mosaic for drug target intelligence

mosaic-mcp

MCP サーバーとして提供する前臨床の創薬標的インテリジェンス：標的プロファイル、 化合物、文献、構造、臨床パイプライン、検証実績、未開拓領域の分析を扱う 11 個のツール（無料 5 個、Pro 6 個）です。すべての件数にカバレッジ状態が付くため、 「調査していない」ことがゼロとして表示されることはありません。

どちらをお望みですか？

このパッケージはデータベースを独自に用意する必要があります。 提供するのは MCP ツールレイヤーのみで、 クエリは含まれますが、データは含まれません。Mosaic スキーマを備えた、ご自身が管理する PostgreSQL インスタンスを 指定すると、そのデータベース上でツールを提供します。Mosaic のナレッジグラフには、 一般公開の読み取り専用認証情報はありません。

Mosaic の厳選されたナレッジグラフをお望みの場合 — がん領域の標的 60 件、 それらに紐づく化合物約 128K 件、論文 57,896 件、臨床試験 9,062 件 （2026-10-07 時点の集計、毎月更新）をご利用いただくには、ホスト型サーバーをお使いください。 データベースもローカルへのインストールも不要です。

• Claude.ai コネクター（OAuth、Streamable HTTP）：https://mcp.getmosaic.dev/mcp
• API キーを使うリモート MCP（SSE）：https://mcp.getmosaic.dev/sse
• サインイン、API キー、人間の遺伝子を指定したオンデマンドのドシエ：https://getmosaic.dev

クイックスタート（セルフホスト）

pip install mosaic-mcp

Claude Desktop の場合

claude_desktop_config.json に追加します。

{
  "mcpServers": {
    "mosaic": {
      "command": "mosaic-mcp",
      "env": {
        "DATABASE_URL": "postgresql://USER:PASSWORD@YOUR-HOST:5432/mosaic_db?sslmode=require"
      }
    }
  }
}

Claude Code の場合

claude mcp add mosaic -- mosaic-mcp

スタンドアロンの場合

export DATABASE_URL="postgresql://..."   # your own Postgres
mosaic-mcp                               # stdio transport

uvx mosaic-mcp と python -m mosaic_mcp.server も使用できます。このパッケージは stdio 専用です。--transport sse は NotImplementedError で終了します。 リモートトランスポートは上記のホスト型サーバーをご利用ください。

ツール

無料（5 個）

ツール	返される内容
mosaic_get_target_profile	標的のドシエ：生物学的情報、承認済み薬剤と臨床薬剤、Open Targets による順位付け付きの疾患関連、検証エビデンス、組織、スコア。それぞれの軸にカバレッジ状態が付きます
mosaic_get_target_compounds	標的に対する活性が測定された化合物。sort で力価（デフォルト）または臨床試験の最大フェーズ順に並べ替えられます
mosaic_get_target_papers	標的に関する論文。データベースにアノテーションがある場合、NCBI Gene ID（PubTator3）で照合し、宣言されたコーパスのカットオフまでを返します
mosaic_get_target_structure	AlphaFold の構造スナップショットとポケット。信頼度の低い残基に囲まれたポケットには注意喚起が表示されます
mosaic_get_coverage_grid	任意のヒト遺伝子シンボルのカバレッジグリッド：ID（HGNC）と構造（AlphaFold DB）はライブで解決され、その他の軸は queued と表示されます

無料プランでは化合物または論文を最大 10 件、Pro では最大 50 件返します。

Pro（6 個）

ツール	返される内容
mosaic_clinical_pipeline	標的に作用する化合物の臨床試験（ChEMBL の作用機序リンク、または pChEMBL ≥ 6 に該当する化合物）
mosaic_target_validation	アッセイの実績：何がどのモデル系で試されたか
mosaic_pathway_context	標的が関与するパスウェイ
mosaic_target_network	標的の 1 ホップ近傍：化合物、疾患、パスウェイ、組織、相互作用タンパク質
mosaic_synthetic_lethal_whitespace	標的と機能的に結びつき、薬剤活性がほとんどないパートナー。評価済み候補と未評価パートナーは分けて扱われます
mosaic_resistance_bypass_map	薬剤耐性の回避や逃避に関わる候補標的

mosaic_request_dossier と mosaic_get_dossier（オンデマンドのドシエ）は ホスト型サーバーでのみ動作します。データ取得と統合のパイプラインが必要です。

設定

変数	必須	説明
DATABASE_URL	はい	ご自身の PostgreSQL インスタンスへの接続文字列です。パスには Mosaic スキーマを格納するデータベース名を指定する必要があります。
MOSAIC_TIER	いいえ	pro（または enterprise）を指定すると、セルフホスト環境で Pro ツールが有効になります。
MOSAIC_API_KEY	いいえ	stdio モードでは、値を問わず Pro として扱われ、ローカルでは検証されません。キーはホスト型サーバーで検証されます。

変更履歴

完全な履歴はCHANGELOG.mdを参照してください。最新バージョン：2.1.1 — mosaic-mcp コマンドが再び起動するようになりました（1.7.0 以降、ImportError が発生していました）。2.1.0 では mcp のバージョンを 2 未満に制限しました。これがないと、新規インストール時にインポートで失敗していました。また、ホストされたサーバーのライブ監査で見つかった問題への修正も含まれています。

ライセンス

MCP サーバーのツールには Apache 2.0 を適用しています。ホストされたナレッジグラフデータにアクセスして Pro ティアを利用するには、サブスクリプションが必要です。