Intact

mcp-intact

IntAct（EBI）の分子間相互作用データベース MCP。キー不要です。

Pipeworx の一部です。AI エージェントを1881以上のライブデータソースに接続する MCP ゲートウェイです。これは独立した非公式の連携であり、上流プロバイダーとの提携、承認、公開はありません。

ツール

ツール	説明
find_interactions	IntAct（EBI）の分子間相互作用データベースです。遺伝子／タンパク質（名前またはUniProt ID）に関するタンパク質間相互作用やその他の分子間相互作用を、検出方法、相互作用の種類、生物種、PubMed文献情報、MI信頼度スコアとともに検索します。キー不要です。
interaction_count	IntAct（EBI）です。遺伝子／タンパク質（名前またはUniProt ID）が持つ分子間相互作用の数をすばやく数えます。キー不要です。

クイックスタート

MCP クライアント（Claude Desktop、Cursor、Windsurf など）に追加します。

{
  "mcpServers": {
    "intact": {
      "url": "https://gateway.pipeworx.io/intact/mcp"
    }
  }
}

このエンドポイントが実際に提供するもの

https://gateway.pipeworx.io/intact/mcp の tools/list は、上の表にあるツールに加えて、共有 Pipeworx メタツール（ask_pipeworx、discover_tools、search_within、remember／recall など、ゲートウェイ全体で利用できるツール）も返します。そのため、表示されるツール数はこの表より多くなります。現在、単一パックのエンドポイントには、パック独自のツールとともに約30個の共有ツールが一覧表示されます。接続の initialize 応答には正確な範囲が示され、その日の時点での確定情報となります。

これは意図的な設計であり、偶然の多重化ではありません。メタツールを使うと、このパックが扱わない質問にも、カタログ全体を対象にルーティングする ask_pipeworx を通じて回答でき、MCP サーバーをもう1つ追加する必要がありません。現時点では、メタツールなしでパックのエンドポイントをマウントする方法はありません。追加のスキーマによるコンテキスト消費がルーティングのメリットを上回る場合は、複数のパックエンドポイントではなく、フルゲートウェイに一度接続してください。

または、Pipeworx のフルゲートウェイに接続すると、このパックだけでなく、すべてのパックのツールが直接一覧表示されます。

{
  "mcpServers": {
    "pipeworx": {
      "url": "https://gateway.pipeworx.io/mcp"
    }
  }
}

どちらのURLも、同じゲートウェイと同じ1881以上のデータソースに接続します。異なるのは、どのパックのツールが直接一覧表示されるかだけです。どちらからでも ask_pipeworx を使ってすべてのツールにアクセスできます。

MCP クライアントがない場合は、HTTP経由で呼び出す

curl -X POST https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/find_interactions \
  -H 'Content-Type: application/json' \
  -d '{"query":"EGFR_HUMAN"}'

最初の呼び出しにアカウントは必要ありません。ツールを確認するには、GET https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/find_interactions を実行します。検索するには、{"query":"..."} を指定して POST https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/search_packs を実行します。

スタンドアロン（ゲートウェイアカウント不要）

このパッケージはローカルのstdio MCP サーバーとしても実行できます。Pipeworxアカウントもゲートウェイへの往復通信も不要です。

{
  "mcpServers": {
    "intact": {
      "command": "npx",
      "args": ["-y", "@pipeworx/mcp-intact"]
    }
  }
}

または、直接実行して起動を確認します。

npx -y @pipeworx/mcp-intact

stdin/stdout経由でMCPを通信し、このパック独自のツールのみを対象に initialize／tools/list／tools/call に応答します。上記のゲートウェイ接続で追加される共有メタツールは含まれません。同じデータソース、同じツールで、ask_pipeworxによるルーティングはありません。

ask_pipeworx を使う

ツールを直接呼び出す代わりに、自然な英語で質問できます。上記のパックエンドポイントでも、フルゲートウェイでも利用できます。

ask_pipeworx({ question: "your question about Intact data" })

ゲートウェイが適切なツールを選び、引数を自動的に設定します。

詳細

• ドキュメントとガイド
• pipeworx.io

ライセンス

MIT