Hgnc

mcp-hgnc

HGNC（HUGO Gene Nomenclature Committee）MCP。

Pipeworx の一部です。AI エージェントを1881以上のライブデータソースに接続するMCPゲートウェイです。これは独立した非公式の統合であり、上流プロバイダーとは提携、承認、公開のいずれもされていません。

ツール

ツール	説明
get_gene	公式HGNCシンボルを使って、承認済みのヒト遺伝子を完全一致検索します。承認名、遺伝子座の種類、染色体上の位置、別名／旧シンボル、遺伝子グループ、相互参照（Entrez、Ensembl、UniProt、OMIM、RefSeq、UCSC、CCDS）を含む、信頼できる完全なレコードを返します。名前の一部しかわからない場合や、正確なシンボルが不明な場合は、まず search_genes を使用してください。キー不要です。
search_genes	承認済みシンボル、名称、別名をあいまい検索します。例：「breast cancer」、「p53」、「tumor protein」。スコア順に並べた簡潔な検索結果（hgnc_id、symbol、関連度スコア）を返します。完全なレコードを取得するには、返されたシンボルを使って get_gene を呼び出してください。キー不要です。
resolve_xref	逆引き検索により、外部データベースIDを対応するHGNC遺伝子にマッピングします。「Entrez 672 はどの遺伝子ですか？」→ BRCA1。entrez_id、ensembl_gene_id、uniprot_ids、omim_id、refseq_accession、ucsc_id を受け付け、get_gene と同じ完全なレコードを返します。キー不要です。

クイックスタート

MCP クライアント（Claude Desktop、Cursor、Windsurf など）に追加します。

{
  "mcpServers": {
    "hgnc": {
      "url": "https://gateway.pipeworx.io/hgnc/mcp"
    }
  }
}

このエンドポイントが実際に提供するもの

https://gateway.pipeworx.io/hgnc/mcp の tools/list は、上の表にあるツールに加えて、共有の Pipeworx メタツール（ask_pipeworx、discover_tools、search_within、remember／recall など、ゲートウェイ全体で使える一連のツール）も返します。そのため、表示されるツール数はこの表より多くなります。現在、単一パックのエンドポイントには、そのパック固有のツールとともに、共有ツールがおよそ30個一覧表示されます。接続時の initialize レスポンスに正確な範囲が記載されており、その時点での正式な情報です。

これは意図的な設計であり、偶然の多重化ではありません。メタツールを使うと、このパックでは対応していない質問にも、カタログ全体を対象にルーティングする ask_pipeworx 経由で回答できます。そのため、2つ目のMCP サーバーを追加する必要はありません。現時点では、メタツールなしでパックのエンドポイントを接続する方法はありません。追加のスキーマによるコンテキスト消費がルーティングの利点を上回る場合は、複数のパックエンドポイントではなく、フルゲートウェイに一度接続してください。

または、フル Pipeworx ゲートウェイに接続すると、このパックのツールだけでなく、すべてのパックのツールが直接一覧表示されます。

{
  "mcpServers": {
    "pipeworx": {
      "url": "https://gateway.pipeworx.io/mcp"
    }
  }
}

どちらのURLも同じゲートウェイと同じ1881以上のデータソースに接続します。違いは、どのパックのツールが直接一覧表示されるかだけです。どちらからでも、ask_pipeworx を使ってすべてのツールにアクセスできます。

MCP クライアントをお持ちでない場合：HTTP で呼び出す

curl -X POST https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/hgnc_get_gene \
  -H 'Content-Type: application/json' \
  -d '{"symbol":"BRCA1"}'

最初の呼び出しにアカウントは不要です。ツールの詳細を確認するには、GET https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/hgnc_get_gene を使用します。ツールを探すには、{"query":"..."} を指定して POST https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/search_packs を使用します。

スタンドアロン（ゲートウェイアカウント不要）

このパッケージはローカルのstdio MCP サーバーとしても動作します。Pipeworx アカウントもゲートウェイ経由の通信も不要です。

{
  "mcpServers": {
    "hgnc": {
      "command": "npx",
      "args": ["-y", "@pipeworx/mcp-hgnc"]
    }
  }
}

または、起動を確認するには直接実行します。

npx -y @pipeworx/mcp-hgnc

stdin/stdout 経由でMCP通信を行い、このパックのツールのみを対象に initialize／tools/list／tools/call に応答します。上記のゲートウェイ接続で追加される共有メタツールは含まれません。同じソース、同じツールを使用しますが、ask_pipeworx によるルーティングはありません。

ask_pipeworx を使う

ツールを直接呼び出す代わりに、平易な英語で質問できます。上記のパックエンドポイントでも、フルゲートウェイでも利用できます。

ask_pipeworx({ question: "your question about Hgnc data" })

ゲートウェイが適切なツールを選び、引数を自動的に設定します。

詳細情報

• ドキュメントとガイド
• pipeworx.io

ライセンス

MIT