Idigbio

mcp-idigbio

iDigBio 生物多様性標本 MCP。

Pipeworx の一部です。AI エージェントを1881以上のライブデータソースにつなぐ MCP ゲートウェイです。独立した非公式の統合であり、上流プロバイダーとは提携しておらず、承認も受けていません。また、上流プロバイダーによって公開されたものでもありません。

ツール

ツール	説明
search_specimens	iDigBioを通じて、米国のコレクションにある約1億5000万件のデジタル化された自然史博物館の標本記録（植物、動物、化石）を検索します。分類と所在地を任意に組み合わせて絞り込めます。少なくとも1つのフィルターが必要です。キー不要です。
get_specimen	uuidで指定した単一のiDigBio標本について、正規化された全レコードを取得します。例：uuid "0746b188-c390-4ab1-bd20-5489a9c6c33c"（ピューマ・コンカラーの記録）。キー不要です。
count_by_field	iDigBio全体の標本数を、フィールドごとに分類して取得します（上位の値と件数）。分類や所在地のフィルターを指定して、集計範囲を絞ることもできます。キー不要です。

クイックスタート

MCP クライアント（Claude Desktop、Cursor、Windsurf など）に追加します。

{
  "mcpServers": {
    "idigbio": {
      "url": "https://gateway.pipeworx.io/idigbio/mcp"
    }
  }
}

このエンドポイントが実際に提供するもの

https://gateway.pipeworx.io/idigbio/mcp の tools/list は、上の表にあるツールに加えて、共有 Pipeworx メタツール（ask_pipeworx、discover_tools、search_within、remember／recall など、ゲートウェイ全体で使えるツール群）も返します。そのため、表示されるツール数はこの表より多くなります。現在、単一パックのエンドポイントでは、パック固有のツールとともに共有ツールが約30個表示されます。接続の initialize 応答には正確な範囲が記載され、その日の状況を確認する際の正式な情報源となります。

これは意図的な設計であり、偶然の多重化ではありません。メタツールを使えば、このパックが対応していない質問にも、カタログ全体を対象に振り分ける ask_pipeworx を通じて回答できるため、2つ目の MCP サーバーを追加する必要がありません。現時点では、メタツールなしでパックのエンドポイントをマウントする方法はありません。追加のスキーマがもたらすコンテキストコストがルーティングの利点を上回る場合は、複数のパックエンドポイントではなく、フルゲートウェイに一度接続してください。

このパックのツールだけでなく、すべてのパックのツールを直接一覧表示するには、Pipeworx のフルゲートウェイに接続してください。

{
  "mcpServers": {
    "pipeworx": {
      "url": "https://gateway.pipeworx.io/mcp"
    }
  }
}

どちらのURLも、同じゲートウェイと同じ1881以上のデータソースに接続します。違いは、どのパックのツールが直接一覧表示されるかだけです。どちらの接続からも ask_pipeworx ですべてのツールを利用できます。

MCP クライアントがない場合：HTTP経由で呼び出す

curl -X POST https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/search_specimens \
  -H 'Content-Type: application/json' \
  -d '{"scientific_name":"puma concolor","limit":10}'

最初の呼び出しにアカウントは不要です。任意のツールを確認するには、GET https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/search_specimens を実行します。ツールを探すには、{"query":"..."} を指定して POST https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/search_packs を実行します。

スタンドアロン（ゲートウェイアカウント不要）

このパッケージは、ローカルのstdio MCP サーバーとしても実行できます。Pipeworx アカウントも、ゲートウェイへの往復通信も不要です。

{
  "mcpServers": {
    "idigbio": {
      "command": "npx",
      "args": ["-y", "@pipeworx/mcp-idigbio"]
    }
  }
}

または、直接実行して起動を確認します。

npx -y @pipeworx/mcp-idigbio

stdin/stdout経由でMCPを通信し、initialize／tools/list／tools/call に対して、このパックのツールのみを提供します。上記のゲートウェイ接続で追加される共有メタツールはありません。同じソース、同じツールで、ask_pipeworxによるルーティングはありません。

ask_pipeworx と組み合わせて使う

ツールを直接呼び出す代わりに、自然な英語で質問できます。これは上記のパックエンドポイントでも、フルゲートウェイでも機能します。

ask_pipeworx({ question: "your question about Idigbio data" })

ゲートウェイが適切なツールを選び、引数を自動的に設定します。

その他

• ドキュメントとガイド
• pipeworx.io

ライセンス

MIT