峰”)
  • 根据测量方法恰当使用“神经活动”“神经元放电”“脑激活”等术语
  • 准确具体地描述记录技术(例如,“全细胞膜片钳”“细胞外记录”)

社会与行为科学:

  • 适当时使用以人为先的表述(例如,使用“患有精神分裂症的人”,而非“精神分裂症患者”)
  • 使用标准化的心理学构念和经过验证的评估名称
  • 遵循 APA 关于减少语言偏见的指南
  • 使用公认术语指明理论框架
  • 人体研究中使用“参与者”,而非“受试者”

一般原则:

匹配读者的专业水平:

  • 对于专业期刊:可自由使用领域专属术语,仅定义高度专业或新颖的术语
  • 对于广泛影响力的期刊(例如,Nature、Science):定义更多技术术语,并为专业概念提供背景说明
  • 对于跨学科读者:兼顾准确性与易懂性,并在术语首次出现时予以定义 有策略地定义技术术语:
  • 首次使用缩写时给出全称:“信使 RNA(mRNA)”
  • 面向更广泛的受众写作时,简要解释专业技术
  • 避免过度解释目标受众熟悉的术语(这会让人觉得你不熟悉该领域)
  • 如果无法避免使用大量专业术语,请创建术语表

保持一致:

  • 同一概念始终使用同一术语(不要在“药物”“药品”和“药剂”之间来回切换)
  • 采用一致的缩写规则(首次定义后,决定使用“PCR”还是“聚合酶链式反应”)
  • 全文采用同一套命名规则(尤其是基因、物种和化学物质)

避免跨领域术语误用:

  • 不要在基础科学研究中使用临床术语(例如,不要把小鼠称为“患者”)
  • 避免用口语或过于宽泛的词语代替精准的领域术语
  • 不要从相邻领域引入术语,除非确认其用法正确

核实术语用法:

  • 查阅特定领域的风格指南和命名资源
  • 查看目标期刊近期论文中术语的用法
  • 使用领域专用数据库和本体(例如 Gene Ontology、MeSH 术语)
  • 如不确定,可引用一篇确立该术语用法的重要文献
11. 应避免的常见问题

导致拒稿的主要原因:

  1. 统计分析不恰当、不完整或描述不充分
  2. 过度解读结果或得出缺乏依据的结论
  3. 方法描述不充分,影响研究的可重复性
  4. 样本量过小、存在偏倚或选择不当
  5. 写作质量差或文本难以理解
  6. 文献综述或背景交代不足
  7. 图表不清晰或设计不佳
  8. 未遵循报告指南

写作质量问题:

  • 时态混用不当(方法和结果使用过去时,公认事实使用现在时)
  • 行话过多或缩写未定义
  • 段落划分打断逻辑连贯性
  • 章节之间缺少过渡
  • 符号或术语使用不一致

手稿撰写工作流

阶段 1:规划

  1. 确定目标期刊并查看作者指南
  2. 确定适用的报告指南(CONSORT、STROBE 等)
  3. 拟定手稿结构(通常为 IMRAD)
  4. 规划图表,将其作为论文的骨架

阶段 2:起草(每个部分采用两阶段写作流程)

  1. 从图表开始(研究核心数据的呈现)
  2. 对下文的每个部分,遵循两阶段流程:
    • 第一步:使用 research-lookup 创建项目符号大纲
    • 第二步:将项目符号扩写为流畅的完整段落
  3. 撰写方法(通常最容易先起草)
  4. 起草结果(客观描述图表)
  5. 撰写讨论(解读研究发现)
  6. 撰写引言(引出研究问题)
  7. 撰写摘要(概括完整研究内容)
  8. 拟定标题(简洁且具有描述性)

请记住:项目符号仅用于规划——最终手稿必须采用完整段落。

阶段 3:修改

  1. 检查全文逻辑连贯性及“主线”
  2. 核实术语和符号的一致性
  3. 确保图表能够自我说明
  4. 确认遵循了报告指南
  5. 核实所有引文准确无误且格式正确
  6. 检查各部分的字数
  7. 校对语法、拼写和清晰度

阶段 4:最终准备

  1. 按照期刊要求排版
  2. 准备补充材料
  3. 撰写突出研究重要性的投稿附信
  4. 完成投稿检查清单
  5. 收集所有必需的声明和表格

与其他科学技能集成

此技能可与以下技能有效配合:

  • 数据分析技能:用于生成待报告的结果
  • 统计分析:用于确定合适的统计呈现方式
  • 文献综述技能:用于为研究提供背景
  • 图表创建工具:用于制作达到出版质量的可视化图表
  • Venue-templates 技能:用于适配特定发表场合的写作风格和格式(期刊论文)
  • scientific_report.sty:用于专业报告、白皮书和技术文档
专业报告与期刊论文

选择合适的格式方案:

文档类型格式方案
期刊论文使用 venue-templates 技能
会议论文使用 venue-templates 技能
研究报告使用 scientific_report.sty(此技能)
白皮书使用 scientific_report.sty(此技能)
技术报告使用 scientific_report.sty(此技能)
资助报告使用 scientific_report.sty(此技能)
特定发表场合的写作风格

为特定发表场合撰写内容前,请查阅 venue-templates 技能中的写作风格指南:

不同发表场合的写作要求差异很大:

  • Nature/Science:通俗易懂、以故事为导向、突出广泛意义
  • Cell Press:强调机制深度、图文摘要和要点
  • 医学期刊(NEJM、Lancet):结构化摘要、证据表述
  • ML 会议(NeurIPS、ICML):贡献要点、消融研究
  • CS 会议(CHI、ACL):特定领域的惯例

venue-templates 技能提供:

  • venue_writing_styles.md:主要风格对比
  • 特定发表场合的指南:nature_science_style.md、cell_press_style.md、medical_journal_styles.md、ml_conference_style.md、cs_conference_style.md
  • reviewer_expectations.md:各发表场合的审稿人关注点

工作流:先使用此技能了解科学写作的一般原则(IMRAD、清晰度、引文),再查阅 venue-templates,针对特定发表场合调整风格。

参考资料

此技能包含全面的参考文件,涵盖科学写作的具体方面:

  • references/imrad_structure.md:IMRAD 格式及各章节内容的详细指南
  • references/citation_styles.md:完整的引文格式指南(APA、AMA、Vancouver、Chicago、IEEE)
  • references/figures_tables.md:制作有效数据可视化图表的最佳实践
  • references/reporting_guidelines.md:针对不同研究的报告标准和核对清单
  • references/writing_principles.md:有效科学交流的核心原则
  • references/professional_report_formatting.md:使用 scientific_report.sty 设置专业报告样式的指南

资源

此技能包含用于专业报告排版的 LaTeX 样式包和模板:

  • assets/scientific_report.sty:专业 LaTeX 样式包,包含 Helvetica 字体、彩色框和美观的表格
  • assets/scientific_report_template.tex:完整的报告模板,展示了所有样式功能
  • assets/REPORT_FORMATTING_GUIDE.md:样式包的快速参考指南

scientific_report.sty 的主要功能:

  • Helvetica 字体系列,呈现现代、专业的外观
  • 专业配色方案(蓝色、绿色、橙色、紫色)
  • 框环境:keyfindings、methodology、resultsbox、recommendations、limitations、criticalnotice、definition、executivesummary、hypothesis
  • 采用交替行颜色和专业表头的表格
  • 用于 p 值、效应量、置信区间的科学记数法命令
  • 专业的页眉和页脚

如需了解特定发表渠道的写作风格(语气、文风、摘要格式、审稿人期望),请参阅 venue-templates 技能,其中提供了 Nature/Science、Cell Press、医学期刊、ML 会议和 CS 会议的全面风格指南。

在撰写科学内容时,根据具体需求加载这些参考资料。

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