Extreme P Value MCP Server

Extreme P-value MCP サーバー

概要

この MCP サーバーは、R スクリプト extreme-P.R で実装された極端な p 値の計算関数（z、t、F、カイ二乗、SAIGE）への API インターフェースを Python 経由で提供します。

• Wald を除き、R スクリプト extreme-P.R に強く依存します。
• pyper を使用して、Python から R を呼び出します。
• API サーバーは FastMCP で構築されています。
• extreme_p_helper.py は R 関数を 1 対 1 でラップするものです。
• server.py は API エンドポイントを提供します。

ステータス

🚧 開発中 🚧

このプロジェクトは現在開発中です。API や機能は予告なく変更される場合があります。

依存関係

• uv
• pyper
• fastmcp
• mcp[cli]

ディレクトリ構成

+.
├── server.py              # Main FastMCP server
├── extreme_p_helper.py    # R function wrapper
├── extreme-P.R            # R script for extreme p-value calculation (see acknowledgements)
├── pyproject.toml         # Dependencies
└── README.md              # This document

セットアップと実行

MCP サーバーを MCP サーバーリストに追加する（Claude、Cursor など）

{
    "mcpServers": {
      "ExtremeP": {
        "command": "uv",
        "args": ["--directory", "where you cloned the repo", "run", "server.py"],
        "env": {}
      }
    }
}

MCP Inspector を実行する

# Install dependencies
uv sync

# Run MCP Inspector
uv --directory ./ run mcp dev server.py

MCP サーバーを実行する

# Install dependencies
uv sync

# Run the MCP server
uv run server.py

例：Python から使用する（MCP サーバーとして実行しない場合）

from extreme_p_helper import ExtremePHelper
helper = ExtremePHelper()
result = helper.pvalue_extreme_z(10)
print(result)  # {'mantissa': ..., 'exponent': ...}

ライセンス

この MCP サーバーは Apache License 2.0 の下で公開されています。

謝辞

• skoyamamd および carbocation
• pyper
• FastMCP