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Scispot MCP Server

Claude を Scispot のラボワークスペースに接続します。自然言語で、Labsheet の検索、ELN 実験の管理、プロトコル、ドキュメント、保管場所、マニフェストなどを操作できます。

説明

Scispot MCP Server は、Scispot のラボ運用システムを Claude などの AI アシスタントと連携するリモート Model Context Protocol（MCP）サーバーです。Labsheet データ管理、電子実験ノート（ELN）の操作、在庫・保管場所の検索、Labflow サンプル追跡にわたる 27 種類のツールを提供します。このサーバーは AWS Lambda 関数として実行され、PKCE を使用した OAuth 2.0 で認証します。

機能

• Labsheet 管理 — Labsheet の行の一覧表示、検索、フィルタリング、スキーマの確認、データの追加と更新、フォルダーによる整理を行います。
• ELN 実験 — 実験の一覧表示、読み取り、作成、コンテンツの書き込みを行い、追跡可能性のために Labsheet の行をリンクします。
• ELN プロトコル — プロトコルの一覧表示、読み取り、作成を行い、構造化コンテンツ（テキスト、セクション、ファイル、画像）を書き込みます。Labsheet の行もリンクできます。
• ELN ドキュメント — ドキュメント項目の一覧表示、読み取り、作成、書き込みを行い、Labsheet の行をリンクします。
• 保管場所と在庫 — 保管場所（フリーザー、部屋、キャビネット）を閲覧し、ID またはバーコードからマニフェスト（プレート、ボックス、ラック）を取得します。
• Labflow — 下流分析用に、Labflow に関連付けられたサンプル UUID を一覧表示します。
• Labspace — ELN ナビゲーションの入口として、利用可能なすべての Labspace を見つけます。

セットアップ

Claude web app（Anthropic MCP Directory）

ブラウザー版 Claude（claude.ai）を使用する場合は、以下の手順に従ってください。Claude Code ではありません。

1. Anthropic MCP Directory にアクセスします
2. Scispot を見つけて接続します
3. Scispot API キーを使用して OAuth 認証を完了します
4. Claude を通じてワークスペースの操作を開始します

Claude Code（ターミナル）

ターミナルから、Scispot API キーを使用してリモート MCP サーバーを Claude Code に登録します。

claude mcp add scispot https://mcp.scispot.io/ --transport http --header "Authorization: Bearer YOUR_SCISPOT_API_KEY"

YOUR_SCISPOT_API_KEY を実際の API キーに置き換えてください。新しいサーバーを認識させるため、プロンプトが表示された場合は Claude Code を再起動するか、MCP 設定を再読み込みしてください。

認証

このサーバーでは、PKCE（S256）を使用した OAuth 2.0 認証が必要です。接続フローでは、次のように処理されます。

• Scispot API キーをクライアントシークレットとして入力するよう求められます
• API キーは Scispot API リクエストの Bearer トークンとしてのみ使用されます
• サーバー上の永続ストレージに認証情報が保存されることはありません
• 認可コードは 5 分以内に有効期限が切れます

API アクセス権のある有効な Scispot アカウントが必要です。API キーが必要な場合は、Scispot 管理者にお問い合わせください。

使用例

例 1：Labsheet データを確認して検索する

ユーザーのプロンプト：「ワークスペース内のすべての Labsheet を表示し、次に「Cell Lines」Labsheet のスキーマを確認して、Status 列が「Active」と等しい行を検索してください。」

処理内容：

• サーバーは list_labsheets を呼び出し、利用可能なすべての Labsheet を返します
• サーバーは「Cell Lines」に対して get_labsheet_schema を呼び出し、列名と型を確認します
• サーバーは Status 列の必須フィルターを指定して search_labsheet_rows を呼び出します
• すべての列データとともに、一致する行を返します

例 2：実験を作成してプロトコルの概要を書き込む

ユーザーのプロンプト：「『Protein Lab』Labspace に『Western Blot Optimization Round 3』という新しい実験を作成し、次に使用するプロトコル手順の概要を書き込んでください。」

処理内容：

• サーバーは list_labspaces を呼び出し、「Protein Lab」が存在することを確認して、その場所を取得します
• サーバーは名前と場所を指定して create_experiment_stub を呼び出します
• サーバーは write_to_experiment を呼び出し、プロトコルの概要を HTML コンテンツとして追記します
• 新しい実験の詳細とともに、完了を確認するメッセージを返します

例 3：Labsheet のサンプルを、構造化コンテンツを含むプロトコルにリンクする

ユーザープロンプト：「『Reagent Inventory』Labsheet で Lot Number が『LOT-2025-001』のサンプルをすべて検索し、『QC Lab』Labspace の『Sample Preparation v2』プロトコルにリンクして、リンクしたサンプルを記録する構造化セクションをプロトコルに追加してください。」

処理内容：

• サーバーが search_labsheet_rows を呼び出し、「Reagent Inventory」で一致する行を検索します
• サーバーが link_labsheet_to_protocol を呼び出し、行とプロトコル間のトレーサビリティリンクを作成します
• サーバーが content_type='json' と、セクション見出しおよびテキストの説明を含む構造化要素の配列を指定して write_to_protocol を呼び出します
• リンクした行と更新されたプロトコルの内容を確認するメッセージを返します

例 4：保管場所を参照してマニフェストを取得する

ユーザープロンプト：「ワークスペース内のすべての保管場所を表示し、次にバーコード『PLT-00142』のマニフェストを検索してください。」

処理内容：

• サーバーが list_locations を呼び出し、ルートレベルのすべての保管場所（フリーザー、部屋、キャビネット）を返します
• サーバーがバーコードを指定して get_manifest を呼び出し、すべてのウェルまたはスロットを含むプレート／コンテナーの詳細を取得します
• サンプルの位置を含むマニフェストの全レイアウトを返します

例 5：ELN の構造をたどり、ドキュメントを読む

ユーザープロンプト：「すべての Labspace を一覧表示し、次に『Genomics』Labspace のプロトコルを表示して、『DNA Extraction SOP』プロトコルの全文を読んでください。」

処理内容：

• サーバーが list_labspaces を呼び出し、利用可能な Labspace を確認します
• サーバーが場所として「Genomics」を指定して list_protocols を呼び出し、すべてのプロトコルを一覧表示します
• サーバーが名前で get_protocol を呼び出し、プロトコルの全文を取得します
• 書式設定を含むプロトコルの全文を返します

利用可能なツール

読み取り専用ツール（16）

ツール	説明
list_labsheets	ワークスペース内のすべての Labsheet を一覧表示します
get_labsheet_schema	Labsheet の列定義を取得します
search_labsheet_rows	Labsheet の行を検索および絞り込みます
get_labsheet_row	UUID を指定して単一の行を取得します
list_labsheet_folders	フォルダー内のフォルダーまたは Labsheet を一覧表示します
list_labspaces	すべての ELN Labspace を一覧表示します
list_experiments	場所内の実験を一覧表示します
get_experiment	実験の全内容を取得します
list_protocols	場所内のプロトコルを一覧表示します
get_protocol	プロトコルの全内容を取得します
list_documentations	場所内のドキュメント項目を一覧表示します
get_documentation	ドキュメントの全内容を取得します
list_locations	ルートレベルの保管場所を一覧表示します
get_manifest	hrid、uuid、またはバーコードを指定してマニフェストを取得します
list_labflow_samples	Labflow のサンプル UUID を一覧表示します
get_image_thumbnail	行の画像サムネイルをダウンロードします

書き込みツール（11）

ツール	破壊的操作	説明
add_labsheet_rows	いいえ	Labsheet に新しい行を追加します
update_labsheet_rows	はい	既存の行の値を上書きします
create_experiment_stub	いいえ	空の実験を作成します
write_to_experiment	はい	実験にコンテンツを追加または先頭に挿入します
create_protocol_stub	いいえ	空のプロトコルを作成します
write_to_protocol	はい	テキスト、構造化 JSON、または画像をプロトコルに書き込みます
create_documentation_stub	いいえ	空のドキュメント項目を作成します
write_to_documentation	はい	ドキュメントにコンテンツを追加または先頭に挿入します
link_labsheet_to_experiment	いいえ	Labsheet の行を実験にリンクします
link_labsheet_to_protocol	いいえ	Labsheet の行をプロトコルにリンクします
link_labsheet_to_documentation	いいえ	Labsheet の行をドキュメントにリンクします

プライバシーポリシー

この MCP サーバーは、Scispot ワークスペースに対してリクエストされた操作を実行するために必要なデータのみを処理します。会話データは収集も保存もされません。

プライバシーに関する詳細は、プライバシーポリシーをご覧ください：https://www.scispot.com/legal/privacy-policy

Support

• Email: [email protected]
• API Documentation: https://docs.scispot.com/
• Website: https://www.scispot.com